RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543627.1

DDB1-222, Transcript of damage specific DNA binding protein 1, human

TSL 5

Gene DDB1, Length 540 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDB1-222	ENST00000543627	STX2	P32856	288 aa		10.61	□□□□□ -0.71
DDB1-222	ENST00000543627	GP5	P40197	560 aa		10.61	□□□□□ -0.71
DDB1-222	ENST00000543627	RHD	Q02161	417 aa		10.61	□□□□□ -0.71
DDB1-222	ENST00000543627	LY6D	Q14210	128 aa		10.61	□□□□□ -0.71
DDB1-222	ENST00000543627	MAP7	Q14244	749 aa		10.61	□□□□□ -0.71
DDB1-222	ENST00000543627	FAM69B	Q5VUD6	431 aa		10.61	□□□□□ -0.71
DDB1-222	ENST00000543627	ICE2	Q659A1	982 aa		10.61	□□□□□ -0.71
DDB1-222	ENST00000543627	LCN10	Q6JVE6	187 aa		10.61	□□□□□ -0.71
DDB1-222	ENST00000543627	TMEM207	Q6UWW9	146 aa		10.61	□□□□□ -0.71
DDB1-222	ENST00000543627	TTLL10	Q6ZVT0	673 aa		10.61	□□□□□ -0.71
DDB1-222	ENST00000543627	FRA10AC1	Q70Z53	315 aa		10.61	□□□□□ -0.71
DDB1-222	ENST00000543627	GALNT7	Q86SF2	657 aa		10.61	□□□□□ -0.71
DDB1-222	ENST00000543627	CEP97	Q8IW35	865 aa		10.61	□□□□□ -0.71
DDB1-222	ENST00000543627	NKAP	Q8N5F7	415 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
DDB1-222	ENST00000543627	METTL27	Q8N6F8	245 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
DDB1-222	ENST00000543627	TTC29	Q8NA56	475 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
DDB1-222	ENST00000543627	ZUFSP	Q96AP4	578 aa		10.61	□□□□□ -0.71
DDB1-222	ENST00000543627	PYCR2	Q96C36	320 aa		10.61	□□□□□ -0.71
DDB1-222	ENST00000543627	UBL7	Q96S82	380 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
DDB1-222	ENST00000543627	CPNE1	Q99829	537 aa		10.61	□□□□□ -0.71
DDB1-222	ENST00000543627	EGFL8	Q99944	293 aa		10.61	□□□□□ -0.71
DDB1-222	ENST00000543627	YIPF2	Q9BWQ6	316 aa		10.61	□□□□□ -0.71
DDB1-222	ENST00000543627	SLC12A9	Q9BXP2	914 aa		10.61	□□□□□ -0.71
DDB1-222	ENST00000543627	RHOJ	Q9H4E5	214 aa		10.61	□□□□□ -0.71
DDB1-222	ENST00000543627	CCDC177	Q9NQR7	707 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
DDB1-222	ENST00000543627	KCND3	Q9UK17	655 aa		10.61	□□□□□ -0.71
DDB1-222	ENST00000543627	FARSA	Q9Y285	508 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
DDB1-222	ENST00000543627	SPTB	P11277	2137 aa		10.61	□□□□□ -0.71
DDB1-222	ENST00000543627	NCF1B	A6NI72	391 aa	Predicted RBP	10.6	□□□□□ -0.71
