RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000452576.6

VWDE-203, Transcript of von Willebrand factor D and EGF domains, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene VWDE, Length 5,936 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWDE-203ENST00000452576 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP11.95□□□□□ -0.5
VWDE-203ENST00000452576 PSMG2Q969U7 264 aa11.95□□□□□ -0.5
VWDE-203ENST00000452576 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
VWDE-203ENST00000452576 SDHAF3Q9NRP4 125 aa11.95□□□□□ -0.5
VWDE-203ENST00000452576 DNM1LO00429 736 aa11.95□□□□□ -0.5
VWDE-203ENST00000452576 ARL6IP5O75915 188 aa11.95□□□□□ -0.5
VWDE-203ENST00000452576 LAG3P18627 525 aa11.95□□□□□ -0.5
VWDE-203ENST00000452576 GSTM3P21266 225 aa11.95□□□□□ -0.5
VWDE-203ENST00000452576 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
VWDE-203ENST00000452576 MON1BQ7L1V2 547 aa11.95□□□□□ -0.5
VWDE-203ENST00000452576 IL31RAQ8NI17 732 aa11.95□□□□□ -0.5
VWDE-203ENST00000452576 C7orf34Q96L11 122 aa11.95□□□□□ -0.5
VWDE-203ENST00000452576 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
VWDE-203ENST00000452576 ORAI3Q9BRQ5 295 aa11.95□□□□□ -0.5
VWDE-203ENST00000452576 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
VWDE-203ENST00000452576 TMEM184CQ9NVA4 438 aa11.95□□□□□ -0.5
VWDE-203ENST00000452576 TAS2R10Q9NYW0 307 aa11.95□□□□□ -0.5
VWDE-203ENST00000452576 KLRF1Q9NZS2 232 aa11.95□□□□□ -0.5
VWDE-203ENST00000452576 FLRT1Q9NZU1 646 aa11.95□□□□□ -0.5
VWDE-203ENST00000452576 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa11.95□□□□□ -0.5
VWDE-203ENST00000452576 CILPO75339 1184 aa11.95□□□□□ -0.5
VWDE-203ENST00000452576 FOSL1P15407 271 aa11.95□□□□□ -0.5
VWDE-203ENST00000452576 CD72P21854 359 aa11.95□□□□□ -0.5
VWDE-203ENST00000452576 ZNF81P51508 661 aa11.95□□□□□ -0.5
VWDE-203ENST00000452576 MAP2K5Q13163 448 aa11.95□□□□□ -0.5
VWDE-203ENST00000452576 CCDC58Q4VC31 144 aa11.95□□□□□ -0.5
VWDE-203ENST00000452576 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
VWDE-203ENST00000452576 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
VWDE-203ENST00000452576 NFKBIDQ8NI38 313 aa11.95□□□□□ -0.5
VWDE-203ENST00000452576 ABHD5Q8WTS1 349 aa11.95□□□□□ -0.5
VWDE-203ENST00000452576 SSX3Q99909 188 aa11.95□□□□□ -0.5
VWDE-203ENST00000452576 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
VWDE-203ENST00000452576 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa11.95□□□□□ -0.5
VWDE-203ENST00000452576 A0A1B0GVI7 797 aa11.95□□□□□ -0.5
VWDE-203ENST00000452576 VSTM5A8MXK1 200 aa11.95□□□□□ -0.5
VWDE-203ENST00000452576 K7EPI3 171 aa11.95□□□□□ -0.5
VWDE-203ENST00000452576 PI15O43692 258 aa11.95□□□□□ -0.5
VWDE-203ENST00000452576 LRCH4O75427 683 aa11.95□□□□□ -0.5
VWDE-203ENST00000452576 TRAPPC6AO75865 159 aa11.95□□□□□ -0.5
VWDE-203ENST00000452576 MMP8P22894 467 aa11.95□□□□□ -0.5
VWDE-203ENST00000452576 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
VWDE-203ENST00000452576 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
VWDE-203ENST00000452576 RHDQ02161 417 aa11.95□□□□□ -0.5
VWDE-203ENST00000452576 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP11.95□□□□□ -0.5
VWDE-203ENST00000452576 GARNL3Q5VVW2 1013 aa11.95□□□□□ -0.5
VWDE-203ENST00000452576 NUDT13Q86X67 352 aa11.95□□□□□ -0.5
VWDE-203ENST00000452576 SHKBP1Q8TBC3 707 aa11.95□□□□□ -0.5
VWDE-203ENST00000452576 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
