RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000443528.5

ACTB-206, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 4

Gene ACTB, Length 569 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-206ENST00000443528 AIF1LQ9BQI0 150 aa14.94□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa14.94□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 CAPS2Q9BXY5 557 aa14.94□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 DRC3Q9H069 523 aa14.94□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 WDR54Q9H977 334 aa14.94□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP14.94□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 ZFP69BQ9UJL9 534 aa14.94□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 CDC14AQ9UNH5 594 aa14.94□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 V9GYY5 206 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 CACNA1GO43497 2377 aa14.93□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 PCSK5Q92824 1860 aa14.93□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa14.93□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 TK2O00142 265 aa14.93□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 KLK8O60259 260 aa14.93□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 COL6A2P12110 1019 aa14.93□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 FBLP22087 321 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 AHRP35869 848 aa14.93□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 POLE2P56282 527 aa14.93□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 DSG2Q14126 1118 aa14.93□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 PDK4Q16654 411 aa14.93□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 LGSNQ5TDP6 509 aa14.93□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa14.93□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 TBC1D19Q8N5T2 526 aa14.93□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 SNX31Q8N9S9 440 aa14.93□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 OR9A4Q8NGU2 314 aa14.93□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 NT5CQ8TCD5 201 aa14.93□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 MTBPQ96DY7 904 aa14.93□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa14.93□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa14.93□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 LRRC14BA6NHZ5 514 aa14.92□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 FFAR3O14843 346 aa14.92□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 CLGNO14967 610 aa14.92□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 GPR42O15529 346 aa14.92□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 NDUFS4O43181 175 aa14.92□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 NSA2O95478 260 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 PRB1P04280 392 aa14.92□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 SLC35G6P0C7Q6 338 aa14.92□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 IL1RNP18510 177 aa14.92□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 CD22P20273 847 aa14.92□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 OTX2P32243 289 aa14.92□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 HYAL2Q12891 473 aa14.92□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 PWP1Q13610 501 aa14.92□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP14.92□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 SETDB1Q15047 1291 aa14.92□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 PFKFB4Q16877 469 aa14.92□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 SYT16Q17RD7 645 aa14.92□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 VWA2Q5GFL6 755 aa14.92□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 WDR93Q6P2C0 686 aa14.92□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa14.92□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 SHISA5Q8N114 240 aa14.92□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa14.92□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 STT3BQ8TCJ2 826 aa14.92□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 MZB1Q8WU39 189 aa14.92□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 WDR34Q96EX3 536 aa14.92□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 CCDC77Q9BR77 488 aa14.92□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 EHD1Q9H4M9 534 aa14.92□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 COPG2Q9UBF2 871 aa14.92□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 SLC22A7Q9Y694 548 aa14.92□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa14.91□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 ARGFXA6NJG6 315 aa14.91□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 K7EPI3 171 aa14.91□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP14.91□□□□□ -0.022e-11■■■□□ 17.4
ACTB-206ENST00000443528 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 SERPIND1P05546 499 aa14.91□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 RBP1P09455 135 aa14.91□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 SBK3P0C264 359 aa14.91□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 ZGLP1P0C6A0 271 aa14.91□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 GFAPP14136 432 aa14.91□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 KLC1Q07866 573 aa14.91□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 ATP1A4Q13733 1029 aa14.91□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 DOC2AQ14183 400 aa14.91□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 E2F2Q14209 437 aa14.91□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa14.91□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa14.91□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 CPZQ66K79 652 aa14.91□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa14.91□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa14.91□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 MRGPREQ86SM8 312 aa14.91□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 LAPTM4BQ86VI4 370 aa14.91□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 PDSS2Q86YH6 399 aa14.91□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 RAB43Q86YS6 212 aa14.91□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP14.91□□□□□ -0.022e-7■■□□□ 14.5
ACTB-206ENST00000443528 TMEM151AQ8N4L1 468 aa14.91□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa14.91□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 TRPV3Q8NET8 790 aa14.91□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 CREB3L4Q8TEY5 395 aa14.91□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 TRIM55Q9BYV6 548 aa14.91□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 SLC6A16Q9GZN6 736 aa14.91□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 AICDAQ9GZX7 198 aa14.91□□□□□ -0.02
ACTB-206ENST00000443528 NT5DC2Q9H857 520 aa14.91□□□□□ -0.02
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