RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542443.5

TRDN-204, Transcript of triadin, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRDN, Length 1,294 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDN-204ENST00000542443 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
TRDN-204ENST00000542443 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
TRDN-204ENST00000542443 ARID3AQ99856 593 aa9.55□□□□□ -0.88
TRDN-204ENST00000542443 CABP1Q9NZU7 370 aa9.55□□□□□ -0.88
TRDN-204ENST00000542443 USP3Q9Y6I4 520 aa9.55□□□□□ -0.88
TRDN-204ENST00000542443 BACH1O14867 736 aa9.54□□□□□ -0.88
TRDN-204ENST00000542443 OIP5O43482 229 aa9.54□□□□□ -0.88
TRDN-204ENST00000542443 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
TRDN-204ENST00000542443 FGFR3P22607 806 aa9.54□□□□□ -0.88
TRDN-204ENST00000542443 NBPF1Q3BBV0 1214 aa9.54□□□□□ -0.88
TRDN-204ENST00000542443 PODNQ7Z5L7 613 aa9.54□□□□□ -0.88
TRDN-204ENST00000542443 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP9.54□□□□□ -0.88
TRDN-204ENST00000542443 C1orf216Q8TAB5 229 aa9.54□□□□□ -0.88
TRDN-204ENST00000542443 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
TRDN-204ENST00000542443 PARP3Q9Y6F1 533 aa9.54□□□□□ -0.88
TRDN-204ENST00000542443 MTFR1Q15390 333 aa9.53□□□□□ -0.88
TRDN-204ENST00000542443 FIGNL1Q6PIW4 674 aa9.53□□□□□ -0.88
TRDN-204ENST00000542443 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
TRDN-204ENST00000542443 GALNT6Q8NCL4 622 aa9.53□□□□□ -0.88
TRDN-204ENST00000542443 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
TRDN-204ENST00000542443 A0A1W2PNR3 127 aa9.52□□□□□ -0.89
TRDN-204ENST00000542443 PHF20L1A8MW92 1017 aa9.52□□□□□ -0.89
TRDN-204ENST00000542443 C2CD2LO14523 706 aa9.52□□□□□ -0.89
TRDN-204ENST00000542443 TATP17735 454 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
TRDN-204ENST00000542443 CTBSQ01459 385 aa9.52□□□□□ -0.89
TRDN-204ENST00000542443 LRRC4BQ9NT99 713 aa9.52□□□□□ -0.89
TRDN-204ENST00000542443 NDFIP2Q9NV92 336 aa9.52□□□□□ -0.89
TRDN-204ENST00000542443 ZNF358Q9NW07 568 aa9.52□□□□□ -0.89
TRDN-204ENST00000542443 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa9.52□□□□□ -0.89
TRDN-204ENST00000542443 GPAT2Q6NUI2 795 aa9.51□□□□□ -0.89
TRDN-204ENST00000542443 NLRP8Q86W28 1048 aa9.51□□□□□ -0.89
TRDN-204ENST00000542443 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa9.51□□□□□ -0.89
TRDN-204ENST00000542443 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
TRDN-204ENST00000542443 GJA3Q9Y6H8 435 aa9.51□□□□□ -0.89
TRDN-204ENST00000542443 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
TRDN-204ENST00000542443 DCDC2BA2VCK2 349 aa9.5□□□□□ -0.89
TRDN-204ENST00000542443 SHISA8B8ZZ34 492 aa9.5□□□□□ -0.89
TRDN-204ENST00000542443 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
TRDN-204ENST00000542443 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
TRDN-204ENST00000542443 UCN2Q96RP3 112 aa9.5□□□□□ -0.89
TRDN-204ENST00000542443 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
TRDN-204ENST00000542443 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
TRDN-204ENST00000542443 USP17L3A6NCW0 530 aa9.49□□□□□ -0.89
TRDN-204ENST00000542443 USP17L4A6NCW7 530 aa9.49□□□□□ -0.89
TRDN-204ENST00000542443 TBCELQ5QJ74 424 aa9.49□□□□□ -0.89
TRDN-204ENST00000542443 USP17L2Q6R6M4 530 aa9.49□□□□□ -0.89
TRDN-204ENST00000542443 BICDL1Q6ZP65 573 aa9.49□□□□□ -0.89
TRDN-204ENST00000542443 USP17L1Q7RTZ2 530 aa9.49□□□□□ -0.89
TRDN-204ENST00000542443 TRIM50Q86XT4 487 aa9.49□□□□□ -0.89
