RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423048.5

ALMS1-201, Transcript of ALMS1, centrosome and basal body associated protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ALMS1, Length 5,194 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALMS1-201ENST00000423048 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa8.35□□□□□ -1.07
ALMS1-201ENST00000423048 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
ALMS1-201ENST00000423048 CEP126Q9P2H0 1117 aa8.35□□□□□ -1.07
ALMS1-201ENST00000423048 PLA2R1Q13018 1463 aa8.35□□□□□ -1.07
ALMS1-201ENST00000423048 MBD5Q9P267 1494 aa8.35□□□□□ -1.07
ALMS1-201ENST00000423048 NEK4P51957 841 aa8.35□□□□□ -1.07
ALMS1-201ENST00000423048 SMC5Q8IY18 1101 aa8.35□□□□□ -1.07
ALMS1-201ENST00000423048 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
ALMS1-201ENST00000423048 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
ALMS1-201ENST00000423048 TBX22Q9Y458 520 aa8.35□□□□□ -1.07
ALMS1-201ENST00000423048 FAM135BQ49AJ0 1406 aa8.35□□□□□ -1.07
ALMS1-201ENST00000423048 VPS37DQ86XT2 251 aa8.35□□□□□ -1.07
ALMS1-201ENST00000423048 HOMER1Q86YM7 354 aa8.35□□□□□ -1.07
ALMS1-201ENST00000423048 TTC39AQ5SRH9 613 aa8.35□□□□□ -1.07
ALMS1-201ENST00000423048 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa8.35□□□□□ -1.07
ALMS1-201ENST00000423048 ABTB2Q8N961 1025 aa8.35□□□□□ -1.07
ALMS1-201ENST00000423048 PANK1Q8TE04 598 aa8.35□□□□□ -1.07
ALMS1-201ENST00000423048 DEF6Q9H4E7 631 aa8.35□□□□□ -1.07
ALMS1-201ENST00000423048 KDM5CP41229 1560 aa8.34□□□□□ -1.07
ALMS1-201ENST00000423048 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa8.34□□□□□ -1.07
ALMS1-201ENST00000423048 CLUL1Q15846 466 aa8.34□□□□□ -1.07
ALMS1-201ENST00000423048 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
ALMS1-201ENST00000423048 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
ALMS1-201ENST00000423048 TNMDQ9H2S6 317 aa8.34□□□□□ -1.07
ALMS1-201ENST00000423048 USP25Q9UHP3 1055 aa8.34□□□□□ -1.07
ALMS1-201ENST00000423048 DISP3Q9P2K9 1392 aa8.34□□□□□ -1.07
ALMS1-201ENST00000423048 GNAT2P19087 354 aa8.34□□□□□ -1.07
ALMS1-201ENST00000423048 CASTP20810 708 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
ALMS1-201ENST00000423048 GNAQP50148 359 aa8.34□□□□□ -1.07
ALMS1-201ENST00000423048 PPFIBP1Q86W92 1011 aa8.34□□□□□ -1.07
ALMS1-201ENST00000423048 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
ALMS1-201ENST00000423048 ANKRD44Q8N8A2 993 aa8.34□□□□□ -1.07
ALMS1-201ENST00000423048 CNNM2Q9H8M5 875 aa8.34□□□□□ -1.07
ALMS1-201ENST00000423048 RMND1Q9NWS8 449 aa8.34□□□□□ -1.07
ALMS1-201ENST00000423048 CABP1Q9NZU7 370 aa8.34□□□□□ -1.07
ALMS1-201ENST00000423048 CROCC2H7BZ55 1655 aa8.34□□□□□ -1.07
ALMS1-201ENST00000423048 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa8.34□□□□□ -1.07
ALMS1-201ENST00000423048 NDC80O14777 642 aa8.34□□□□□ -1.07
ALMS1-201ENST00000423048 SLC4A2P04920 1241 aa8.34□□□□□ -1.07
ALMS1-201ENST00000423048 MCTP2Q6DN12 878 aa8.34□□□□□ -1.07
ALMS1-201ENST00000423048 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
ALMS1-201ENST00000423048 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
ALMS1-201ENST00000423048 NLRP1Q9C000 1473 aa8.34□□□□□ -1.07
ALMS1-201ENST00000423048 LDHCP07864 332 aa8.34□□□□□ -1.07
ALMS1-201ENST00000423048 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
ALMS1-201ENST00000423048 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
ALMS1-201ENST00000423048 CTAGE1Q96RT6 745 aa8.34□□□□□ -1.07
ALMS1-201ENST00000423048 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
