RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000263012.10

NOMO3-201, Transcript of NODAL modulator 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NOMO3, Length 3,911 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOMO3-201ENST00000263012 MED27Q6P2C8 311 aa17.09■□□□□ 0.33
NOMO3-201ENST00000263012 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP17.09■□□□□ 0.33
NOMO3-201ENST00000263012 CNTN4Q8IWV2 1026 aa17.09■□□□□ 0.33
NOMO3-201ENST00000263012 RPS17P08708 135 aaKnown RBP17.09■□□□□ 0.33
NOMO3-201ENST00000263012 SLC6A4P31645 630 aa17.09■□□□□ 0.33
NOMO3-201ENST00000263012 SEMA3BQ13214 749 aa17.09■□□□□ 0.33
NOMO3-201ENST00000263012 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP17.09■□□□□ 0.337e-6■■□□□ 12.3
NOMO3-201ENST00000263012 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP17.09■□□□□ 0.33
NOMO3-201ENST00000263012 RTP2Q5QGT7 225 aa17.09■□□□□ 0.33
NOMO3-201ENST00000263012 GPRC6AQ5T6X5 926 aa17.09■□□□□ 0.33
NOMO3-201ENST00000263012 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa17.09■□□□□ 0.33
NOMO3-201ENST00000263012 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP17.09■□□□□ 0.33
NOMO3-201ENST00000263012 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa17.09■□□□□ 0.33
NOMO3-201ENST00000263012 FAM172BPA6NC97 362 aa17.09■□□□□ 0.33
NOMO3-201ENST00000263012 TLR4O00206 839 aa17.09■□□□□ 0.33
NOMO3-201ENST00000263012 HTR7P34969 479 aa17.09■□□□□ 0.33
NOMO3-201ENST00000263012 EMP3P54852 163 aa17.09■□□□□ 0.33
NOMO3-201ENST00000263012 STX4Q12846 297 aa17.09■□□□□ 0.33
NOMO3-201ENST00000263012 MTAPQ13126 283 aa17.09■□□□□ 0.33
NOMO3-201ENST00000263012 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP17.09■□□□□ 0.33
NOMO3-201ENST00000263012 MTSS1LQ765P7 747 aa17.09■□□□□ 0.33
NOMO3-201ENST00000263012 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP17.09■□□□□ 0.33
NOMO3-201ENST00000263012 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP17.09■□□□□ 0.33
NOMO3-201ENST00000263012 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP17.09■□□□□ 0.33
NOMO3-201ENST00000263012 RAB42Q8N4Z0 105 aa17.09■□□□□ 0.33
NOMO3-201ENST00000263012 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP17.09■□□□□ 0.33
NOMO3-201ENST00000263012 TARM1B6A8C7 271 aa17.08■□□□□ 0.33
NOMO3-201ENST00000263012 E2F3O00716 465 aa17.08■□□□□ 0.33
NOMO3-201ENST00000263012 CCL16O15467 120 aa17.08■□□□□ 0.33
NOMO3-201ENST00000263012 EBLN1P0CF75 366 aa17.08■□□□□ 0.33
NOMO3-201ENST00000263012 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP17.08■□□□□ 0.33
NOMO3-201ENST00000263012 CELP19835 753 aa17.08■□□□□ 0.33
NOMO3-201ENST00000263012 CA5AP35218 305 aa17.08■□□□□ 0.33
NOMO3-201ENST00000263012 TIE1P35590 1138 aa17.08■□□□□ 0.33
NOMO3-201ENST00000263012 RORCP51449 518 aa17.08■□□□□ 0.33
NOMO3-201ENST00000263012 AGTRAPQ6RW13 159 aa17.08■□□□□ 0.33
NOMO3-201ENST00000263012 NT5C3BQ969T7 300 aa17.08■□□□□ 0.33
NOMO3-201ENST00000263012 HDHD5Q9BXW7 423 aa17.08■□□□□ 0.33
NOMO3-201ENST00000263012 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP17.08■□□□□ 0.33
NOMO3-201ENST00000263012 SLC30A4O14863 429 aa17.08■□□□□ 0.32
NOMO3-201ENST00000263012 ZNF33AQ06730 810 aa17.08■□□□□ 0.32
NOMO3-201ENST00000263012 ZMYND11Q15326 602 aa17.08■□□□□ 0.32
NOMO3-201ENST00000263012 MTFR2Q6P444 385 aa17.08■□□□□ 0.32
NOMO3-201ENST00000263012 SLC43A3Q8NBI5 491 aa17.08■□□□□ 0.32
NOMO3-201ENST00000263012 STARD8Q92502 1023 aa17.08■□□□□ 0.32
NOMO3-201ENST00000263012 MYEOVQ96EZ4 313 aa17.08■□□□□ 0.32
NOMO3-201ENST00000263012 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP17.08■□□□□ 0.32
NOMO3-201ENST00000263012 KCNH4Q9UQ05 1017 aa17.08■□□□□ 0.32