DDB1-222	ENST00000543627	FAM159B	A6NKW6	160 aa		10.6	□□□□□ -0.71
DDB1-222	ENST00000543627	NCF1C	A8MVU1	366 aa	Predicted RBP	10.6	□□□□□ -0.71
DDB1-222	ENST00000543627	TARM1	B6A8C7	271 aa		10.6	□□□□□ -0.71
DDB1-222	ENST00000543627		E7ENX8	843 aa		10.6	□□□□□ -0.71
DDB1-222	ENST00000543627		H7BY64	318 aa		10.6	□□□□□ -0.71
DDB1-222	ENST00000543627	EIF3F	O00303	357 aa	Predicted RBP	10.6	□□□□□ -0.71
DDB1-222	ENST00000543627	SLC16A5	O15375	505 aa		10.6	□□□□□ -0.71
DDB1-222	ENST00000543627	PRICKLE3	O43900	615 aa	Predicted RBP	10.6	□□□□□ -0.71
DDB1-222	ENST00000543627	CTSV	O60911	334 aa		10.6	□□□□□ -0.71
DDB1-222	ENST00000543627	CCNDBP1	O95273	360 aa		10.6	□□□□□ -0.71
DDB1-222	ENST00000543627	ACSL3	O95573	720 aa		10.6	□□□□□ -0.71
DDB1-222	ENST00000543627	PRB1	P04280	392 aa		10.6	□□□□□ -0.71
DDB1-222	ENST00000543627	NCF1	P14598	390 aa	Predicted RBP	10.6	□□□□□ -0.71
DDB1-222	ENST00000543627	STMN1	P16949	149 aa		10.6	□□□□□ -0.71
DDB1-222	ENST00000543627	PHB	P35232	272 aa		10.6	□□□□□ -0.71
DDB1-222	ENST00000543627	SPR	P35270	261 aa	Predicted RBP	10.6	□□□□□ -0.71
DDB1-222	ENST00000543627	TBPL1	P62380	186 aa		10.6	□□□□□ -0.71
DDB1-222	ENST00000543627	MC1R	Q01726	317 aa		10.6	□□□□□ -0.71
DDB1-222	ENST00000543627	TAP2	Q03519	686 aa		10.6	□□□□□ -0.71
DDB1-222	ENST00000543627	PRDX1	Q06830	199 aa	Known RBP	10.6	□□□□□ -0.71
DDB1-222	ENST00000543627	ARHGAP19	Q14CB8	494 aa		10.6	□□□□□ -0.71
DDB1-222	ENST00000543627	TBR1	Q16650	682 aa		10.6	□□□□□ -0.71
DDB1-222	ENST00000543627	PHKG1	Q16816	387 aa		10.6	□□□□□ -0.71
DDB1-222	ENST00000543627	GLE1	Q53GS7	698 aa	Known RBP	10.6	□□□□□ -0.71
DDB1-222	ENST00000543627	WASHC2D	Q5SRD0	308 aa		10.6	□□□□□ -0.71
DDB1-222	ENST00000543627	GRTP1	Q5TC63	336 aa		10.6	□□□□□ -0.71
DDB1-222	ENST00000543627	PRAMEF13	Q5VWM6	474 aa		10.6	□□□□□ -0.71
DDB1-222	ENST00000543627	FRMPD2B	Q6IN97	320 aa		10.6	□□□□□ -0.71
DDB1-222	ENST00000543627	TLDC1	Q6P9B6	456 aa		10.6	□□□□□ -0.71
DDB1-222	ENST00000543627	AGTRAP	Q6RW13	159 aa		10.6	□□□□□ -0.71
DDB1-222	ENST00000543627	PLD3	Q8IV08	490 aa		10.6	□□□□□ -0.71
DDB1-222	ENST00000543627	DSEL	Q8IZU8	1212 aa		10.6	□□□□□ -0.71
DDB1-222	ENST00000543627	ENDOV	Q8N8Q3	282 aa	Known RBP	10.6	□□□□□ -0.71
DDB1-222	ENST00000543627	HMGCLL1	Q8TB92	370 aa		10.6	□□□□□ -0.71
