RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000443528.5

ACTB-206, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 4

Gene ACTB, Length 569 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-206ENST00000443528 FAM227AF5H4B4 570 aa14.81□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 G3V2L1 256 aa14.81□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 PCDH17O14917 1159 aa14.81□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 SH3BGRLO75368 114 aa14.81□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 CLDN9O95484 217 aa14.81□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 HPP00738 406 aa14.81□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 PROCP04070 461 aa14.81□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 C8orf89P0DMQ9 161 aa14.81□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 KRT4P19013 534 aa14.81□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 TSPAN8P19075 237 aa14.81□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 HPDP32754 393 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 CRHR1P34998 444 aa14.81□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 PIK3CBP42338 1070 aa14.81□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 CCNG1P51959 295 aa14.81□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 CDH13P55290 713 aa14.81□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 HERVK_113P63132 956 aa14.81□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 IFFO1Q0D2I5 559 aa14.81□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 C19orf57Q0VDD7 668 aa14.81□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 PCOLCEQ15113 449 aa14.81□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 UNC50Q53HI1 259 aa14.81□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 ZNF678Q5SXM1 525 aa14.81□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 DEPDC1Q5TB30 811 aa14.81□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 TRIM40Q6P9F5 258 aa14.81□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 ASB18Q6ZVZ8 466 aa14.81□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 PARP9Q8IXQ6 854 aa14.81□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 C4orf33Q8N1A6 199 aa14.81□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 PLPP5Q8NEB5 264 aa14.81□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 ATP6V1E2Q96A05 226 aa14.81□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 CMTM7Q96FZ5 175 aa14.81□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 VPS50Q96JG6 964 aa14.81□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 TMEM237Q96Q45 408 aa14.81□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 ERVK-6Q9BXR3 956 aa14.81□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 ZNF700Q9H0M5 742 aa14.81□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 OR51B5Q9H339 312 aa14.81□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 ZNF160Q9HCG1 818 aa14.81□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 DMRT3Q9NQL9 472 aa14.81□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 GPR83Q9NYM4 423 aa14.81□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 LGALS13Q9UHV8 139 aa14.81□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 ADGRE2Q9UHX3 823 aa14.81□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 PLAAQ9Y263 795 aa14.81□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 NUP210LQ5VU65 1888 aa14.8□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 MAGEB17A8MXT2 336 aa14.8□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 B8ZZF3 427 aa14.8□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 RTCAO00442 366 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 PLIN3O60664 434 aa14.8□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 B4GALT2O60909 372 aa14.8□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 RNH1P13489 461 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 IMPDH1P20839 514 aa14.8□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 CERS1P27544 350 aa14.8□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 CCT5P48643 541 aa14.8□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 NEK2P51955 445 aa14.8□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 PGDP52209 483 aa14.8□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 PRKAA2P54646 552 aa14.8□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 MTTPP55157 894 aa14.8□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 BTG2P78543 158 aa14.8□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 MYBPC3Q14896 1274 aa14.8□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 TMEM35AQ53FP2 167 aa14.8□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 FAM219BQ5XKK7 198 aa14.8□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 ZNF793Q6ZN11 406 aa14.8□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 CHSY3Q70JA7 882 aa14.8□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 NDUFAF7Q7L592 441 aa14.8□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 ANKRD37Q7Z713 158 aa14.8□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 TRABD2AQ86V40 505 aa14.8□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 OR4F6Q8NGB9 312 aa14.8□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 METTL21AQ8WXB1 218 aa14.8□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 TSLPQ969D9 159 aa14.8□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 SERINC2Q96SA4 455 aa14.8□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 TMEM109Q9BVC6 243 aa14.8□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 ZNF225Q9UK10 706 aa14.8□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 GRID1Q9ULK0 1009 aa14.8□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 BSNQ9UPA5 3926 aa14.8□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 A0A088AWK7 358 aa14.79□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa14.79□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa14.79□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 SAP18O00422 153 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 COPEO14579 308 aa14.79□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 B3GALT2O43825 422 aa14.79□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 SUPT7LO94864 414 aa14.79□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 TUBBP07437 444 aa14.79□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 JAK1P23458 1154 aa14.79□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 ITGA3P26006 1051 aa14.79□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 RPS13P62277 151 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 CLCQ05315 142 aa14.79□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 TGM3Q08188 693 aa14.79□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 ABRAXAS2Q15018 415 aa14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61 ms