RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469376.5

OPN3-204, Transcript of opsin 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene OPN3, Length 1,961 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN3-204ENST00000469376 LRRCC1Q9C099 1032 aa31.69■■■□□ 2.66
OPN3-204ENST00000469376 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa31.69■■■□□ 2.66
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OPN3-204ENST00000469376 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP31.68■■■□□ 2.66
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OPN3-204ENST00000469376 NBPF4Q96M43 638 aa31.67■■■□□ 2.66
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OPN3-204ENST00000469376 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa31.64■■■□□ 2.66
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OPN3-204ENST00000469376 USP44Q9H0E7 712 aa31.54■■■□□ 2.64
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OPN3-204ENST00000469376 SSH3Q8TE77 659 aa31.52■■■□□ 2.64
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OPN3-204ENST00000469376 BTG4Q9NY30 223 aa31.5■■■□□ 2.63
OPN3-204ENST00000469376 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa31.49■■■□□ 2.63
OPN3-204ENST00000469376 EVA1CP58658 441 aa31.49■■■□□ 2.63
OPN3-204ENST00000469376 TMX3Q96JJ7 454 aa31.49■■■□□ 2.63
OPN3-204ENST00000469376 ZDHHC9Q9Y397 364 aa31.49■■■□□ 2.63
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OPN3-204ENST00000469376 RILPL2Q969X0 211 aa31.48■■■□□ 2.63
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OPN3-204ENST00000469376 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa31.41■■■□□ 2.62
OPN3-204ENST00000469376 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP31.4■■■□□ 2.62
OPN3-204ENST00000469376 BRD1O95696 1058 aa31.39■■■□□ 2.62
OPN3-204ENST00000469376 AMOTQ4VCS5 1084 aa31.39■■■□□ 2.62
OPN3-204ENST00000469376 KIF1BPQ96EK5 621 aa31.39■■■□□ 2.62
OPN3-204ENST00000469376 UNC5CLQ8IV45 518 aa31.39■■■□□ 2.62
OPN3-204ENST00000469376 SURF6O75683 361 aaKnown RBP31.38■■■□□ 2.61
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