RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466861.1

SUMO3-205, Transcript of small ubiquitin-like modifier 3, humanhuman

TSL 2

Gene SUMO3, Length 753 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO3-205ENST00000466861 C14orf105Q9NVL8 296 aa22.14■■□□□ 1.13
SUMO3-205ENST00000466861 TMEM216Q9P0N5 145 aa22.14■■□□□ 1.13
SUMO3-205ENST00000466861 LGALS13Q9UHV8 139 aa22.14■■□□□ 1.13
SUMO3-205ENST00000466861 ADGRE2Q9UHX3 823 aa22.14■■□□□ 1.13
SUMO3-205ENST00000466861 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa22.14■■□□□ 1.13
SUMO3-205ENST00000466861 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa22.14■■□□□ 1.13
SUMO3-205ENST00000466861 A0A1W2PPM1 405 aa22.13■■□□□ 1.13
SUMO3-205ENST00000466861 E2F3O00716 465 aa22.13■■□□□ 1.13
SUMO3-205ENST00000466861 SBK3P0C264 359 aa22.13■■□□□ 1.13
SUMO3-205ENST00000466861 PRKAR1AP10644 381 aa22.13■■□□□ 1.13
SUMO3-205ENST00000466861 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
SUMO3-205ENST00000466861 GTF2H2Q13888 395 aa22.13■■□□□ 1.13
SUMO3-205ENST00000466861 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa22.13■■□□□ 1.13
SUMO3-205ENST00000466861 BORAQ6PGQ7 559 aa22.13■■□□□ 1.13
SUMO3-205ENST00000466861 ABHD13Q7L211 337 aa22.13■■□□□ 1.13
SUMO3-205ENST00000466861 KCT2Q8NC54 265 aa22.13■■□□□ 1.13
SUMO3-205ENST00000466861 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
SUMO3-205ENST00000466861 GRID1Q9ULK0 1009 aa22.13■■□□□ 1.13
SUMO3-205ENST00000466861 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
SUMO3-205ENST00000466861 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
SUMO3-205ENST00000466861 ANKDD1BA6NHY2 528 aa22.12■■□□□ 1.13
SUMO3-205ENST00000466861 I3L1I5 382 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
SUMO3-205ENST00000466861 GOLGA8RI6L899 631 aa22.12■■□□□ 1.13
SUMO3-205ENST00000466861 PCDH17O14917 1159 aa22.12■■□□□ 1.13
SUMO3-205ENST00000466861 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
SUMO3-205ENST00000466861 IGHEP01854 428 aa22.12■■□□□ 1.13
SUMO3-205ENST00000466861 CYC1P08574 325 aa22.12■■□□□ 1.13
SUMO3-205ENST00000466861 IL10P22301 178 aa22.12■■□□□ 1.13
SUMO3-205ENST00000466861 CRHR1P34998 444 aa22.12■■□□□ 1.13
SUMO3-205ENST00000466861 SLC9A5Q14940 896 aa22.12■■□□□ 1.13
SUMO3-205ENST00000466861 GRHL2Q6ISB3 625 aa22.12■■□□□ 1.13
SUMO3-205ENST00000466861 SLC22A9Q8IVM8 553 aa22.12■■□□□ 1.13
SUMO3-205ENST00000466861 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP22.12■■□□□ 1.13
SUMO3-205ENST00000466861 LAS2Q8IYD9 372 aa22.12■■□□□ 1.13
SUMO3-205ENST00000466861 CYP4X1Q8N118 509 aa22.12■■□□□ 1.13
SUMO3-205ENST00000466861 AMER3Q8N944 861 aa22.12■■□□□ 1.13
SUMO3-205ENST00000466861 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
SUMO3-205ENST00000466861 CCDC126Q96EE4 140 aa22.12■■□□□ 1.13
SUMO3-205ENST00000466861 PHF21BQ96EK2 531 aa22.12■■□□□ 1.13
SUMO3-205ENST00000466861 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
SUMO3-205ENST00000466861 SPSB2Q99619 263 aa22.12■■□□□ 1.13
SUMO3-205ENST00000466861 MKS1Q9NXB0 559 aa22.12■■□□□ 1.13
SUMO3-205ENST00000466861 MAU2Q9Y6X3 613 aa22.12■■□□□ 1.13
SUMO3-205ENST00000466861 SCN3AQ9NY46 2000 aa22.12■■□□□ 1.13
SUMO3-205ENST00000466861 CDC14CA4D256 554 aa22.11■■□□□ 1.13
SUMO3-205ENST00000466861 SMIM23A6NLE4 172 aa22.11■■□□□ 1.13
SUMO3-205ENST00000466861 A8MT66 165 aa22.11■■□□□ 1.13
SUMO3-205ENST00000466861 RPS17P08708 135 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
