RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453216.1

TRAM2-AS1-201, Transcript of TRAM2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAM2-AS1, Length 664 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BCORP1Q8N888 145 aa24.8■■□□□ 1.56
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 METTL21AQ8WXB1 218 aa24.8■■□□□ 1.56
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HAS2Q92819 552 aa24.8■■□□□ 1.56
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OSGIN2Q9Y236 505 aa24.8■■□□□ 1.56
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TRAV17A0A0B4J275 112 aa24.79■■□□□ 1.56
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC16A5O15375 505 aa24.79■■□□□ 1.56
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 COL8A1P27658 744 aa24.79■■□□□ 1.56
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TNFSF10P50591 281 aa24.79■■□□□ 1.56
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 EFNA3P52797 238 aa24.79■■□□□ 1.56
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PAQR3Q6TCH7 311 aa24.79■■□□□ 1.56
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa24.79■■□□□ 1.56
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CAMKVQ8NCB2 501 aa24.79■■□□□ 1.56
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MACROD1Q9BQ69 325 aa24.79■■□□□ 1.56
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLX1AQ9BQ83 275 aa24.79■■□□□ 1.56
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NAT9Q9BTE0 207 aa24.79■■□□□ 1.56
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TUBB6Q9BUF5 446 aa24.79■■□□□ 1.56
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ATG10Q9H0Y0 220 aa24.79■■□□□ 1.56
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OLAHQ9NV23 265 aa24.79■■□□□ 1.56
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SNX12Q9UMY4 172 aa24.79■■□□□ 1.56
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SH2B3Q9UQQ2 575 aa24.79■■□□□ 1.56
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CES2O00748 559 aa24.78■■□□□ 1.56
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BANF1O75531 89 aa24.78■■□□□ 1.56
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 JRKO75564 520 aa24.78■■□□□ 1.56
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ITGAMP11215 1152 aa24.78■■□□□ 1.56
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CCND1P24385 295 aa24.78■■□□□ 1.56
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GABRB3P28472 473 aa24.78■■□□□ 1.56
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CDKN2DP55273 166 aa24.78■■□□□ 1.56
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NAE1Q13564 534 aa24.78■■□□□ 1.56
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MFSD4BQ5TF39 518 aa24.78■■□□□ 1.56
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KIAA0408Q6ZU52 694 aa24.78■■□□□ 1.56
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PRSS41Q7RTY9 318 aa24.78■■□□□ 1.56
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PCGF5Q86SE9 256 aa24.78■■□□□ 1.56
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LINGO1Q96FE5 620 aa24.78■■□□□ 1.56
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IMMP1LQ96LU5 166 aa24.78■■□□□ 1.56
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 VN1R1Q9GZP7 353 aa24.78■■□□□ 1.56
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FEZF1A0PJY2 475 aa24.77■■□□□ 1.56
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LRRTM2O43300 516 aa24.77■■□□□ 1.56
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 AHSGP02765 367 aa24.77■■□□□ 1.56
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IL1RNP18510 177 aa24.77■■□□□ 1.56
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HIST1H2ADP20671 130 aa24.77■■□□□ 1.56
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MINDY4Q4G0A6 757 aa24.77■■□□□ 1.56
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MSS51Q4VC12 460 aa24.77■■□□□ 1.56
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CNTN4Q8IWV2 1026 aa24.77■■□□□ 1.56
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OR51Q1Q8NH59 317 aa24.77■■□□□ 1.56
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TM4SF19Q96DZ7 209 aa24.77■■□□□ 1.56
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa24.77■■□□□ 1.56
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CYTH2Q99418 400 aa24.77■■□□□ 1.56
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HIST1H2AJQ99878 128 aa24.77■■□□□ 1.56
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 H2AFJQ9BTM1 129 aa24.77■■□□□ 1.56
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SGPP1Q9BX95 441 aa24.77■■□□□ 1.56
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP24.77■■□□□ 1.56
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HCN3Q9P1Z3 774 aa24.77■■□□□ 1.56
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ITPR2Q14571 2701 aa24.77■■□□□ 1.56
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZSCAN12O43309 604 aa24.76■■□□□ 1.55
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 F10P00742 488 aa24.76■■□□□ 1.55
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CYC1P08574 325 aa24.76■■□□□ 1.55
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GRK3P35626 688 aa24.76■■□□□ 1.55
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BCL6P41182 706 aa24.76■■□□□ 1.55
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 XCR1P46094 333 aa24.76■■□□□ 1.55
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PER3P56645 1201 aa24.76■■□□□ 1.55
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 INAQ16352 499 aa24.76■■□□□ 1.55
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BBS9Q3SYG4 887 aa24.76■■□□□ 1.55
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ABHD17BQ5VST6 288 aa24.76■■□□□ 1.55
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF787Q6DD87 383 aa24.76■■□□□ 1.55
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LCTLQ6UWM7 567 aa24.76■■□□□ 1.55
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ASPGQ86U10 573 aa24.76■■□□□ 1.55
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa24.76■■□□□ 1.55
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CERS2Q96G23 380 aa24.76■■□□□ 1.55
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FAM129AQ9BZQ8 928 aa24.76■■□□□ 1.55
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ANKHQ9HCJ1 492 aa24.76■■□□□ 1.55
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SVILO95425 2214 aa24.76■■□□□ 1.55
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CELSR2Q9HCU4 2923 aa24.75■■□□□ 1.55
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SGK494L7N484 410 aa24.75■■□□□ 1.55
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 WDPCPO95876 746 aa24.75■■□□□ 1.55
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CDH1P12830 882 aa24.75■■□□□ 1.55
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IL2P60568 153 aa24.75■■□□□ 1.55
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PHKG1Q16816 387 aa24.75■■□□□ 1.55
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa24.75■■□□□ 1.55
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LANCL3Q6ZV70 420 aa24.75■■□□□ 1.55
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC26A11Q86WA9 606 aa24.75■■□□□ 1.55
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IGDCC3Q8IVU1 814 aa24.75■■□□□ 1.55
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 AMER2Q8N7J2 671 aa24.75■■□□□ 1.55
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KCT2Q8NC54 265 aa24.75■■□□□ 1.55
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC13A3Q8WWT9 602 aa24.75■■□□□ 1.55
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HAUS8Q9BT25 410 aa24.75■■□□□ 1.55
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RNF32Q9H0A6 362 aa24.75■■□□□ 1.55
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.7 ms