RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496050.1

SSR3-208, Transcript of signal sequence receptor subunit 3, human

TSL 4 BASIC

Gene SSR3, Length 579 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SSR3-208	ENST00000496050	AP2M1	Q96CW1	435 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	LMLN	Q96KR4	655 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	UHRF2	Q96PU4	802 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	CTAGE1	Q96RT6	745 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	ALKBH7	Q9BT30	221 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	RAB9B	Q9NP90	201 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	ZNF624	Q9P2J8	865 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	NOCT	Q9UK39	431 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	PRDM4	Q9UKN5	801 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	PFAS	O15067	1338 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	FAM72C	H0Y354	149 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	CACNB4	O00305	520 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	AKAP3	O75969	853 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	BAG3	O95817	575 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	CLPTM1	O96005	669 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	PAK4	O96013	591 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	HMOX1	P09601	288 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	THEGL	P0DJG4	465 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	ERVK-10	P10266	1014 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	DLAT	P10515	647 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	DUT	P33316	252 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	OR3A3	P47888	321 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	SERPINH1	P50454	418 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	DNA2	P51530	1060 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	LINC01547	P58512	204 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	RBM39	Q14498	530 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	AARD	Q4LEZ3	155 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	FAM76B	Q5HYJ3	339 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	FGD3	Q5JSP0	725 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	FAM72A	Q5TYM5	149 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	ARHGEF16	Q5VV41	709 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	PM20D1	Q6GTS8	502 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	FAM72D	Q6L9T8	149 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	ALKBH5	Q6P6C2	394 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	CPEB2	Q7Z5Q1	589 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	FAM72B	Q86X60	149 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	AQP12A	Q8IXF9	295 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	CHCHD4	Q8N4Q1	142 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	CNBD1	Q8NA66	436 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	SLC37A3	Q8NCC5	494 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	OR4C15	Q8NGM1	316 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	OR4C3	Q8NH37	302 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	CFAP36	Q96G28	342 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	SENP5	Q96HI0	755 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	LPAR4	Q99677	370 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	NAPB	Q9H115	298 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	ICAM5	Q9UMF0	924 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	PMS2P5	A8MQ11	134 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	SNURFL	B1AK76	121 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	BLOC1S5-TXNDC5	H3BN57	136 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050		M0R296	226 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	CCL24	O00175	119 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	MT-ND3	P03897	115 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	ATP1B1	P05026	303 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	FAM157C	P0CG43	387 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	CD59	P13987	128 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	ANOS1	P23352	680 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	CLDN17	P56750	224 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	TRIM29	Q14134	588 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	ZNF542P	Q5EBM4	170 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	KLHL10	Q6JEL2	608 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	PLBD1	Q6P4A8	553 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	ZNF790	Q6PG37	636 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	TMEM207	Q6UWW9	146 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	LSMEM2	Q8N112	164 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	GPC2	Q8N158	579 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	ARHGAP45	Q92619	1136 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	DYRK2	Q92630	601 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	BCL2L2	Q92843	193 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	ZNF524	Q96C55	264 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	C5orf30	Q96GV9	206 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	RBM41	Q96IZ5	413 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	PANX3	Q96QZ0	392 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	RASL10B	Q96S79	203 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	NKX3-1	Q99801	234 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	PRMT1	Q99873	361 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	ZNF559	Q9BR84	538 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	OSBPL8	Q9BZF1	889 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	MOSPD1	Q9UJG1	213 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	TCF19	Q9Y242	345 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	NCKAP1	Q9Y2A7	1128 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	ZNF510	Q9Y2H8	683 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	STK36	Q9NRP7	1315 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050		A0A0A6YYC8	382 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	MAGEB16	A2A368	324 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	ANTXRL	A6NF34	631 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050		I3L1I5	382 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	GRAP2	O75791	330 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	AP2A2	O94973	939 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	VTN	P04004	478 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	GPI	P06744	558 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	P4HA1	P13674	534 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	ELAVL4	P26378	380 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	MAGEB1	P43366	347 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	PPA1	Q15181	289 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	PTPN14	Q15678	1187 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	MAPK11	Q15759	364 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	EXT1	Q16394	746 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	GTDC1	Q4AE62	458 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	ARMCX4	Q5H9R4	360 aa		4.85	□□□□□ -1.63

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