VWDE-203ENST00000452576 EBF4Q9BQW3 602 aa11.95□□□□□ -0.5
VWDE-203ENST00000452576 DPEP3Q9H4B8 488 aa11.95□□□□□ -0.5
VWDE-203ENST00000452576 RIC1Q4ADV7 1423 aa11.95□□□□□ -0.5
VWDE-203ENST00000452576 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa11.95□□□□□ -0.5
VWDE-203ENST00000452576 NDUFS4O43181 175 aa11.95□□□□□ -0.5
VWDE-203ENST00000452576 FKTNO75072 461 aa11.95□□□□□ -0.5
VWDE-203ENST00000452576 RCBTB2O95199 551 aa11.95□□□□□ -0.5
VWDE-203ENST00000452576 C8BP07358 591 aa11.95□□□□□ -0.5
VWDE-203ENST00000452576 CYP3A5P20815 502 aa11.95□□□□□ -0.5
VWDE-203ENST00000452576 SLC26A5P58743 744 aa11.95□□□□□ -0.5
VWDE-203ENST00000452576 FAM189A2Q15884 450 aa11.95□□□□□ -0.5
VWDE-203ENST00000452576 DPY19L1Q2PZI1 675 aa11.95□□□□□ -0.5
VWDE-203ENST00000452576 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP11.95□□□□□ -0.5
VWDE-203ENST00000452576 ZBED5Q49AG3 693 aa11.95□□□□□ -0.5
VWDE-203ENST00000452576 NKAPLQ5M9Q1 402 aa11.95□□□□□ -0.5
VWDE-203ENST00000452576 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
VWDE-203ENST00000452576 AQP11Q8NBQ7 271 aa11.95□□□□□ -0.5
VWDE-203ENST00000452576 IRGQQ8WZA9 623 aa11.95□□□□□ -0.5
VWDE-203ENST00000452576 EPYCQ99645 322 aa11.95□□□□□ -0.5
VWDE-203ENST00000452576 NANSQ9NR45 359 aa11.95□□□□□ -0.5
VWDE-203ENST00000452576 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
VWDE-203ENST00000452576 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa11.95□□□□□ -0.5
VWDE-203ENST00000452576 ZNF536O15090 1300 aa11.94□□□□□ -0.5
VWDE-203ENST00000452576 TRBC2A0A5B9 178 aa11.94□□□□□ -0.5
VWDE-203ENST00000452576 CDC7O00311 574 aa11.94□□□□□ -0.5
VWDE-203ENST00000452576 ANXA3P12429 323 aa11.94□□□□□ -0.5
VWDE-203ENST00000452576 ERVK-8P63133 956 aa11.94□□□□□ -0.5
VWDE-203ENST00000452576 ST3GAL4Q11206 333 aa11.94□□□□□ -0.5
VWDE-203ENST00000452576 PTF1AQ7RTS3 328 aa11.94□□□□□ -0.5
VWDE-203ENST00000452576 HSPBAP1Q96EW2 488 aa11.94□□□□□ -0.5
VWDE-203ENST00000452576 MSANTD3Q96H12 275 aa11.94□□□□□ -0.5
VWDE-203ENST00000452576 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
VWDE-203ENST00000452576 CERS4Q9HA82 394 aa11.94□□□□□ -0.5
VWDE-203ENST00000452576 CD320Q9NPF0 282 aa11.94□□□□□ -0.5
VWDE-203ENST00000452576 ARHGEF4Q9NR80 690 aa11.94□□□□□ -0.5
VWDE-203ENST00000452576 KLK1P06870 262 aa11.94□□□□□ -0.5
VWDE-203ENST00000452576 CKMT2P17540 419 aa11.94□□□□□ -0.5
VWDE-203ENST00000452576 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
VWDE-203ENST00000452576 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
VWDE-203ENST00000452576 NDST2P52849 883 aa11.94□□□□□ -0.5
VWDE-203ENST00000452576 RABGGTBP53611 331 aa11.94□□□□□ -0.5
VWDE-203ENST00000452576 SLC15A3Q8IY34 581 aa11.94□□□□□ -0.5
VWDE-203ENST00000452576 IQCKQ8N0W5 287 aa11.94□□□□□ -0.5
VWDE-203ENST00000452576 GPC2Q8N158 579 aa11.94□□□□□ -0.5
VWDE-203ENST00000452576 SLC30A2Q9BRI3 323 aa11.94□□□□□ -0.5
VWDE-203ENST00000452576 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa11.94□□□□□ -0.5
VWDE-203ENST00000452576 MAGEH1Q9H213 219 aa11.94□□□□□ -0.5
VWDE-203ENST00000452576 FZD3Q9NPG1 666 aa11.94□□□□□ -0.5
VWDE-203ENST00000452576 CNTN3Q9P232 1028 aa11.94□□□□□ -0.5
VWDE-203ENST00000452576 CLTCL1P53675 1640 aa11.94□□□□□ -0.5
VWDE-203ENST00000452576 MYO3AQ8NEV4 1616 aa11.94□□□□□ -0.5
VWDE-203ENST00000452576 GRXCR1A8MXD5 290 aa11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 77 ms