RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439695.1

RPSAP41-201, Transcript of ribosomal protein SA pseudogene 41, humanhuman

BASIC

Gene RPSAP41, Length 860 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPSAP41-201ENST00000439695 CLN3Q13286 438 aa12.01□□□□□ -0.49
RPSAP41-201ENST00000439695 COX20Q5RI15 118 aa12.01□□□□□ -0.49
RPSAP41-201ENST00000439695 NNTQ13423 1086 aa12□□□□□ -0.49
RPSAP41-201ENST00000439695 SPRYD7Q5W111 196 aa12□□□□□ -0.49
RPSAP41-201ENST00000439695 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
RPSAP41-201ENST00000439695 BRPF3Q9ULD4 1205 aa12□□□□□ -0.49
RPSAP41-201ENST00000439695 TNFRSF10BO14763 440 aa11.99□□□□□ -0.49
RPSAP41-201ENST00000439695 ALDH1A1P00352 501 aa11.99□□□□□ -0.49
RPSAP41-201ENST00000439695 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
RPSAP41-201ENST00000439695 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
RPSAP41-201ENST00000439695 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
RPSAP41-201ENST00000439695 TMC7Q7Z402 723 aa11.99□□□□□ -0.49
RPSAP41-201ENST00000439695 ABTB2Q8N961 1025 aa11.99□□□□□ -0.49
RPSAP41-201ENST00000439695 BCL11AQ9H165 835 aa11.99□□□□□ -0.49
RPSAP41-201ENST00000439695 USP3Q9Y6I4 520 aa11.99□□□□□ -0.49
RPSAP41-201ENST00000439695 WASF2Q9Y6W5 498 aa11.99□□□□□ -0.49
RPSAP41-201ENST00000439695 TEAD4Q15561 434 aa11.98□□□□□ -0.49
RPSAP41-201ENST00000439695 Q6ZVU0 165 aa11.98□□□□□ -0.49
RPSAP41-201ENST00000439695 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP11.98□□□□□ -0.49
RPSAP41-201ENST00000439695 SERTM1A2A2V5 107 aa11.97□□□□□ -0.49
RPSAP41-201ENST00000439695 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP11.97□□□□□ -0.49
RPSAP41-201ENST00000439695 EML1O00423 815 aa11.96□□□□□ -0.49
RPSAP41-201ENST00000439695 PTGIRP43119 386 aa11.96□□□□□ -0.49
RPSAP41-201ENST00000439695 LRFN2Q9ULH4 789 aa11.96□□□□□ -0.49
RPSAP41-201ENST00000439695 TREHO43280 583 aa11.95□□□□□ -0.5
RPSAP41-201ENST00000439695 FZD6O60353 706 aa11.95□□□□□ -0.5
RPSAP41-201ENST00000439695 BRD2P25440 801 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
RPSAP41-201ENST00000439695 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
RPSAP41-201ENST00000439695 CENPCQ03188 943 aa11.95□□□□□ -0.5
RPSAP41-201ENST00000439695 CBLBQ13191 982 aa11.95□□□□□ -0.5
RPSAP41-201ENST00000439695 ZNF697Q5TEC3 545 aa11.95□□□□□ -0.5
RPSAP41-201ENST00000439695 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
RPSAP41-201ENST00000439695 DMRTB1Q96MA1 342 aa11.95□□□□□ -0.5
RPSAP41-201ENST00000439695 NOS2P35228 1153 aa11.94□□□□□ -0.5
RPSAP41-201ENST00000439695 AAMPQ13685 434 aa11.94□□□□□ -0.5
RPSAP41-201ENST00000439695 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa11.94□□□□□ -0.5
RPSAP41-201ENST00000439695 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
RPSAP41-201ENST00000439695 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP11.93□□□□□ -0.5
RPSAP41-201ENST00000439695 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa11.93□□□□□ -0.5
RPSAP41-201ENST00000439695 ITPKCQ96DU7 683 aa11.93□□□□□ -0.5
RPSAP41-201ENST00000439695 NLRP3Q96P20 1036 aa11.93□□□□□ -0.5
RPSAP41-201ENST00000439695 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
RPSAP41-201ENST00000439695 CCDC87Q9NVE4 849 aa11.93□□□□□ -0.5
RPSAP41-201ENST00000439695 P4HBP07237 508 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
RPSAP41-201ENST00000439695 TCF3P15923 654 aa11.92□□□□□ -0.5
RPSAP41-201ENST00000439695 PDE3BQ13370 1112 aa11.92□□□□□ -0.5
RPSAP41-201ENST00000439695 RTN1Q16799 776 aa11.92□□□□□ -0.5
RPSAP41-201ENST00000439695 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
