RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419302.1

PDCL2P1-201, Transcript of phosducin-like 2 pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene PDCL2P1, Length 352 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL2P1-201ENST00000419302 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
PDCL2P1-201ENST00000419302 NLRP8Q86W28 1048 aa7.02□□□□□ -1.29
PDCL2P1-201ENST00000419302 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
PDCL2P1-201ENST00000419302 CABP1Q9NZU7 370 aa7.02□□□□□ -1.29
PDCL2P1-201ENST00000419302 DCDC2BA2VCK2 349 aa7.01□□□□□ -1.29
PDCL2P1-201ENST00000419302 C2CD2LO14523 706 aa7.01□□□□□ -1.29
PDCL2P1-201ENST00000419302 ATP4AP20648 1035 aa7.01□□□□□ -1.29
PDCL2P1-201ENST00000419302 EML3Q32P44 896 aa7.01□□□□□ -1.29
PDCL2P1-201ENST00000419302 NDFIP2Q9NV92 336 aa7.01□□□□□ -1.29
PDCL2P1-201ENST00000419302 A0A1W2PNR3 127 aa7□□□□□ -1.29
PDCL2P1-201ENST00000419302 A6NJY4 79 aa7□□□□□ -1.29
PDCL2P1-201ENST00000419302 NEURL1BA8MQ27 555 aa7□□□□□ -1.29
PDCL2P1-201ENST00000419302 BACH1O14867 736 aa7□□□□□ -1.29
PDCL2P1-201ENST00000419302 ARAFP10398 606 aa7□□□□□ -1.29
PDCL2P1-201ENST00000419302 SKIP12755 728 aa7□□□□□ -1.29
PDCL2P1-201ENST00000419302 GRIN2CQ14957 1233 aa7□□□□□ -1.29
PDCL2P1-201ENST00000419302 BICDL1Q6ZP65 573 aa7□□□□□ -1.29
PDCL2P1-201ENST00000419302 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
PDCL2P1-201ENST00000419302 NOD1Q9Y239 953 aa7□□□□□ -1.29
PDCL2P1-201ENST00000419302 CDK2AP1O14519 115 aa6.99□□□□□ -1.29
PDCL2P1-201ENST00000419302 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
PDCL2P1-201ENST00000419302 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
PDCL2P1-201ENST00000419302 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
PDCL2P1-201ENST00000419302 TMEM229AB2RXF0 380 aa6.98□□□□□ -1.29
PDCL2P1-201ENST00000419302 PIK3CDO00329 1044 aa6.98□□□□□ -1.29
PDCL2P1-201ENST00000419302 MAPTP10636 758 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
PDCL2P1-201ENST00000419302 EPXP11678 715 aa6.98□□□□□ -1.29
PDCL2P1-201ENST00000419302 CD33P20138 364 aa6.98□□□□□ -1.29
PDCL2P1-201ENST00000419302 SLC4A9Q96Q91 983 aa6.98□□□□□ -1.29
PDCL2P1-201ENST00000419302 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa6.98□□□□□ -1.29
PDCL2P1-201ENST00000419302 PRR12Q9ULL5 1215 aa6.98□□□□□ -1.29
PDCL2P1-201ENST00000419302 COG6Q9Y2V7 657 aa6.98□□□□□ -1.29
PDCL2P1-201ENST00000419302 KRBA1A5PL33 1030 aa6.97□□□□□ -1.29
PDCL2P1-201ENST00000419302 GNB5O14775 395 aa6.97□□□□□ -1.29
PDCL2P1-201ENST00000419302 RAD21O60216 631 aa6.97□□□□□ -1.29
PDCL2P1-201ENST00000419302 ADH6P28332 368 aa6.97□□□□□ -1.29
PDCL2P1-201ENST00000419302 GTF2IP78347 998 aa6.97□□□□□ -1.29
PDCL2P1-201ENST00000419302 MTFR1Q15390 333 aa6.97□□□□□ -1.29
PDCL2P1-201ENST00000419302 BTBD6Q96KE9 485 aa6.97□□□□□ -1.29
PDCL2P1-201ENST00000419302 TNP2Q05952 138 aa6.96□□□□□ -1.3
PDCL2P1-201ENST00000419302 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa6.96□□□□□ -1.3
PDCL2P1-201ENST00000419302 NEUROD4Q9HD90 331 aa6.96□□□□□ -1.3
PDCL2P1-201ENST00000419302 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
PDCL2P1-201ENST00000419302 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
PDCL2P1-201ENST00000419302 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa6.96□□□□□ -1.3
PDCL2P1-201ENST00000419302 PARP3Q9Y6F1 533 aa6.96□□□□□ -1.3
PDCL2P1-201ENST00000419302 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
PDCL2P1-201ENST00000419302 COL8A1P27658 744 aa6.95□□□□□ -1.3
PDCL2P1-201ENST00000419302 NCOA4Q13772 614 aa6.95□□□□□ -1.3
