RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516099.1

RNU6-491P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 491, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-491P, Length 110 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-491P-201ENST00000516099 EPHA4P54764 986 aa9.06□□□□□ -0.96
RNU6-491P-201ENST00000516099 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP9.06□□□□□ -0.96
RNU6-491P-201ENST00000516099 CCDC116Q8IYX3 515 aa9.06□□□□□ -0.96
RNU6-491P-201ENST00000516099 COL26A1Q96A83 441 aa9.06□□□□□ -0.96
RNU6-491P-201ENST00000516099 DCTN4Q9UJW0 460 aa9.06□□□□□ -0.96
RNU6-491P-201ENST00000516099 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
RNU6-491P-201ENST00000516099 ADD1P35611 737 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
RNU6-491P-201ENST00000516099 CYP2U1Q7Z449 544 aa9.05□□□□□ -0.96
RNU6-491P-201ENST00000516099 HELQQ8TDG4 1101 aa9.05□□□□□ -0.96
RNU6-491P-201ENST00000516099 TRIM52Q96A61 297 aa9.05□□□□□ -0.96
RNU6-491P-201ENST00000516099 RAB6BQ9NRW1 208 aa9.05□□□□□ -0.96
RNU6-491P-201ENST00000516099 A0A1W2PRU2 124 aa9.04□□□□□ -0.96
RNU6-491P-201ENST00000516099 ASB16Q96NS5 453 aa9.04□□□□□ -0.96
RNU6-491P-201ENST00000516099 SLC4A9Q96Q91 983 aa9.04□□□□□ -0.96
RNU6-491P-201ENST00000516099 SAP130Q9H0E3 1048 aa9.04□□□□□ -0.96
RNU6-491P-201ENST00000516099 SOBPA7XYQ1 873 aa9.03□□□□□ -0.96
RNU6-491P-201ENST00000516099 GNRH1P01148 92 aa9.03□□□□□ -0.96
RNU6-491P-201ENST00000516099 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
RNU6-491P-201ENST00000516099 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP9.03□□□□□ -0.96
RNU6-491P-201ENST00000516099 A6NJY4 79 aa9.02□□□□□ -0.97
RNU6-491P-201ENST00000516099 FAM13AO94988 1023 aa9.02□□□□□ -0.97
RNU6-491P-201ENST00000516099 MPSTP25325 297 aa9.02□□□□□ -0.97
RNU6-491P-201ENST00000516099 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
RNU6-491P-201ENST00000516099 ESCO1Q5FWF5 840 aa9.02□□□□□ -0.97
RNU6-491P-201ENST00000516099 SLC9A9Q8IVB4 645 aa9.02□□□□□ -0.97
RNU6-491P-201ENST00000516099 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa9.02□□□□□ -0.97
RNU6-491P-201ENST00000516099 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP9.02□□□□□ -0.97
RNU6-491P-201ENST00000516099 SMTNP53814 917 aa9.01□□□□□ -0.97
RNU6-491P-201ENST00000516099 FOXK2Q01167 660 aa9.01□□□□□ -0.97
RNU6-491P-201ENST00000516099 C16orf46Q6P387 395 aa9.01□□□□□ -0.97
RNU6-491P-201ENST00000516099 MEIOBQ8N635 442 aa9.01□□□□□ -0.97
RNU6-491P-201ENST00000516099 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa9.01□□□□□ -0.97
RNU6-491P-201ENST00000516099 IGSF3O75054 1194 aa9□□□□□ -0.97
RNU6-491P-201ENST00000516099 NPR3P17342 541 aa9□□□□□ -0.97
RNU6-491P-201ENST00000516099 FBXO33Q7Z6M2 555 aa9□□□□□ -0.97
RNU6-491P-201ENST00000516099 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP9□□□□□ -0.97
RNU6-491P-201ENST00000516099 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
RNU6-491P-201ENST00000516099 IL2RAP01589 272 aa8.99□□□□□ -0.97
RNU6-491P-201ENST00000516099 COX20Q5RI15 118 aa8.99□□□□□ -0.97
RNU6-491P-201ENST00000516099 XAGE2Q96GT9 111 aa8.99□□□□□ -0.97
RNU6-491P-201ENST00000516099 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
RNU6-491P-201ENST00000516099 WIPF1O43516 503 aa8.98□□□□□ -0.97
RNU6-491P-201ENST00000516099 VEGFBP49765 207 aa8.98□□□□□ -0.97
RNU6-491P-201ENST00000516099 CBLBQ13191 982 aa8.98□□□□□ -0.97
RNU6-491P-201ENST00000516099 AAMPQ13685 434 aa8.98□□□□□ -0.97
RNU6-491P-201ENST00000516099 MTFR1Q15390 333 aa8.98□□□□□ -0.97
RNU6-491P-201ENST00000516099 C6orf118Q5T5N4 469 aa8.98□□□□□ -0.97
RNU6-491P-201ENST00000516099 Q6ZVU0 165 aa8.98□□□□□ -0.97
RNU6-491P-201ENST00000516099 RGL4Q8IZJ4 473 aa8.98□□□□□ -0.97
