RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000443528.5

ACTB-206, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 4

Gene ACTB, Length 569 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-206ENST00000443528 MLXIPLQ9NP71 852 aa14.85□□□□□ -0.03
ACTB-206ENST00000443528 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
ACTB-206ENST00000443528 MKL2Q9ULH7 1088 aa14.85□□□□□ -0.03
ACTB-206ENST00000443528 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa14.85□□□□□ -0.03
ACTB-206ENST00000443528 A0A0G2JN53 185 aa14.84□□□□□ -0.03
ACTB-206ENST00000443528 A6NL46 340 aa14.84□□□□□ -0.03
ACTB-206ENST00000443528 ERI3O43414 337 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
ACTB-206ENST00000443528 DLX3O60479 287 aa14.84□□□□□ -0.03
ACTB-206ENST00000443528 UGDHO60701 494 aa14.84□□□□□ -0.03
ACTB-206ENST00000443528 PDGFAP04085 211 aa14.84□□□□□ -0.03
ACTB-206ENST00000443528 RPS17P08708 135 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
ACTB-206ENST00000443528 KRT15P19012 456 aa14.84□□□□□ -0.03
ACTB-206ENST00000443528 PIK3CGP48736 1102 aa14.84□□□□□ -0.03
ACTB-206ENST00000443528 BTN3A2P78410 334 aa14.84□□□□□ -0.03
ACTB-206ENST00000443528 NFATC3Q12968 1075 aa14.84□□□□□ -0.03
ACTB-206ENST00000443528 FAAH2Q6GMR7 532 aa14.84□□□□□ -0.03
ACTB-206ENST00000443528 TCTN3Q6NUS6 607 aa14.84□□□□□ -0.03
ACTB-206ENST00000443528 NIPAL1Q6NVV3 410 aa14.84□□□□□ -0.03
ACTB-206ENST00000443528 TMEM205Q6UW68 189 aa14.84□□□□□ -0.03
ACTB-206ENST00000443528 RNF175Q8N4F7 328 aa14.84□□□□□ -0.03
ACTB-206ENST00000443528 L3MBTL4Q8NA19 623 aa14.84□□□□□ -0.03
ACTB-206ENST00000443528 FDCSPQ8NFU4 85 aa14.84□□□□□ -0.03
ACTB-206ENST00000443528 OR2L5Q8NG80 312 aa14.84□□□□□ -0.03
ACTB-206ENST00000443528 OR52B6Q8NGF0 335 aa14.84□□□□□ -0.03
ACTB-206ENST00000443528 UBE2E3Q969T4 207 aa14.84□□□□□ -0.03
ACTB-206ENST00000443528 QRFPRQ96P65 431 aa14.84□□□□□ -0.03
ACTB-206ENST00000443528 F2RL3Q96RI0 385 aa14.84□□□□□ -0.03
ACTB-206ENST00000443528 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa14.84□□□□□ -0.03
ACTB-206ENST00000443528 MS4A8Q9BY19 250 aa14.84□□□□□ -0.03
ACTB-206ENST00000443528 RBCK1Q9BYM8 510 aa14.84□□□□□ -0.03
ACTB-206ENST00000443528 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
ACTB-206ENST00000443528 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
ACTB-206ENST00000443528 ACTR8Q9H981 624 aa14.84□□□□□ -0.03
ACTB-206ENST00000443528 LANCL2Q9NS86 450 aa14.84□□□□□ -0.03
ACTB-206ENST00000443528 DCDC2Q9UHG0 476 aa14.84□□□□□ -0.03
ACTB-206ENST00000443528 EMCNQ9ULC0 261 aa14.84□□□□□ -0.03
ACTB-206ENST00000443528 RNF11Q9Y3C5 154 aa14.84□□□□□ -0.03
ACTB-206ENST00000443528 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
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ACTB-206ENST00000443528 A0A1W2PQ72 361 aa14.83□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 TLDC2A0PJX2 215 aa14.83□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 H0YIV9 168 aa14.83□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 PCNAP12004 261 aa14.83□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 ACPPP15309 386 aa14.83□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 IL10P22301 178 aa14.83□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 PLA2G16P53816 162 aa14.83□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 SOX8P57073 446 aa14.83□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 SKP1P63208 163 aa14.83□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 TUBB8Q3ZCM7 444 aa14.83□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 ABHD17CQ6PCB6 329 aa14.83□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 UBE3DQ7Z6J8 389 aa14.83□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 MREGQ8N565 214 aa14.83□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 CLEC1AQ8NC01 280 aa14.83□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 CDK15Q96Q40 435 aa14.83□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 OR1F2PQ96R84 312 aa14.83□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 SLC25A23Q9BV35 468 aa14.83□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 NTMT1Q9BV86 223 aa14.83□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 NUDT9Q9BW91 350 aa14.83□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa14.83□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa14.83□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 MED13Q9UHV7 2174 aa14.83□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa14.82□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 A0A1B0GTL3 188 aa14.82□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 PPP6CO00743 305 aa14.82□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 GLRA3O75311 464 aa14.82□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 TGFB1P01137 390 aa14.82□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 FHP07954 510 aa14.82□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 CYC1P08574 325 aa14.82□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 COX6A1P12074 109 aa14.82□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 TAC1P20366 129 aa14.82□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 SERPINB1P30740 379 aa14.82□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 RHAGQ02094 409 aa14.82□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 SLC18A2Q05940 514 aa14.82□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 Q0VFX4 171 aa14.82□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 TRAF3Q13114 568 aa14.82□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 RAPSNQ13702 412 aa14.82□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 RUNX2Q13950 521 aa14.82□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP14.82□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 MINDY4Q4G0A6 757 aa14.82□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 MFSD4BQ5TF39 518 aa14.82□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 LANCL3Q6ZV70 420 aa14.82□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 CA13Q8N1Q1 262 aa14.82□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 GALNT16Q8N428 558 aa14.82□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 AMER2Q8N7J2 671 aa14.82□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 HUS1BQ8NHY5 278 aa14.82□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 WDR20Q8TBZ3 569 aa14.82□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 TBC1D20Q96BZ9 403 aa14.82□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 FAR2Q96K12 515 aa14.82□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 PRDM7Q9NQW5 492 aa14.82□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa14.82□□□□□ -0.04
ACTB-206ENST00000443528 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa14.81□□□□□ -0.04
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