RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545663.5

CLSTN3-216, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 4

Gene CLSTN3, Length 533 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-216ENST00000545663 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP21.67■■□□□ 1.06
CLSTN3-216ENST00000545663 USPL1Q5W0Q7 1092 aa21.67■■□□□ 1.06
CLSTN3-216ENST00000545663 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP21.67■■□□□ 1.06
CLSTN3-216ENST00000545663 ZNF831Q5JPB2 1677 aa21.66■■□□□ 1.06
CLSTN3-216ENST00000545663 TONSLQ96HA7 1378 aa21.66■■□□□ 1.06
CLSTN3-216ENST00000545663 C2CD5Q86YS7 1000 aa21.66■■□□□ 1.06
CLSTN3-216ENST00000545663 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP21.65■■□□□ 1.06
CLSTN3-216ENST00000545663 ERVV-2B6SEH9 535 aa21.65■■□□□ 1.06
CLSTN3-216ENST00000545663 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP21.65■■□□□ 1.06
CLSTN3-216ENST00000545663 KIF24Q5T7B8 1368 aa21.64■■□□□ 1.06
CLSTN3-216ENST00000545663 NFIXQ14938 502 aa21.64■■□□□ 1.05
CLSTN3-216ENST00000545663 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.05
CLSTN3-216ENST00000545663 TESK2Q96S53 571 aa21.63■■□□□ 1.05
CLSTN3-216ENST00000545663 C21orf2O43822 256 aa21.62■■□□□ 1.05
CLSTN3-216ENST00000545663 LDHDQ86WU2 507 aa21.62■■□□□ 1.05
CLSTN3-216ENST00000545663 CFAP44Q96MT7 982 aa21.62■■□□□ 1.05
CLSTN3-216ENST00000545663 ZPR1O75312 459 aa21.61■■□□□ 1.05
CLSTN3-216ENST00000545663 DEFB115Q30KQ5 88 aa21.61■■□□□ 1.05
CLSTN3-216ENST00000545663 CARMIL3Q8ND23 1372 aa21.61■■□□□ 1.05
CLSTN3-216ENST00000545663 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
CLSTN3-216ENST00000545663 RASSF10A6NK89 507 aa21.6■■□□□ 1.05
CLSTN3-216ENST00000545663 H0YIN7 160 aa21.6■■□□□ 1.05
CLSTN3-216ENST00000545663 SERPINB2P05120 415 aa21.6■■□□□ 1.05
CLSTN3-216ENST00000545663 CABP4P57796 275 aa21.6■■□□□ 1.05
CLSTN3-216ENST00000545663 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
CLSTN3-216ENST00000545663 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa21.6■■□□□ 1.05
CLSTN3-216ENST00000545663 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
CLSTN3-216ENST00000545663 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
CLSTN3-216ENST00000545663 DLEC1Q9Y238 1755 aa21.58■■□□□ 1.04
CLSTN3-216ENST00000545663 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa21.57■■□□□ 1.04
CLSTN3-216ENST00000545663 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
CLSTN3-216ENST00000545663 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP21.57■■□□□ 1.04
CLSTN3-216ENST00000545663 BCL2L12Q9HB09 334 aa21.57■■□□□ 1.04
CLSTN3-216ENST00000545663 TSKSQ9UJT2 592 aa21.57■■□□□ 1.04
CLSTN3-216ENST00000545663 WASHC2AQ641Q2 1341 aa21.55■■□□□ 1.04
CLSTN3-216ENST00000545663 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa21.55■■□□□ 1.04
CLSTN3-216ENST00000545663 CLEC11AQ9Y240 323 aa21.55■■□□□ 1.04
CLSTN3-216ENST00000545663 IQCA1LA6NCM1 817 aa21.54■■□□□ 1.04
CLSTN3-216ENST00000545663 NRXN2Q9P2S2 1712 aa21.54■■□□□ 1.04
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CLSTN3-216ENST00000545663 TJP1Q07157 1748 aa21.53■■□□□ 1.04
CLSTN3-216ENST00000545663 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
CLSTN3-216ENST00000545663 DNAJC10Q8IXB1 793 aa21.53■■□□□ 1.04
CLSTN3-216ENST00000545663 CCDC24Q8N4L8 307 aa21.53■■□□□ 1.04
CLSTN3-216ENST00000545663 TAOK3Q9H2K8 898 aa21.53■■□□□ 1.04
CLSTN3-216ENST00000545663 NARFQ9UHQ1 456 aa21.53■■□□□ 1.04
CLSTN3-216ENST00000545663 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
CLSTN3-216ENST00000545663 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa21.53■■□□□ 1.04