SUMO3-205ENST00000466861 SMIM10L1P0DMW3 83 aa22.11■■□□□ 1.13
SUMO3-205ENST00000466861 ALOX12P18054 663 aa22.11■■□□□ 1.13
SUMO3-205ENST00000466861 CD22P20273 847 aa22.11■■□□□ 1.13
SUMO3-205ENST00000466861 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
SUMO3-205ENST00000466861 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
SUMO3-205ENST00000466861 CYP4F2P78329 520 aa22.11■■□□□ 1.13
SUMO3-205ENST00000466861 SLC18A2Q05940 514 aa22.11■■□□□ 1.13
SUMO3-205ENST00000466861 IL10RAQ13651 578 aa22.11■■□□□ 1.13
SUMO3-205ENST00000466861 TBR1Q16650 682 aa22.11■■□□□ 1.13
SUMO3-205ENST00000466861 CCDC153Q494R4 210 aa22.11■■□□□ 1.13
SUMO3-205ENST00000466861 MED27Q6P2C8 311 aa22.11■■□□□ 1.13
SUMO3-205ENST00000466861 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa22.11■■□□□ 1.13
SUMO3-205ENST00000466861 CROCCP2Q86T23 111 aa22.11■■□□□ 1.13
SUMO3-205ENST00000466861 OR2W6PQ8NHA6 318 aa22.11■■□□□ 1.13
SUMO3-205ENST00000466861 STT3BQ8TCJ2 826 aa22.11■■□□□ 1.13
SUMO3-205ENST00000466861 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
SUMO3-205ENST00000466861 SMIM10Q96HG1 83 aa22.11■■□□□ 1.13
SUMO3-205ENST00000466861 VPS50Q96JG6 964 aa22.11■■□□□ 1.13
SUMO3-205ENST00000466861 NTMT1Q9BV86 223 aa22.11■■□□□ 1.13
SUMO3-205ENST00000466861 IPPKQ9H8X2 491 aa22.11■■□□□ 1.13
SUMO3-205ENST00000466861 SEMA3GQ9NS98 782 aa22.11■■□□□ 1.13
SUMO3-205ENST00000466861 PCTPQ9UKL6 214 aa22.11■■□□□ 1.13
SUMO3-205ENST00000466861 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
SUMO3-205ENST00000466861 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
SUMO3-205ENST00000466861 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa22.11■■□□□ 1.13
SUMO3-205ENST00000466861 TLDC2A0PJX2 215 aa22.1■■□□□ 1.13
SUMO3-205ENST00000466861 CCDC151A5D8V7 595 aa22.1■■□□□ 1.13
SUMO3-205ENST00000466861 ERLIN1O75477 346 aa22.1■■□□□ 1.13
SUMO3-205ENST00000466861 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
SUMO3-205ENST00000466861 ZGLP1P0C6A0 271 aa22.1■■□□□ 1.13
SUMO3-205ENST00000466861 CCR10P46092 362 aa22.1■■□□□ 1.13
SUMO3-205ENST00000466861 NAA20P61599 178 aa22.1■■□□□ 1.13
SUMO3-205ENST00000466861 HYAL2Q12891 473 aa22.1■■□□□ 1.13
SUMO3-205ENST00000466861 ADPRMQ3LIE5 342 aa22.1■■□□□ 1.13
SUMO3-205ENST00000466861 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
SUMO3-205ENST00000466861 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
SUMO3-205ENST00000466861 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
SUMO3-205ENST00000466861 L3MBTL4Q8NA19 623 aa22.1■■□□□ 1.13
SUMO3-205ENST00000466861 OR9A4Q8NGU2 314 aa22.1■■□□□ 1.13
SUMO3-205ENST00000466861 RDH11Q8TC12 318 aa22.1■■□□□ 1.13
SUMO3-205ENST00000466861 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
SUMO3-205ENST00000466861 GAL3ST3Q96A11 431 aa22.1■■□□□ 1.13
SUMO3-205ENST00000466861 MIEF2Q96C03 454 aa22.1■■□□□ 1.13
SUMO3-205ENST00000466861 REPS1Q96D71 796 aa22.1■■□□□ 1.13
SUMO3-205ENST00000466861 MOCOSQ96EN8 888 aa22.1■■□□□ 1.13
SUMO3-205ENST00000466861 MACROD1Q9BQ69 325 aa22.1■■□□□ 1.13
SUMO3-205ENST00000466861 ADNPQ9H2P0 1102 aa22.1■■□□□ 1.13
SUMO3-205ENST00000466861 TRPC4Q9UBN4 977 aa22.1■■□□□ 1.13
SUMO3-205ENST00000466861 CTSFQ9UBX1 484 aa22.1■■□□□ 1.13
SUMO3-205ENST00000466861 PLAAQ9Y263 795 aa22.1■■□□□ 1.13
SUMO3-205ENST00000466861 MGAQ8IWI9 3026 aa22.09■■□□□ 1.13
SUMO3-205ENST00000466861 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
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