RNU6-491P-201ENST00000516099 IGSF5Q9NSI5 407 aa8.98□□□□□ -0.97
RNU6-491P-201ENST00000516099 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa8.98□□□□□ -0.97
RNU6-491P-201ENST00000516099 USP3Q9Y6I4 520 aa8.98□□□□□ -0.97
RNU6-491P-201ENST00000516099 SCARF1Q14162 830 aa8.97□□□□□ -0.97
RNU6-491P-201ENST00000516099 TLR1Q15399 786 aa8.97□□□□□ -0.97
RNU6-491P-201ENST00000516099 LINC00528Q8N1L1 170 aa8.97□□□□□ -0.97
RNU6-491P-201ENST00000516099 CNKSR1Q969H4 720 aa8.97□□□□□ -0.97
RNU6-491P-201ENST00000516099 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
RNU6-491P-201ENST00000516099 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
RNU6-491P-201ENST00000516099 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
RNU6-491P-201ENST00000516099 TMC7Q7Z402 723 aa8.96□□□□□ -0.98
RNU6-491P-201ENST00000516099 STAG2Q8N3U4 1231 aa8.96□□□□□ -0.98
RNU6-491P-201ENST00000516099 TMC1Q8TDI8 760 aa8.96□□□□□ -0.98
RNU6-491P-201ENST00000516099 NGLY1Q96IV0 654 aa8.96□□□□□ -0.98
RNU6-491P-201ENST00000516099 CCDC87Q9NVE4 849 aa8.96□□□□□ -0.98
RNU6-491P-201ENST00000516099 STIM2Q9P246 746 aa8.96□□□□□ -0.98
RNU6-491P-201ENST00000516099 BRPF3Q9ULD4 1205 aa8.96□□□□□ -0.98
RNU6-491P-201ENST00000516099 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
RNU6-491P-201ENST00000516099 H3BM21 787 aa8.95□□□□□ -0.98
RNU6-491P-201ENST00000516099 CDK2AP1O14519 115 aa8.95□□□□□ -0.98
RNU6-491P-201ENST00000516099 TNFRSF10BO14763 440 aa8.95□□□□□ -0.98
RNU6-491P-201ENST00000516099 NDUFB5O43674 189 aa8.95□□□□□ -0.98
RNU6-491P-201ENST00000516099 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa8.95□□□□□ -0.98
RNU6-491P-201ENST00000516099 RBCK1Q9BYM8 510 aa8.95□□□□□ -0.98
RNU6-491P-201ENST00000516099 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
RNU6-491P-201ENST00000516099 LRFN2Q9ULH4 789 aa8.95□□□□□ -0.98
RNU6-491P-201ENST00000516099 CHMP3Q9Y3E7 222 aa8.95□□□□□ -0.98
RNU6-491P-201ENST00000516099 ERBB4Q15303 1308 aa8.95□□□□□ -0.98
RNU6-491P-201ENST00000516099 P4HBP07237 508 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
RNU6-491P-201ENST00000516099 ADH1AP07327 375 aa8.94□□□□□ -0.98
RNU6-491P-201ENST00000516099 LORP23490 312 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
RNU6-491P-201ENST00000516099 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa8.94□□□□□ -0.98
RNU6-491P-201ENST00000516099 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
RNU6-491P-201ENST00000516099 DNMT3LQ9UJW3 386 aa8.94□□□□□ -0.98
RNU6-491P-201ENST00000516099 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
RNU6-491P-201ENST00000516099 MEN1O00255 615 aa8.93□□□□□ -0.98
RNU6-491P-201ENST00000516099 FZD6O60353 706 aa8.93□□□□□ -0.98
RNU6-491P-201ENST00000516099 BMP2P12643 396 aa8.93□□□□□ -0.98
RNU6-491P-201ENST00000516099 CENPCQ03188 943 aa8.93□□□□□ -0.98
RNU6-491P-201ENST00000516099 NPAS3Q8IXF0 933 aa8.93□□□□□ -0.98
RNU6-491P-201ENST00000516099 AGBL1Q96MI9 1066 aa8.93□□□□□ -0.98
RNU6-491P-201ENST00000516099 ZNF232Q9UNY5 417 aa8.93□□□□□ -0.98
RNU6-491P-201ENST00000516099 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa8.93□□□□□ -0.98
RNU6-491P-201ENST00000516099 HRH3Q9Y5N1 445 aa8.93□□□□□ -0.98
RNU6-491P-201ENST00000516099 PARP3Q9Y6F1 533 aa8.93□□□□□ -0.98
RNU6-491P-201ENST00000516099 SERTM1A2A2V5 107 aa8.92□□□□□ -0.98
RNU6-491P-201ENST00000516099 ZBTB39O15060 712 aa8.92□□□□□ -0.98
RNU6-491P-201ENST00000516099 COL19A1Q14993 1142 aa8.92□□□□□ -0.98
RNU6-491P-201ENST00000516099 FAM26DQ5JW98 314 aa8.92□□□□□ -0.98
RNU6-491P-201ENST00000516099 ALKBH2Q6NS38 261 aa8.92□□□□□ -0.98
RNU6-491P-201ENST00000516099 ATCAYQ86WG3 371 aa8.92□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.4 ms