TRDN-204ENST00000542443 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa9.49□□□□□ -0.89
TRDN-204ENST00000542443 EDARADDQ8WWZ3 215 aa9.49□□□□□ -0.89
TRDN-204ENST00000542443 RRAGCQ9HB90 399 aa9.49□□□□□ -0.89
TRDN-204ENST00000542443 TNS4Q8IZW8 715 aa9.48□□□□□ -0.89
TRDN-204ENST00000542443 TPCN2Q8NHX9 752 aa9.48□□□□□ -0.89
TRDN-204ENST00000542443 ARXQ96QS3 562 aa9.48□□□□□ -0.89
TRDN-204ENST00000542443 ZIC5Q96T25 663 aa9.48□□□□□ -0.89
TRDN-204ENST00000542443 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa9.48□□□□□ -0.89
TRDN-204ENST00000542443 GGA1Q9UJY5 639 aa9.48□□□□□ -0.89
TRDN-204ENST00000542443 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
TRDN-204ENST00000542443 AMPD1P23109 780 aa9.47□□□□□ -0.89
TRDN-204ENST00000542443 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
TRDN-204ENST00000542443 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa9.47□□□□□ -0.89
TRDN-204ENST00000542443 ZNF232Q9UNY5 417 aa9.47□□□□□ -0.89
TRDN-204ENST00000542443 ATP9BO43861 1147 aa9.46□□□□□ -0.9
TRDN-204ENST00000542443 MAPTP10636 758 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
TRDN-204ENST00000542443 CD33P20138 364 aa9.46□□□□□ -0.9
TRDN-204ENST00000542443 TXLNAP40222 546 aa9.46□□□□□ -0.9
TRDN-204ENST00000542443 ATP1A2P50993 1020 aa9.46□□□□□ -0.9
TRDN-204ENST00000542443 CCDC102BQ68D86 513 aa9.46□□□□□ -0.9
TRDN-204ENST00000542443 SLC9A9Q8IVB4 645 aa9.46□□□□□ -0.9
TRDN-204ENST00000542443 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa9.46□□□□□ -0.9
TRDN-204ENST00000542443 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa9.46□□□□□ -0.9
TRDN-204ENST00000542443 L3MBTL2Q969R5 705 aa9.46□□□□□ -0.9
TRDN-204ENST00000542443 KIAA1024Q9UPX6 916 aa9.46□□□□□ -0.9
TRDN-204ENST00000542443 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
TRDN-204ENST00000542443 CLDN10P78369 228 aa9.45□□□□□ -0.9
TRDN-204ENST00000542443 TNP2Q05952 138 aa9.45□□□□□ -0.9
TRDN-204ENST00000542443 CFAP70Q5T0N1 1121 aa9.45□□□□□ -0.9
TRDN-204ENST00000542443 DCAF5Q96JK2 942 aa9.45□□□□□ -0.9
TRDN-204ENST00000542443 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
TRDN-204ENST00000542443 NEURL1BA8MQ27 555 aa9.44□□□□□ -0.9
TRDN-204ENST00000542443 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
TRDN-204ENST00000542443 NOS2P35228 1153 aa9.44□□□□□ -0.9
TRDN-204ENST00000542443 EPHA4P54764 986 aa9.44□□□□□ -0.9
TRDN-204ENST00000542443 FOXK2Q01167 660 aa9.44□□□□□ -0.9
TRDN-204ENST00000542443 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa9.44□□□□□ -0.9
TRDN-204ENST00000542443 OGFOD1Q8N543 542 aa9.44□□□□□ -0.9
TRDN-204ENST00000542443 MKL2Q9ULH7 1088 aa9.44□□□□□ -0.9
TRDN-204ENST00000542443 ARAFP10398 606 aa9.43□□□□□ -0.9
TRDN-204ENST00000542443 TEAD4Q15561 434 aa9.43□□□□□ -0.9
TRDN-204ENST00000542443 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
TRDN-204ENST00000542443 HCN2Q9UL51 889 aa9.43□□□□□ -0.9
TRDN-204ENST00000542443 SERTM1A2A2V5 107 aa9.42□□□□□ -0.9
TRDN-204ENST00000542443 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa9.42□□□□□ -0.9
TRDN-204ENST00000542443 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP9.42□□□□□ -0.9
TRDN-204ENST00000542443 NEUROD4Q9HD90 331 aa9.42□□□□□ -0.9
TRDN-204ENST00000542443 IGHA1P01876 353 aa9.41□□□□□ -0.9
TRDN-204ENST00000542443 EPXP11678 715 aa9.41□□□□□ -0.9
TRDN-204ENST00000542443 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa9.41□□□□□ -0.9
TRDN-204ENST00000542443 PRR12Q9ULL5 1215 aa9.41□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.3 ms