PDCL2P1-201ENST00000419302 ZIC5Q96T25 663 aa6.95□□□□□ -1.3
PDCL2P1-201ENST00000419302 SUV39H2Q9H5I1 410 aa6.95□□□□□ -1.3
PDCL2P1-201ENST00000419302 ZNF232Q9UNY5 417 aa6.95□□□□□ -1.3
PDCL2P1-201ENST00000419302 USP3Q9Y6I4 520 aa6.95□□□□□ -1.3
PDCL2P1-201ENST00000419302 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa6.94□□□□□ -1.3
PDCL2P1-201ENST00000419302 FAM157BP0CG42 384 aa6.94□□□□□ -1.3
PDCL2P1-201ENST00000419302 FAM182BQ5T319 152 aa6.94□□□□□ -1.3
PDCL2P1-201ENST00000419302 LINC00114Q6XXX2 140 aa6.94□□□□□ -1.3
PDCL2P1-201ENST00000419302 CHSY3Q70JA7 882 aa6.94□□□□□ -1.3
PDCL2P1-201ENST00000419302 DEPDC4Q8N2C3 294 aa6.94□□□□□ -1.3
PDCL2P1-201ENST00000419302 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP6.94□□□□□ -1.3
PDCL2P1-201ENST00000419302 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa6.94□□□□□ -1.3
PDCL2P1-201ENST00000419302 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
PDCL2P1-201ENST00000419302 USP17L5A8MUK1 530 aa6.93□□□□□ -1.3
PDCL2P1-201ENST00000419302 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
PDCL2P1-201ENST00000419302 BAG6P46379 1132 aa6.93□□□□□ -1.3
PDCL2P1-201ENST00000419302 DGKGP49619 791 aa6.93□□□□□ -1.3
PDCL2P1-201ENST00000419302 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
PDCL2P1-201ENST00000419302 L3MBTL2Q969R5 705 aa6.93□□□□□ -1.3
PDCL2P1-201ENST00000419302 ALG2Q9H553 416 aa6.93□□□□□ -1.3
PDCL2P1-201ENST00000419302 ZNF358Q9NW07 568 aa6.93□□□□□ -1.3
PDCL2P1-201ENST00000419302 MARK1Q9P0L2 795 aa6.93□□□□□ -1.3
PDCL2P1-201ENST00000419302 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
PDCL2P1-201ENST00000419302 TXLNAP40222 546 aa6.92□□□□□ -1.3
PDCL2P1-201ENST00000419302 TRIM50Q86XT4 487 aa6.92□□□□□ -1.3
PDCL2P1-201ENST00000419302 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa6.92□□□□□ -1.3
PDCL2P1-201ENST00000419302 Q8N3U1 123 aa6.92□□□□□ -1.3
PDCL2P1-201ENST00000419302 UBTFP17480 764 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
PDCL2P1-201ENST00000419302 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
PDCL2P1-201ENST00000419302 ALAS2P22557 587 aa6.91□□□□□ -1.3
PDCL2P1-201ENST00000419302 NOS2P35228 1153 aa6.91□□□□□ -1.3
PDCL2P1-201ENST00000419302 LAMC2Q13753 1193 aa6.91□□□□□ -1.3
PDCL2P1-201ENST00000419302 TBCELQ5QJ74 424 aa6.91□□□□□ -1.3
PDCL2P1-201ENST00000419302 SAMD5Q5TGI4 173 aa6.91□□□□□ -1.3
PDCL2P1-201ENST00000419302 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
PDCL2P1-201ENST00000419302 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa6.91□□□□□ -1.3
PDCL2P1-201ENST00000419302 FCHSD1Q86WN1 690 aa6.91□□□□□ -1.3
PDCL2P1-201ENST00000419302 SLC9A9Q8IVB4 645 aa6.91□□□□□ -1.3
PDCL2P1-201ENST00000419302 POM121Q96HA1 1249 aa6.91□□□□□ -1.3
PDCL2P1-201ENST00000419302 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa6.91□□□□□ -1.3
PDCL2P1-201ENST00000419302 CHMP3Q9Y3E7 222 aa6.91□□□□□ -1.3
PDCL2P1-201ENST00000419302 FURINP09958 794 aa6.9□□□□□ -1.3
PDCL2P1-201ENST00000419302 ATP1A2P50993 1020 aa6.9□□□□□ -1.3
PDCL2P1-201ENST00000419302 TEAD4Q15561 434 aa6.9□□□□□ -1.3
PDCL2P1-201ENST00000419302 TNS4Q8IZW8 715 aa6.9□□□□□ -1.3
PDCL2P1-201ENST00000419302 SERTM1A2A2V5 107 aa6.89□□□□□ -1.31
PDCL2P1-201ENST00000419302 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa6.89□□□□□ -1.31
PDCL2P1-201ENST00000419302 TPCN2Q8NHX9 752 aa6.89□□□□□ -1.31
PDCL2P1-201ENST00000419302 RHPN1Q8TCX5 695 aa6.89□□□□□ -1.31
PDCL2P1-201ENST00000419302 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa6.89□□□□□ -1.31
PDCL2P1-201ENST00000419302 STRN4Q9NRL3 753 aa6.89□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.7 ms