RPSAP41-201ENST00000439695 CABP1Q9NZU7 370 aa11.92□□□□□ -0.5
RPSAP41-201ENST00000439695 PKD2L1Q9P0L9 805 aa11.92□□□□□ -0.5
RPSAP41-201ENST00000439695 ZNF232Q9UNY5 417 aa11.92□□□□□ -0.5
RPSAP41-201ENST00000439695 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
RPSAP41-201ENST00000439695 FGD1P98174 961 aa11.91□□□□□ -0.5
RPSAP41-201ENST00000439695 DSC3Q14574 896 aa11.91□□□□□ -0.5
RPSAP41-201ENST00000439695 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa11.91□□□□□ -0.5
RPSAP41-201ENST00000439695 TMC1Q8TDI8 760 aa11.91□□□□□ -0.5
RPSAP41-201ENST00000439695 L3MBTL2Q969R5 705 aa11.91□□□□□ -0.5
RPSAP41-201ENST00000439695 NGLY1Q96IV0 654 aa11.91□□□□□ -0.5
RPSAP41-201ENST00000439695 FAM129BQ96TA1 746 aa11.91□□□□□ -0.5
RPSAP41-201ENST00000439695 MEN1O00255 615 aa11.9□□□□□ -0.5
RPSAP41-201ENST00000439695 IGSF3O75054 1194 aa11.9□□□□□ -0.5
RPSAP41-201ENST00000439695 FOXC1Q12948 553 aa11.9□□□□□ -0.5
RPSAP41-201ENST00000439695 C11orf91Q3C1V1 193 aa11.9□□□□□ -0.5
RPSAP41-201ENST00000439695 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa11.9□□□□□ -0.5
RPSAP41-201ENST00000439695 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
RPSAP41-201ENST00000439695 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
RPSAP41-201ENST00000439695 IGHA2P01877 340 aa11.89□□□□□ -0.51
RPSAP41-201ENST00000439695 WDR4P57081 412 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
RPSAP41-201ENST00000439695 PLCB3Q01970 1234 aa11.89□□□□□ -0.51
RPSAP41-201ENST00000439695 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
RPSAP41-201ENST00000439695 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa11.89□□□□□ -0.51
RPSAP41-201ENST00000439695 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
RPSAP41-201ENST00000439695 AGBL1Q96MI9 1066 aa11.88□□□□□ -0.51
RPSAP41-201ENST00000439695 ZFAND3Q9H8U3 227 aa11.88□□□□□ -0.51
RPSAP41-201ENST00000439695 ZBTB39O15060 712 aa11.87□□□□□ -0.51
RPSAP41-201ENST00000439695 RECKO95980 971 aa11.87□□□□□ -0.51
RPSAP41-201ENST00000439695 TIMP2P16035 220 aa11.87□□□□□ -0.51
RPSAP41-201ENST00000439695 EHHADHQ08426 723 aa11.87□□□□□ -0.51
RPSAP41-201ENST00000439695 PKDCCQ504Y2 493 aa11.87□□□□□ -0.51
RPSAP41-201ENST00000439695 C1orf53Q5VUE5 145 aa11.87□□□□□ -0.51
RPSAP41-201ENST00000439695 RHBDD1Q8TEB9 315 aa11.87□□□□□ -0.51
RPSAP41-201ENST00000439695 PHACTR1Q9C0D0 580 aa11.87□□□□□ -0.51
RPSAP41-201ENST00000439695 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
RPSAP41-201ENST00000439695 GPC1P35052 558 aa11.86□□□□□ -0.51
RPSAP41-201ENST00000439695 USP5P45974 858 aa11.86□□□□□ -0.51
RPSAP41-201ENST00000439695 RELBQ01201 579 aa11.86□□□□□ -0.51
RPSAP41-201ENST00000439695 DGKZQ13574 1117 aa11.86□□□□□ -0.51
RPSAP41-201ENST00000439695 FAM26DQ5JW98 314 aa11.86□□□□□ -0.51
RPSAP41-201ENST00000439695 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
RPSAP41-201ENST00000439695 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa11.86□□□□□ -0.51
RPSAP41-201ENST00000439695 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
RPSAP41-201ENST00000439695 GJD3Q8N144 294 aa11.85□□□□□ -0.51
RPSAP41-201ENST00000439695 IFT43Q96FT9 208 aa11.85□□□□□ -0.51
RPSAP41-201ENST00000439695 PARP3Q9Y6F1 533 aa11.85□□□□□ -0.51
RPSAP41-201ENST00000439695 J3QL48 77 aa11.84□□□□□ -0.51
RPSAP41-201ENST00000439695 GPR182O15218 404 aa11.84□□□□□ -0.51
RPSAP41-201ENST00000439695 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
RPSAP41-201ENST00000439695 MAPK8P45983 427 aa11.84□□□□□ -0.51
RPSAP41-201ENST00000439695 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
RPSAP41-201ENST00000439695 ATCAYQ86WG3 371 aa11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 76.3 ms