RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543473.1

SUDS3-204, Transcript of SDS3 homolog, SIN3A corepressor complex component, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SUDS3, Length 4,897 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUDS3-204ENST00000543473 ZSCAN12O43309 604 aa22.68■■□□□ 1.22
SUDS3-204ENST00000543473 GJB2P29033 226 aa22.68■■□□□ 1.22
SUDS3-204ENST00000543473 VPS37DQ86XT2 251 aa22.68■■□□□ 1.22
SUDS3-204ENST00000543473 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa22.68■■□□□ 1.22
SUDS3-204ENST00000543473 USHBP1Q8N6Y0 703 aa22.68■■□□□ 1.22
SUDS3-204ENST00000543473 ARHGAP45Q92619 1136 aa22.68■■□□□ 1.22
SUDS3-204ENST00000543473 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
SUDS3-204ENST00000543473 CTAGE5O15320 804 aa22.68■■□□□ 1.22
SUDS3-204ENST00000543473 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
SUDS3-204ENST00000543473 ACEP12821 1306 aa22.67■■□□□ 1.22
SUDS3-204ENST00000543473 FAM177BA6PVY3 158 aa22.67■■□□□ 1.22
SUDS3-204ENST00000543473 BTBD11A6QL63 1104 aa22.67■■□□□ 1.22
SUDS3-204ENST00000543473 KIAA0754O94854 1291 aa22.67■■□□□ 1.22
SUDS3-204ENST00000543473 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
SUDS3-204ENST00000543473 STK11IPQ8N1F8 1099 aa22.67■■□□□ 1.22
SUDS3-204ENST00000543473 PIP4K2BP78356 416 aa22.66■■□□□ 1.22
SUDS3-204ENST00000543473 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa22.66■■□□□ 1.22
SUDS3-204ENST00000543473 DEF6Q9H4E7 631 aa22.66■■□□□ 1.22
SUDS3-204ENST00000543473 USP48Q86UV5 1035 aa22.66■■□□□ 1.22
SUDS3-204ENST00000543473 TSHZ3Q63HK5 1081 aa22.66■■□□□ 1.22
SUDS3-204ENST00000543473 FBLN1P23142 703 aa22.65■■□□□ 1.22
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SUDS3-204ENST00000543473 MYL6BP14649 208 aa22.65■■□□□ 1.22
SUDS3-204ENST00000543473 CCDC158Q5M9N0 1113 aa22.65■■□□□ 1.22
SUDS3-204ENST00000543473 TRIM22Q8IYM9 498 aa22.65■■□□□ 1.22
SUDS3-204ENST00000543473 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
SUDS3-204ENST00000543473 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
SUDS3-204ENST00000543473 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
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SUDS3-204ENST00000543473 CEP135Q66GS9 1140 aa22.65■■□□□ 1.22
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SUDS3-204ENST00000543473 PTPRCP08575 1304 aa22.64■■□□□ 1.22
SUDS3-204ENST00000543473 TESK2Q96S53 571 aa22.64■■□□□ 1.21
SUDS3-204ENST00000543473 MBIPQ9NS73 344 aa22.64■■□□□ 1.21
SUDS3-204ENST00000543473 RIMS2Q9UQ26 1411 aa22.64■■□□□ 1.21
SUDS3-204ENST00000543473 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa22.63■■□□□ 1.21
SUDS3-204ENST00000543473 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
SUDS3-204ENST00000543473 CCDC191Q8NCU4 936 aa22.63■■□□□ 1.21
SUDS3-204ENST00000543473 KRT222Q8N1A0 295 aa22.63■■□□□ 1.21
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SUDS3-204ENST00000543473 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
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SUDS3-204ENST00000543473 CCDC186Q7Z3E2 898 aa22.63■■□□□ 1.21
SUDS3-204ENST00000543473 CAVIN2O95810 425 aa22.62■■□□□ 1.21
SUDS3-204ENST00000543473 FAM193AP78312 1265 aa22.62■■□□□ 1.21
SUDS3-204ENST00000543473 KIF6Q6ZMV9 814 aa22.62■■□□□ 1.21
SUDS3-204ENST00000543473 CNPY2Q9Y2B0 182 aa22.62■■□□□ 1.21
SUDS3-204ENST00000543473 CTNNA3Q9UI47 895 aa22.62■■□□□ 1.21
SUDS3-204ENST00000543473 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
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SUDS3-204ENST00000543473 CDKL5O76039 1030 aa22.62■■□□□ 1.21
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SUDS3-204ENST00000543473 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa22.61■■□□□ 1.21
SUDS3-204ENST00000543473 FAM200AQ8TCP9 573 aa22.61■■□□□ 1.21
SUDS3-204ENST00000543473 EPS15P42566 896 aa22.6■■□□□ 1.21
SUDS3-204ENST00000543473 CCDC181Q5TID7 509 aa22.6■■□□□ 1.21
SUDS3-204ENST00000543473 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa22.6■■□□□ 1.21
SUDS3-204ENST00000543473 STX1AQ16623 288 aa22.6■■□□□ 1.21
SUDS3-204ENST00000543473 RBM25P49756 843 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
SUDS3-204ENST00000543473 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
SUDS3-204ENST00000543473 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP22.59■■□□□ 1.213e-6■□□□□ 9.6
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SUDS3-204ENST00000543473 CASQ1P31415 396 aa22.59■■□□□ 1.21
SUDS3-204ENST00000543473 ANAPC15P60006 121 aa22.59■■□□□ 1.21
SUDS3-204ENST00000543473 FSIP1Q8NA03 581 aa22.59■■□□□ 1.21
SUDS3-204ENST00000543473 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP22.59■■□□□ 1.21
SUDS3-204ENST00000543473 PDE1AP54750 535 aa22.59■■□□□ 1.21
SUDS3-204ENST00000543473 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP22.59■■□□□ 1.21
SUDS3-204ENST00000543473 TIGD1Q96MW7 591 aa22.59■■□□□ 1.21
SUDS3-204ENST00000543473 ADGRL2O95490 1459 aa22.59■■□□□ 1.21
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SUDS3-204ENST00000543473 ANKRD44Q8N8A2 993 aa22.58■■□□□ 1.21
SUDS3-204ENST00000543473 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa22.58■■□□□ 1.21
SUDS3-204ENST00000543473 TMC6Q7Z403 805 aa22.58■■□□□ 1.21
SUDS3-204ENST00000543473 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
SUDS3-204ENST00000543473 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa22.58■■□□□ 1.2
SUDS3-204ENST00000543473 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.2
SUDS3-204ENST00000543473 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa22.57■■□□□ 1.2
SUDS3-204ENST00000543473 CRACR2AQ9BSW2 395 aa22.57■■□□□ 1.2
SUDS3-204ENST00000543473 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa22.57■■□□□ 1.2
SUDS3-204ENST00000543473 CCDC171Q6TFL3 1326 aa22.57■■□□□ 1.2
SUDS3-204ENST00000543473 RAD21O60216 631 aa22.57■■□□□ 1.2
SUDS3-204ENST00000543473 FLIIQ13045 1269 aa22.57■■□□□ 1.2
SUDS3-204ENST00000543473 ZMYM3Q14202 1370 aa22.57■■□□□ 1.2
SUDS3-204ENST00000543473 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa22.57■■□□□ 1.2
SUDS3-204ENST00000543473 STIM1Q13586 685 aa22.56■■□□□ 1.2
SUDS3-204ENST00000543473 MEIS3Q99687 375 aa22.56■■□□□ 1.2
SUDS3-204ENST00000543473 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
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