RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516584.1

RNU6-1004P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1004, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1004P, Length 111 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ATAD3BQ5T9A4 648 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CES3Q6UWW8 571 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 COLCA1Q6ZS62 124 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RD3Q7Z3Z2 195 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 BNIPLQ7Z465 357 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZNF554Q86TJ5 538 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SATL1Q86VE3 508 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 KMT5CQ86Y97 462 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MISPQ8IVT2 679 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PRSS35Q8N3Z0 413 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 DNAJC22Q8N4W6 341 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MINDY2Q8NBR6 621 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TRPV3Q8NET8 790 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 OR52M1Q8NGK5 317 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 OLIG1Q8TAK6 271 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GRHL3Q8TE85 626 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TCHPQ9BT92 498 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GORASP2Q9H8Y8 452 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CD93Q9NPY3 652 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 COX16Q9P0S2 106 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NARFQ9UHQ1 456 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-1004P-201ENST00000516584 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ABCC4O15439 1325 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CTAGE9A4FU28 777 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TRIM49BA6NDI0 452 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-1004P-201ENST00000516584 AP3B1O00203 1094 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-1004P-201ENST00000516584 OGTO15294 1046 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CYTIPO60759 359 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MTX2O75431 263 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PMS2P2O95744 297 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-1004P-201ENST00000516584 HLA-DOBP13765 273 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CYP3A5P20815 502 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PAICSP22234 425 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GLRA2P23416 452 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PCYT1AP49585 367 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PEX5P50542 639 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-1004P-201ENST00000516584 METAP1P53582 386 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CLDN17P56750 224 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-1004P-201ENST00000516584 B3GALT5-AS1P59052 145 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-1004P-201ENST00000516584 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZXDBP98169 803 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-1004P-201ENST00000516584 HSF2Q03933 536 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PDIA5Q14554 519 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
RNU6-1004P-201ENST00000516584 OPCMLQ14982 345 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-1004P-201ENST00000516584 C9orf50Q5SZB4 431 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-1004P-201ENST00000516584 STXBP5Q5T5C0 1151 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-1004P-201ENST00000516584 C20orf194Q5TEA3 1177 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-1004P-201ENST00000516584 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ERASQ7Z444 233 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-1004P-201ENST00000516584 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CLIP4Q8N3C7 705 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-1004P-201ENST00000516584 LRRC17Q8N6Y2 441 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
RNU6-1004P-201ENST00000516584 BCORP1Q8N888 145 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-1004P-201ENST00000516584 OR10T2Q8NGX3 314 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CXorf58Q96LI9 332 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PIGQQ9BRB3 760 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-1004P-201ENST00000516584 UBAC1Q9BSL1 405 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RIOX1Q9H6W3 641 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RMND5AQ9H871 391 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-1004P-201ENST00000516584 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ACOXLQ9NUZ1 547 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-1004P-201ENST00000516584 HIF1ANQ9NWT6 349 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-1004P-201ENST00000516584 OCIAD1Q9NX40 245 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GTSE1Q9NYZ3 720 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SLC7A7Q9UM01 511 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-1004P-201ENST00000516584 VDAC3Q9Y277 283 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ATG4BQ9Y4P1 393 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-1004P-201ENST00000516584 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-1004P-201ENST00000516584 DISP3Q9P2K9 1392 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-1004P-201ENST00000516584 IL16Q14005 1332 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZNF587BE7ETH6 402 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SYT7O43581 403 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NME2P1O60361 137 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SPAG6O75602 509 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PDE9AO76083 593 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PIGNO95427 931 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SYNGR4O95473 234 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-1004P-201ENST00000516584 KRT8P05787 483 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CD59P13987 128 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-1004P-201ENST00000516584 DARSP14868 501 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZNF23P17027 643 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-1004P-201ENST00000516584 LHCGRP22888 699 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PRDX2P32119 198 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TNFRSF4P43489 277 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-1004P-201ENST00000516584 OR3A3P47888 321 aa4.51□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.7 ms