RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516122.1

RNU6-871P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 871, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-871P, Length 100 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-871P-201ENST00000516122 SLC25A38Q96DW6 304 aa-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-871P-201ENST00000516122 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-871P-201ENST00000516122 OR5M11Q96RB7 305 aa-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-871P-201ENST00000516122 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-871P-201ENST00000516122 HGH1Q9BTY7 390 aa-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-871P-201ENST00000516122 TEKT3Q9BXF9 490 aa-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-871P-201ENST00000516122 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-871P-201ENST00000516122 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-871P-201ENST00000516122 TRPV4Q9HBA0 871 aa-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-871P-201ENST00000516122 ASAH2Q9NR71 780 aa-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-871P-201ENST00000516122 SLC2A8Q9NY64 477 aa-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-871P-201ENST00000516122 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-871P-201ENST00000516122 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-871P-201ENST00000516122 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-871P-201ENST00000516122 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-871P-201ENST00000516122 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa-1.51□□□□□ -2.65
RNU6-871P-201ENST00000516122 PPIAL4EA0A075B759 164 aa-1.51□□□□□ -2.65
RNU6-871P-201ENST00000516122 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa-1.51□□□□□ -2.65
RNU6-871P-201ENST00000516122 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa-1.51□□□□□ -2.65
RNU6-871P-201ENST00000516122 PPIAL4DF5H284 164 aa-1.51□□□□□ -2.65
RNU6-871P-201ENST00000516122 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP-1.51□□□□□ -2.65
RNU6-871P-201ENST00000516122 PEX12O00623 359 aa-1.51□□□□□ -2.65
RNU6-871P-201ENST00000516122 PMM2O15305 246 aa-1.51□□□□□ -2.65
RNU6-871P-201ENST00000516122 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP-1.51□□□□□ -2.65
RNU6-871P-201ENST00000516122 PPIAL4FP0DN26 164 aa-1.51□□□□□ -2.65
RNU6-871P-201ENST00000516122 KRT13P13646 458 aa-1.51□□□□□ -2.65
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZNF250P15622 560 aa-1.51□□□□□ -2.65
RNU6-871P-201ENST00000516122 ACADLP28330 430 aa-1.51□□□□□ -2.65
RNU6-871P-201ENST00000516122 CD47Q08722 323 aa-1.51□□□□□ -2.65
RNU6-871P-201ENST00000516122 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP-1.51□□□□□ -2.65
RNU6-871P-201ENST00000516122 TRPC3Q13507 836 aa-1.51□□□□□ -2.65
RNU6-871P-201ENST00000516122 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP-1.51□□□□□ -2.65
RNU6-871P-201ENST00000516122 CA9Q16790 459 aa-1.51□□□□□ -2.65
RNU6-871P-201ENST00000516122 CCDC57Q2TAC2 916 aa-1.51□□□□□ -2.65
RNU6-871P-201ENST00000516122 PAGE2BQ5JRK9 111 aa-1.51□□□□□ -2.65
RNU6-871P-201ENST00000516122 OR4C11Q6IEV9 310 aa-1.51□□□□□ -2.65
RNU6-871P-201ENST00000516122 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP-1.51□□□□□ -2.65
RNU6-871P-201ENST00000516122 CFAP206Q8IYR0 622 aa-1.51□□□□□ -2.65
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZNF683Q8IZ20 524 aa-1.51□□□□□ -2.65
RNU6-871P-201ENST00000516122 DEFB119Q8N690 84 aa-1.51□□□□□ -2.65
RNU6-871P-201ENST00000516122 OR6Y1Q8NGX8 325 aa-1.51□□□□□ -2.65
RNU6-871P-201ENST00000516122 CFAP61Q8NHU2 1237 aa-1.51□□□□□ -2.65
RNU6-871P-201ENST00000516122 PIGBQ92521 554 aa-1.51□□□□□ -2.65
RNU6-871P-201ENST00000516122 PIK3R3Q92569 461 aa-1.51□□□□□ -2.65
RNU6-871P-201ENST00000516122 TMEM159Q96B96 161 aa-1.51□□□□□ -2.65
RNU6-871P-201ENST00000516122 TIFAQ96CG3 184 aa-1.51□□□□□ -2.65
