RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453216.1

TRAM2-AS1-201, Transcript of TRAM2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAM2-AS1, Length 664 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC5A8Q8N695 610 aa24.62■■□□□ 1.53
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PELI2Q9HAT8 420 aa24.62■■□□□ 1.53
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GRPEL1Q9HAV7 217 aa24.62■■□□□ 1.53
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PSAT1Q9Y617 370 aa24.62■■□□□ 1.53
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa24.61■■□□□ 1.53
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CDC7O00311 574 aa24.61■■□□□ 1.53
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TTI1O43156 1089 aa24.61■■□□□ 1.53
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC26A5P58743 744 aa24.61■■□□□ 1.53
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TAS2R50P59544 299 aa24.61■■□□□ 1.53
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 REEP5Q00765 189 aa24.61■■□□□ 1.53
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TMPRSS11BQ86T26 416 aa24.61■■□□□ 1.53
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MDS2Q8NDY4 140 aa24.61■■□□□ 1.53
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TRPV3Q8NET8 790 aa24.61■■□□□ 1.53
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ANKRD7Q92527 254 aa24.61■■□□□ 1.53
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa24.61■■□□□ 1.53
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NPAS2Q99743 824 aa24.61■■□□□ 1.53
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 AIF1LQ9BQI0 150 aa24.61■■□□□ 1.53
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ANKRD10Q9NXR5 420 aa24.61■■□□□ 1.53
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 COPG2Q9UBF2 871 aa24.61■■□□□ 1.53
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC22A14Q9Y267 594 aa24.61■■□□□ 1.53
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KCNE2Q9Y6J6 123 aa24.61■■□□□ 1.53
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa24.6■■□□□ 1.53
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa24.6■■□□□ 1.53
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 URADA6NGE7 173 aa24.6■■□□□ 1.53
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 B4GALT2O60909 372 aa24.6■■□□□ 1.53
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CD96P40200 585 aa24.6■■□□□ 1.53
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GNG11P61952 73 aa24.6■■□□□ 1.53
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RBPJQ06330 500 aa24.6■■□□□ 1.53
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OR1C1Q15619 314 aa24.6■■□□□ 1.53
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP24.6■■□□□ 1.53
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NXPE4Q6UWF7 544 aa24.6■■□□□ 1.53
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ANKRD53Q8N9V6 530 aa24.6■■□□□ 1.53
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FBXO36Q8NEA4 188 aa24.6■■□□□ 1.53
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 EGFL8Q99944 293 aa24.6■■□□□ 1.53
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TRIM31Q9BZY9 425 aa24.6■■□□□ 1.53
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KLHL1Q9NR64 748 aa24.6■■□□□ 1.53
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CREBBPQ92793 2442 aa24.59■■□□□ 1.53
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 USP27XA6NNY8 438 aa24.59■■□□□ 1.53
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MAN1A2O60476 641 aa24.59■■□□□ 1.53
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HNF4AP41235 474 aa24.59■■□□□ 1.53
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ST13P50502 369 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TAS2R39P59534 338 aa24.59■■□□□ 1.53
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RAB8AP61006 207 aa24.59■■□□□ 1.53
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF460Q14592 562 aa24.59■■□□□ 1.53
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PTCHD1Q96NR3 888 aa24.59■■□□□ 1.53
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC6A16Q9GZN6 736 aa24.59■■□□□ 1.53
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ENTPD4Q9Y227 616 aa24.59■■□□□ 1.53
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SAR1BQ9Y6B6 198 aa24.59■■□□□ 1.53
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CTAGE15A4D2H0 777 aa24.58■■□□□ 1.53
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GABRR3A8MPY1 467 aa24.58■■□□□ 1.53
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CCDC188H7C350 402 aa24.58■■□□□ 1.53
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NDC80O14777 642 aa24.58■■□□□ 1.53
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PRMT3O60678 531 aa24.58■■□□□ 1.53
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CD46P15529 392 aa24.58■■□□□ 1.53
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CDKL1Q00532 357 aa24.58■■□□□ 1.53
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.53
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SPINK14Q6IE38 97 aa24.58■■□□□ 1.53
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 QSOX2Q6ZRP7 698 aa24.58■■□□□ 1.53
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CTAGE6Q86UF2 777 aa24.58■■□□□ 1.53
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CYP4X1Q8N118 509 aa24.58■■□□□ 1.53
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LGI4Q8N135 537 aa24.58■■□□□ 1.53
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HORMAD2Q8N7B1 307 aa24.58■■□□□ 1.53
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HES7Q9BYE0 225 aa24.58■■□□□ 1.53
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MOCS1Q9NZB8 636 aa24.58■■□□□ 1.53
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OARD1Q9Y530 152 aa24.58■■□□□ 1.53
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 EFCAB8A8MWE9 144 aa24.57■■□□□ 1.52
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PRSS44E7EML9 344 aa24.57■■□□□ 1.52
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CCL21O00585 134 aa24.57■■□□□ 1.52
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TP73O15350 636 aa24.57■■□□□ 1.52
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RNH1P13489 461 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CA7P43166 264 aa24.57■■□□□ 1.52
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HNMTP50135 292 aa24.57■■□□□ 1.52
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HYAL2Q12891 473 aa24.57■■□□□ 1.52
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MYO7BQ6PIF6 2116 aa24.57■■□□□ 1.52
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FRA10AC1Q70Z53 315 aa24.57■■□□□ 1.52
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TICAM1Q8IUC6 712 aa24.57■■□□□ 1.52
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TMEM178AQ8NBL3 297 aa24.57■■□□□ 1.52
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ELP5Q8TE02 316 aa24.57■■□□□ 1.52
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SCMH1Q96GD3 660 aa24.57■■□□□ 1.52
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 VPS39Q96JC1 886 aa24.57■■□□□ 1.52
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KLHL31Q9H511 634 aa24.57■■□□□ 1.52
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CDCP1Q9H5V8 836 aa24.57■■□□□ 1.52
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa24.57■■□□□ 1.52
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa24.57■■□□□ 1.52
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 E7ESA3 106 aa24.56■■□□□ 1.52
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FAM227AF5H4B4 570 aa24.56■■□□□ 1.52
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
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