RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000329146.8

CRIP2-201, Transcript of cysteine rich protein 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CRIP2, Length 1,857 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP2-201ENST00000329146 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa36.73■■■■□ 3.47
CRIP2-201ENST00000329146 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP36.73■■■■□ 3.47
CRIP2-201ENST00000329146 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP36.72■■■■□ 3.47
CRIP2-201ENST00000329146 HMMRO75330 724 aa36.71■■■■□ 3.47
CRIP2-201ENST00000329146 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP36.71■■■■□ 3.47
CRIP2-201ENST00000329146 PXDNLA1KZ92 1463 aa36.71■■■■□ 3.47
CRIP2-201ENST00000329146 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP36.7■■■■□ 3.47
CRIP2-201ENST00000329146 GNAI3P08754 354 aa36.69■■■■□ 3.46
CRIP2-201ENST00000329146 USP21Q9UK80 565 aa36.69■■■■□ 3.46
CRIP2-201ENST00000329146 VPS72Q15906 364 aa36.68■■■■□ 3.46
CRIP2-201ENST00000329146 NECTIN2Q92692 538 aa36.68■■■■□ 3.46
CRIP2-201ENST00000329146 MRC1P22897 1456 aa36.67■■■■□ 3.46
CRIP2-201ENST00000329146 WNK3Q9BYP7 1800 aa36.67■■■■□ 3.46
CRIP2-201ENST00000329146 EXOC5O00471 708 aa36.67■■■■□ 3.46
CRIP2-201ENST00000329146 GNAI2P04899 355 aa36.67■■■■□ 3.46
CRIP2-201ENST00000329146 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP36.65■■■■□ 3.46
CRIP2-201ENST00000329146 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP36.65■■■■□ 3.46
CRIP2-201ENST00000329146 CABP4P57796 275 aa36.65■■■■□ 3.46
CRIP2-201ENST00000329146 SLC39A6Q13433 755 aa36.65■■■■□ 3.46
CRIP2-201ENST00000329146 BECN1Q14457 450 aa36.65■■■■□ 3.46
CRIP2-201ENST00000329146 BARGINQ6ZT62 677 aa36.65■■■■□ 3.46
CRIP2-201ENST00000329146 TNS2Q63HR2 1409 aa36.61■■■■□ 3.45
CRIP2-201ENST00000329146 ERVV-2B6SEH9 535 aa36.6■■■■□ 3.45
CRIP2-201ENST00000329146 AFF2P51816 1311 aa36.6■■■■□ 3.45
CRIP2-201ENST00000329146 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP36.6■■■■□ 3.45
CRIP2-201ENST00000329146 ZNF790Q6PG37 636 aa36.6■■■■□ 3.45
CRIP2-201ENST00000329146 SLC4A3P48751 1232 aa36.59■■■■□ 3.45
CRIP2-201ENST00000329146 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP36.59■■■■□ 3.45
CRIP2-201ENST00000329146 C22orf23Q9BZE7 217 aa36.59■■■■□ 3.45
CRIP2-201ENST00000329146 HEG1Q9ULI3 1381 aa36.58■■■■□ 3.45
CRIP2-201ENST00000329146 DDB1Q16531 1140 aa36.58■■■■□ 3.45
CRIP2-201ENST00000329146 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa36.58■■■■□ 3.45
CRIP2-201ENST00000329146 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP36.57■■■■□ 3.44
CRIP2-201ENST00000329146 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP36.57■■■■□ 3.44
CRIP2-201ENST00000329146 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP36.57■■■■□ 3.44
CRIP2-201ENST00000329146 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP36.54■■■■□ 3.44
CRIP2-201ENST00000329146 CHPF2Q9P2E5 772 aa36.54■■■■□ 3.44
CRIP2-201ENST00000329146 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP36.54■■■■□ 3.44
CRIP2-201ENST00000329146 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa36.54■■■■□ 3.44
CRIP2-201ENST00000329146 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP36.54■■■■□ 3.44
CRIP2-201ENST00000329146 ATP8B2P98198 1209 aa36.53■■■■□ 3.44
CRIP2-201ENST00000329146 NBR1Q14596 966 aa36.53■■■■□ 3.44
CRIP2-201ENST00000329146 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa36.52■■■■□ 3.44
CRIP2-201ENST00000329146 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa36.51■■■■□ 3.44
CRIP2-201ENST00000329146 USP44Q9H0E7 712 aa36.51■■■■□ 3.44
CRIP2-201ENST00000329146 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP36.5■■■■□ 3.43
CRIP2-201ENST00000329146 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP36.5■■■■□ 3.43
CRIP2-201ENST00000329146 TTC5Q8N0Z6 440 aa36.49■■■■□ 3.43