RNU6-871P-201ENST00000516122 TNMDQ9H2S6 317 aa-1.51□□□□□ -2.65
RNU6-871P-201ENST00000516122 TLE6Q9H808 572 aa-1.51□□□□□ -2.65
RNU6-871P-201ENST00000516122 CHODLQ9H9P2 273 aa-1.51□□□□□ -2.65
RNU6-871P-201ENST00000516122 NOX3Q9HBY0 568 aa-1.51□□□□□ -2.65
RNU6-871P-201ENST00000516122 OBP2BQ9NPH6 170 aa-1.51□□□□□ -2.65
RNU6-871P-201ENST00000516122 ALKBH4Q9NXW9 302 aa-1.51□□□□□ -2.65
RNU6-871P-201ENST00000516122 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP-1.51□□□□□ -2.65
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZNF225Q9UK10 706 aa-1.51□□□□□ -2.65
RNU6-871P-201ENST00000516122 FBXO7Q9Y3I1 522 aa-1.51□□□□□ -2.65
RNU6-871P-201ENST00000516122 LTBP2Q14767 1821 aa-1.52□□□□□ -2.65
RNU6-871P-201ENST00000516122 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa-1.52□□□□□ -2.65
RNU6-871P-201ENST00000516122 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP-1.52□□□□□ -2.65
RNU6-871P-201ENST00000516122 C7orf66A4D0T2 115 aa-1.52□□□□□ -2.65
RNU6-871P-201ENST00000516122 PLEKHD1A6NEE1 506 aa-1.52□□□□□ -2.65
RNU6-871P-201ENST00000516122 PES1O00541 588 aaKnown RBP-1.52□□□□□ -2.65
RNU6-871P-201ENST00000516122 FBP2O00757 339 aa-1.52□□□□□ -2.65
RNU6-871P-201ENST00000516122 IMPA2O14732 288 aa-1.52□□□□□ -2.65
RNU6-871P-201ENST00000516122 MAGEB2O15479 319 aa-1.52□□□□□ -2.65
RNU6-871P-201ENST00000516122 NPIPB7O75200 414 aa-1.52□□□□□ -2.65
RNU6-871P-201ENST00000516122 SAP30O75446 220 aa-1.52□□□□□ -2.65
RNU6-871P-201ENST00000516122 SUPT7LO94864 414 aa-1.52□□□□□ -2.65
RNU6-871P-201ENST00000516122 NKX2-2O95096 273 aa-1.52□□□□□ -2.65
RNU6-871P-201ENST00000516122 MPZL1O95297 269 aa-1.52□□□□□ -2.65
RNU6-871P-201ENST00000516122 INSP01308 110 aa-1.52□□□□□ -2.65
RNU6-871P-201ENST00000516122 SBK2P0C263 348 aa-1.52□□□□□ -2.65
RNU6-871P-201ENST00000516122 ADRB3P13945 408 aa-1.52□□□□□ -2.65
RNU6-871P-201ENST00000516122 NPY1RP25929 384 aa-1.52□□□□□ -2.65
RNU6-871P-201ENST00000516122 GDI1P31150 447 aa-1.52□□□□□ -2.65
RNU6-871P-201ENST00000516122 ACSL1P33121 698 aa-1.52□□□□□ -2.65
RNU6-871P-201ENST00000516122 MNDAP41218 407 aa-1.52□□□□□ -2.65
RNU6-871P-201ENST00000516122 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP-1.52□□□□□ -2.65
RNU6-871P-201ENST00000516122 RAB27AP51159 221 aa-1.52□□□□□ -2.65
RNU6-871P-201ENST00000516122 ACVR1Q04771 509 aa-1.52□□□□□ -2.65
RNU6-871P-201ENST00000516122 DUSP5Q16690 384 aa-1.52□□□□□ -2.65
RNU6-871P-201ENST00000516122 COX19Q49B96 90 aa-1.52□□□□□ -2.65
RNU6-871P-201ENST00000516122 ELFN2Q5R3F8 820 aa-1.52□□□□□ -2.65
RNU6-871P-201ENST00000516122 FAM69AQ5T7M9 428 aa-1.52□□□□□ -2.65
RNU6-871P-201ENST00000516122 LIPJQ5W064 366 aa-1.52□□□□□ -2.65
RNU6-871P-201ENST00000516122 SULT6B1Q6IMI4 303 aa-1.52□□□□□ -2.65
RNU6-871P-201ENST00000516122 SLC24A5Q71RS6 500 aa-1.52□□□□□ -2.65
RNU6-871P-201ENST00000516122 COMMD2Q86X83 199 aa-1.52□□□□□ -2.65
RNU6-871P-201ENST00000516122 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP-1.52□□□□□ -2.65
RNU6-871P-201ENST00000516122 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP-1.52□□□□□ -2.65
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZNF671Q8TAW3 534 aa-1.52□□□□□ -2.65
RNU6-871P-201ENST00000516122 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP-1.52□□□□□ -2.65
RNU6-871P-201ENST00000516122 GOLGA1Q92805 767 aa-1.52□□□□□ -2.65
RNU6-871P-201ENST00000516122 FAM149B1Q96BN6 582 aa-1.52□□□□□ -2.65
RNU6-871P-201ENST00000516122 TMEM101Q96IK0 257 aa-1.52□□□□□ -2.65
RNU6-871P-201ENST00000516122 FAM210BQ96KR6 192 aa-1.52□□□□□ -2.65
RNU6-871P-201ENST00000516122 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP-1.52□□□□□ -2.65
RNU6-871P-201ENST00000516122 DOK1Q99704 481 aa-1.52□□□□□ -2.65
RNU6-871P-201ENST00000516122 TAOK3Q9H2K8 898 aa-1.52□□□□□ -2.65
RNU6-871P-201ENST00000516122 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP-1.52□□□□□ -2.65
RNU6-871P-201ENST00000516122 UBN1Q9NPG3 1134 aa-1.52□□□□□ -2.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 170.7 ms