NOMO3-201ENST00000263012 SEC16AO15027 2179 aa17.08■□□□□ 0.32
NOMO3-201ENST00000263012 ANXA8P13928 327 aa17.08■□□□□ 0.32
NOMO3-201ENST00000263012 CNR2P34972 360 aa17.08■□□□□ 0.32
NOMO3-201ENST00000263012 SLC11A1P49279 550 aa17.08■□□□□ 0.32
NOMO3-201ENST00000263012 ARPC4P59998 168 aa17.08■□□□□ 0.32
NOMO3-201ENST00000263012 BCL7AQ4VC05 210 aa17.08■□□□□ 0.32
NOMO3-201ENST00000263012 SPRYD7Q5W111 196 aa17.08■□□□□ 0.32
NOMO3-201ENST00000263012 STEAP3Q658P3 488 aa17.08■□□□□ 0.32
NOMO3-201ENST00000263012 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa17.08■□□□□ 0.32
NOMO3-201ENST00000263012 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP17.08■□□□□ 0.32
NOMO3-201ENST00000263012 DNAJA3Q96EY1 480 aa17.08■□□□□ 0.32
NOMO3-201ENST00000263012 SIPA1Q96FS4 1042 aa17.08■□□□□ 0.32
NOMO3-201ENST00000263012 ACPTQ9BZG2 426 aa17.08■□□□□ 0.32
NOMO3-201ENST00000263012 MMP27Q9H306 513 aa17.08■□□□□ 0.32
NOMO3-201ENST00000263012 B4GALT6Q9UBX8 382 aa17.08■□□□□ 0.32
NOMO3-201ENST00000263012 PGAP2Q9UHJ9 254 aa17.08■□□□□ 0.32
NOMO3-201ENST00000263012 SPEF1Q9Y4P9 236 aa17.08■□□□□ 0.32
NOMO3-201ENST00000263012 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa17.08■□□□□ 0.32
NOMO3-201ENST00000263012 OR1F1O43749 312 aa17.07■□□□□ 0.32
NOMO3-201ENST00000263012 CLCN4P51793 760 aa17.07■□□□□ 0.32
NOMO3-201ENST00000263012 ITGA1P56199 1179 aa17.07■□□□□ 0.32
NOMO3-201ENST00000263012 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP17.07■□□□□ 0.32
NOMO3-201ENST00000263012 PRKCZQ05513 592 aa17.07■□□□□ 0.32
NOMO3-201ENST00000263012 SPRED1Q7Z699 444 aa17.07■□□□□ 0.32
NOMO3-201ENST00000263012 NPAS3Q8IXF0 933 aa17.07■□□□□ 0.32
NOMO3-201ENST00000263012 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP17.07■□□□□ 0.32
NOMO3-201ENST00000263012 CHPT1Q8WUD6 406 aa17.07■□□□□ 0.32
NOMO3-201ENST00000263012 IL26Q9NPH9 171 aa17.07■□□□□ 0.32
NOMO3-201ENST00000263012 ERVK-11Q9UQG0 969 aa17.07■□□□□ 0.32
NOMO3-201ENST00000263012 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP17.07■□□□□ 0.32
NOMO3-201ENST00000263012 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP17.07■□□□□ 0.32
NOMO3-201ENST00000263012 INAVAQ3KP66 663 aa17.07■□□□□ 0.32
NOMO3-201ENST00000263012 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP17.07■□□□□ 0.32
NOMO3-201ENST00000263012 TMCO6Q96DC7 493 aa17.07■□□□□ 0.32
NOMO3-201ENST00000263012 CENPOQ9BU64 300 aa17.07■□□□□ 0.32
NOMO3-201ENST00000263012 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa17.07■□□□□ 0.32
NOMO3-201ENST00000263012 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP17.07■□□□□ 0.32
NOMO3-201ENST00000263012 KCNH6Q9H252 994 aa17.07■□□□□ 0.32
NOMO3-201ENST00000263012 NLKQ9UBE8 527 aa17.07■□□□□ 0.32
NOMO3-201ENST00000263012 ENOPH1Q9UHY7 261 aa17.07■□□□□ 0.32
NOMO3-201ENST00000263012 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa17.07■□□□□ 0.32
NOMO3-201ENST00000263012 ISM1B1AKI9 464 aa17.07■□□□□ 0.32
NOMO3-201ENST00000263012 EPOP01588 193 aa17.07■□□□□ 0.32
NOMO3-201ENST00000263012 NDUFA5Q16718 116 aa17.07■□□□□ 0.32
NOMO3-201ENST00000263012 NXPE1Q8N323 547 aa17.07■□□□□ 0.32
NOMO3-201ENST00000263012 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP17.07■□□□□ 0.32
NOMO3-201ENST00000263012 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP17.07■□□□□ 0.32
NOMO3-201ENST00000263012 TBC1D3BA6NDS4 549 aa17.06■□□□□ 0.32
NOMO3-201ENST00000263012 I3L521 148 aa17.06■□□□□ 0.32
NOMO3-201ENST00000263012 ACPPP15309 386 aa17.06■□□□□ 0.32
NOMO3-201ENST00000263012 AKR1D1P51857 326 aa17.06■□□□□ 0.32
NOMO3-201ENST00000263012 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.3 ms