CRIP2-201ENST00000329146 TTC22Q5TAA0 569 aa36.48■■■■□ 3.43
CRIP2-201ENST00000329146 DNAAF4Q8WXU2 420 aa36.48■■■■□ 3.43
CRIP2-201ENST00000329146 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP36.48■■■■□ 3.43
CRIP2-201ENST00000329146 RBM25P49756 843 aaKnown RBP36.47■■■■□ 3.43
CRIP2-201ENST00000329146 TMOD3Q9NYL9 352 aa36.47■■■■□ 3.43
CRIP2-201ENST00000329146 CDC45O75419 566 aa36.46■■■■□ 3.43
CRIP2-201ENST00000329146 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP36.46■■■■□ 3.43
CRIP2-201ENST00000329146 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP36.46■■■■□ 3.43
CRIP2-201ENST00000329146 PIGBQ92521 554 aa36.45■■■■□ 3.43
CRIP2-201ENST00000329146 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP36.45■■■■□ 3.43
CRIP2-201ENST00000329146 ATRNO75882 1429 aa36.44■■■■□ 3.42
CRIP2-201ENST00000329146 PI4KAP2A4QPH2 592 aa36.43■■■■□ 3.42
CRIP2-201ENST00000329146 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP36.43■■■■□ 3.42
CRIP2-201ENST00000329146 BEND3Q5T5X7 828 aa36.43■■■■□ 3.42
CRIP2-201ENST00000329146 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa36.43■■■■□ 3.42
CRIP2-201ENST00000329146 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa36.43■■■■□ 3.42
CRIP2-201ENST00000329146 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP36.43■■■■□ 3.42
CRIP2-201ENST00000329146 GLI3P10071 1580 aa36.43■■■■□ 3.42
CRIP2-201ENST00000329146 HYPKQ9NX55 129 aa36.43■■■■□ 3.42
CRIP2-201ENST00000329146 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP36.43■■■■□ 3.42
CRIP2-201ENST00000329146 FMNL2Q96PY5 1086 aa36.42■■■■□ 3.42
CRIP2-201ENST00000329146 A0A0G2JS52 829 aa36.41■■■■□ 3.42
CRIP2-201ENST00000329146 OSBPL3Q9H4L5 887 aa36.41■■■■□ 3.42
CRIP2-201ENST00000329146 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP36.4■■■■□ 3.42
CRIP2-201ENST00000329146 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa36.39■■■■□ 3.42
CRIP2-201ENST00000329146 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP36.39■■■■□ 3.42
CRIP2-201ENST00000329146 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP36.38■■■■□ 3.41
CRIP2-201ENST00000329146 TBC1D2Q9BYX2 928 aa36.38■■■■□ 3.41
CRIP2-201ENST00000329146 LRRCC1Q9C099 1032 aa36.38■■■■□ 3.41
CRIP2-201ENST00000329146 ASAP1Q9ULH1 1129 aa36.38■■■■□ 3.41
CRIP2-201ENST00000329146 ADCY9O60503 1353 aa36.38■■■■□ 3.41
CRIP2-201ENST00000329146 APBB1O00213 710 aa36.37■■■■□ 3.41
CRIP2-201ENST00000329146 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP36.37■■■■□ 3.41
CRIP2-201ENST00000329146 KSR2Q6VAB6 950 aa36.37■■■■□ 3.41
CRIP2-201ENST00000329146 SSH3Q8TE77 659 aa36.37■■■■□ 3.41
CRIP2-201ENST00000329146 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP36.37■■■■□ 3.41
CRIP2-201ENST00000329146 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP36.37■■■■□ 3.41
CRIP2-201ENST00000329146 BCL9O00512 1426 aa36.37■■■■□ 3.41
CRIP2-201ENST00000329146 PAPPAQ13219 1627 aa36.37■■■■□ 3.41
CRIP2-201ENST00000329146 ITGB4P16144 1822 aa36.37■■■■□ 3.41
CRIP2-201ENST00000329146 ANXA1P04083 346 aa36.37■■■■□ 3.41
CRIP2-201ENST00000329146 KCPQ6ZWJ8 1503 aa36.36■■■■□ 3.41
CRIP2-201ENST00000329146 C5P01031 1676 aa36.36■■■■□ 3.41
CRIP2-201ENST00000329146 ALDH1L1O75891 902 aa36.36■■■■□ 3.41
CRIP2-201ENST00000329146 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP36.36■■■■□ 3.41
CRIP2-201ENST00000329146 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP36.35■■■■□ 3.41
CRIP2-201ENST00000329146 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP36.35■■■■□ 3.41
CRIP2-201ENST00000329146 ACSBG1Q96GR2 724 aa36.35■■■■□ 3.41
CRIP2-201ENST00000329146 HDAC5Q9UQL6 1122 aa36.35■■■■□ 3.41
CRIP2-201ENST00000329146 USP16Q9Y5T5 823 aa36.35■■■■□ 3.41
CRIP2-201ENST00000329146 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa36.35■■■■□ 3.41
CRIP2-201ENST00000329146 ATG3Q9NT62 314 aa36.35■■■■□ 3.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64.8 ms