RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495357.1

CCDC39-AS1-201, CCDC39 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CCDC39-AS1, Length 283 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
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CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PSMB7Q99436 277 aa3.52□□□□□ -1.85
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CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TERF2IPQ9NYB0 399 aa3.52□□□□□ -1.85
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ANAPC5Q9UJX4 755 aa3.52□□□□□ -1.85
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZNF840PA6NDX5 716 aa3.51□□□□□ -1.85
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 INPP4BO15327 924 aa3.51□□□□□ -1.85
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZNF749O43361 778 aa3.51□□□□□ -1.85
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 APOA4P06727 396 aa3.51□□□□□ -1.85
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LMO2P25791 158 aa3.51□□□□□ -1.85
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CAPZA1P52907 286 aa3.51□□□□□ -1.85
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PPA1Q15181 289 aa3.51□□□□□ -1.85
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 C9orf66Q5T8R8 295 aa3.51□□□□□ -1.85
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