CLSTN3-216ENST00000545663 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
CLSTN3-216ENST00000545663 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
CLSTN3-216ENST00000545663 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
CLSTN3-216ENST00000545663 BICDL1Q6ZP65 573 aa21.51■■□□□ 1.03
CLSTN3-216ENST00000545663 CNTROBQ8N137 903 aa21.51■■□□□ 1.03
CLSTN3-216ENST00000545663 CARD14Q9BXL6 1004 aa21.51■■□□□ 1.03
CLSTN3-216ENST00000545663 MCOLN1Q9GZU1 580 aa21.51■■□□□ 1.03
CLSTN3-216ENST00000545663 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa21.5■■□□□ 1.03
CLSTN3-216ENST00000545663 GRM1Q13255 1194 aa21.5■■□□□ 1.03
CLSTN3-216ENST00000545663 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
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CLSTN3-216ENST00000545663 MTHFSP49914 203 aa21.49■■□□□ 1.03
CLSTN3-216ENST00000545663 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP21.49■■□□□ 1.03
CLSTN3-216ENST00000545663 KIF20BQ96Q89 1820 aa21.49■■□□□ 1.03
CLSTN3-216ENST00000545663 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
CLSTN3-216ENST00000545663 CYP4F22Q6NT55 531 aa21.47■■□□□ 1.03
CLSTN3-216ENST00000545663 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
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CLSTN3-216ENST00000545663 BEGAINQ9BUH8 593 aa21.47■■□□□ 1.03
CLSTN3-216ENST00000545663 POLKQ9UBT6 870 aa21.47■■□□□ 1.03
CLSTN3-216ENST00000545663 ZNF541Q9H0D2 1346 aa21.47■■□□□ 1.03
CLSTN3-216ENST00000545663 EPHX2P34913 555 aa21.46■■□□□ 1.03
CLSTN3-216ENST00000545663 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
CLSTN3-216ENST00000545663 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
CLSTN3-216ENST00000545663 HACL1Q9UJ83 578 aa21.46■■□□□ 1.03
CLSTN3-216ENST00000545663 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa21.45■■□□□ 1.02
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CLSTN3-216ENST00000545663 COL15A1P39059 1388 aa21.45■■□□□ 1.02
CLSTN3-216ENST00000545663 BRIP1Q9BX63 1249 aa21.44■■□□□ 1.02
CLSTN3-216ENST00000545663 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa21.43■■□□□ 1.02
CLSTN3-216ENST00000545663 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa21.43■■□□□ 1.02
CLSTN3-216ENST00000545663 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa21.43■■□□□ 1.02
CLSTN3-216ENST00000545663 AOC2O75106 756 aa21.43■■□□□ 1.02
CLSTN3-216ENST00000545663 PDE6BP35913 854 aa21.43■■□□□ 1.02
CLSTN3-216ENST00000545663 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP21.43■■□□□ 1.02
CLSTN3-216ENST00000545663 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
CLSTN3-216ENST00000545663 TBC1D9BQ66K14 1250 aa21.42■■□□□ 1.02
CLSTN3-216ENST00000545663 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
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CLSTN3-216ENST00000545663 RNF123Q5XPI4 1314 aa21.41■■□□□ 1.02
CLSTN3-216ENST00000545663 PRR5LQ6MZQ0 368 aa21.41■■□□□ 1.02
CLSTN3-216ENST00000545663 DGKZQ13574 1117 aa21.4■■□□□ 1.02
CLSTN3-216ENST00000545663 THSD7BQ9C0I4 1608 aa21.4■■□□□ 1.02
CLSTN3-216ENST00000545663 CANXP27824 592 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
CLSTN3-216ENST00000545663 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
CLSTN3-216ENST00000545663 SLC39A6Q13433 755 aa21.39■■□□□ 1.01
CLSTN3-216ENST00000545663 C1orf141Q5JVX7 400 aa21.39■■□□□ 1.01
CLSTN3-216ENST00000545663 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
CLSTN3-216ENST00000545663 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
CLSTN3-216ENST00000545663 LTBP1Q14766 1721 aa21.38■■□□□ 1.01
CLSTN3-216ENST00000545663 ECE1P42892 770 aa21.38■■□□□ 1.01
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