ALMS1-201ENST00000423048 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa8.34□□□□□ -1.07
ALMS1-201ENST00000423048 DYNC1I1O14576 645 aa8.33□□□□□ -1.08
ALMS1-201ENST00000423048 CALM1P0DP23 149 aa8.33□□□□□ -1.08
ALMS1-201ENST00000423048 CALM2P0DP24 149 aa8.33□□□□□ -1.08
ALMS1-201ENST00000423048 CALM3P0DP25 149 aa8.33□□□□□ -1.08
ALMS1-201ENST00000423048 UBE2HP62256 183 aa8.33□□□□□ -1.08
ALMS1-201ENST00000423048 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
ALMS1-201ENST00000423048 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa8.33□□□□□ -1.08
ALMS1-201ENST00000423048 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
ALMS1-201ENST00000423048 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa8.33□□□□□ -1.08
ALMS1-201ENST00000423048 GLT8D2Q9H1C3 349 aa8.33□□□□□ -1.08
ALMS1-201ENST00000423048 CABP4P57796 275 aa8.33□□□□□ -1.08
ALMS1-201ENST00000423048 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
ALMS1-201ENST00000423048 SULT6B1Q6IMI4 303 aa8.33□□□□□ -1.08
ALMS1-201ENST00000423048 CEP128Q6ZU80 1094 aa8.33□□□□□ -1.08
ALMS1-201ENST00000423048 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa8.33□□□□□ -1.08
ALMS1-201ENST00000423048 RGS22Q8NE09 1264 aa8.33□□□□□ -1.08
ALMS1-201ENST00000423048 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
ALMS1-201ENST00000423048 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
ALMS1-201ENST00000423048 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
ALMS1-201ENST00000423048 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
ALMS1-201ENST00000423048 ESPNB1AK53 854 aa8.33□□□□□ -1.08
ALMS1-201ENST00000423048 CETN2P41208 172 aa8.33□□□□□ -1.08
ALMS1-201ENST00000423048 AMPD3Q01432 767 aa8.33□□□□□ -1.08
ALMS1-201ENST00000423048 TTC22Q5TAA0 569 aa8.33□□□□□ -1.08
ALMS1-201ENST00000423048 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa8.33□□□□□ -1.08
ALMS1-201ENST00000423048 ECHDC1Q9NTX5 307 aa8.33□□□□□ -1.08
ALMS1-201ENST00000423048 A2ML1A8K2U0 1454 aa8.32□□□□□ -1.08
ALMS1-201ENST00000423048 SBNO1A3KN83 1393 aa8.32□□□□□ -1.08
ALMS1-201ENST00000423048 CCDC69A6NI79 296 aa8.32□□□□□ -1.08
ALMS1-201ENST00000423048 CCDC172P0C7W6 258 aa8.32□□□□□ -1.08
ALMS1-201ENST00000423048 GSTO1P78417 241 aa8.32□□□□□ -1.08
ALMS1-201ENST00000423048 LEKR1Q6ZMV7 388 aa8.32□□□□□ -1.08
ALMS1-201ENST00000423048 CCDC148Q8NFR7 591 aa8.32□□□□□ -1.08
ALMS1-201ENST00000423048 DNAAF4Q8WXU2 420 aa8.32□□□□□ -1.08
ALMS1-201ENST00000423048 FMNL2Q96PY5 1086 aa8.32□□□□□ -1.08
ALMS1-201ENST00000423048 TRIM5Q9C035 493 aa8.32□□□□□ -1.08
ALMS1-201ENST00000423048 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
ALMS1-201ENST00000423048 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
ALMS1-201ENST00000423048 PLIN1O60240 522 aa8.32□□□□□ -1.08
ALMS1-201ENST00000423048 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
ALMS1-201ENST00000423048 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
ALMS1-201ENST00000423048 CROCCP2Q86T23 111 aa8.32□□□□□ -1.08
ALMS1-201ENST00000423048 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
ALMS1-201ENST00000423048 STX1AQ16623 288 aa8.31□□□□□ -1.08
ALMS1-201ENST00000423048 CADPS2Q86UW7 1296 aa8.31□□□□□ -1.08
ALMS1-201ENST00000423048 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
ALMS1-201ENST00000423048 SPATA32Q96LK8 384 aa8.31□□□□□ -1.08
ALMS1-201ENST00000423048 TOMM22Q9NS69 142 aa8.31□□□□□ -1.08
ALMS1-201ENST00000423048 PNMA2Q9UL42 364 aa8.31□□□□□ -1.08
ALMS1-201ENST00000423048 APBB1O00213 710 aa8.31□□□□□ -1.08
ALMS1-201ENST00000423048 AKAP4Q5JQC9 854 aa8.31□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.5 ms