DDB1-222	ENST00000543627	ANKRD49	Q8WVL7	239 aa		10.6	□□□□□ -0.71
DDB1-222	ENST00000543627	SLC39A7	Q92504	469 aa		10.6	□□□□□ -0.71
DDB1-222	ENST00000543627	EXT2	Q93063	718 aa		10.6	□□□□□ -0.71
DDB1-222	ENST00000543627	TSPAN17	Q96FV3	270 aa		10.6	□□□□□ -0.71
DDB1-222	ENST00000543627	SLC45A3	Q96JT2	553 aa		10.6	□□□□□ -0.71
DDB1-222	ENST00000543627	PRAP1	Q96NZ9	151 aa		10.6	□□□□□ -0.71
DDB1-222	ENST00000543627	BBC3	Q96PG8	261 aa	Predicted RBP	10.6	□□□□□ -0.71
DDB1-222	ENST00000543627	FMO2	Q99518	471 aa		10.6	□□□□□ -0.71
DDB1-222	ENST00000543627	RBBP8	Q99708	897 aa		10.6	□□□□□ -0.71
DDB1-222	ENST00000543627	ACTL8	Q9H568	366 aa		10.6	□□□□□ -0.71
DDB1-222	ENST00000543627	SLC6A20	Q9NP91	592 aa		10.6	□□□□□ -0.71
DDB1-222	ENST00000543627	ZDHHC18	Q9NUE0	388 aa		10.6	□□□□□ -0.71
DDB1-222	ENST00000543627	PCMTD2	Q9NV79	361 aa		10.6	□□□□□ -0.71
DDB1-222	ENST00000543627	CUEDC1	Q9NWM3	386 aa	Predicted RBP	10.6	□□□□□ -0.71
DDB1-222	ENST00000543627	NINJ2	Q9NZG7	142 aa		10.6	□□□□□ -0.71
DDB1-222	ENST00000543627	IFT80	Q9P2H3	777 aa	Predicted RBP	10.6	□□□□□ -0.71
DDB1-222	ENST00000543627	CTNNAL1	Q9UBT7	734 aa		10.6	□□□□□ -0.71
DDB1-222	ENST00000543627	IKZF3	Q9UKT9	509 aa		10.6	□□□□□ -0.71
DDB1-222	ENST00000543627	SNX7	Q9UNH6	387 aa		10.6	□□□□□ -0.71
DDB1-222	ENST00000543627	SSUH2	Q9Y2M2	353 aa		10.6	□□□□□ -0.71
DDB1-222	ENST00000543627	AP1M2	Q9Y6Q5	423 aa		10.6	□□□□□ -0.71
DDB1-222	ENST00000543627	MAU2	Q9Y6X3	613 aa		10.6	□□□□□ -0.71
DDB1-222	ENST00000543627	LOC105369274	A0A096LPK9	316 aa		10.59	□□□□□ -0.71
DDB1-222	ENST00000543627	LOC102723532	A0A0G2JNH3	316 aa		10.59	□□□□□ -0.71
DDB1-222	ENST00000543627		C9J4A7	227 aa		10.59	□□□□□ -0.71
DDB1-222	ENST00000543627	POC1B-GALNT4	F8VUJ3	575 aa		10.59	□□□□□ -0.71
DDB1-222	ENST00000543627	CREG1	O75629	220 aa		10.59	□□□□□ -0.71
DDB1-222	ENST00000543627	FAM87A	P0C7U9	286 aa		10.59	□□□□□ -0.71
DDB1-222	ENST00000543627	CCDC166	P0CW27	439 aa		10.59	□□□□□ -0.71
DDB1-222	ENST00000543627	ZNF37A	P17032	561 aa	Predicted RBP	10.59	□□□□□ -0.71
DDB1-222	ENST00000543627	GMPR	P36959	345 aa		10.59	□□□□□ -0.71
DDB1-222	ENST00000543627	GABRA4	P48169	554 aa		10.59	□□□□□ -0.71
DDB1-222	ENST00000543627	DCD	P81605	110 aa	Known RBP	10.59	□□□□□ -0.71
DDB1-222	ENST00000543627	POU4F1	Q01851	419 aa		10.59	□□□□□ -0.71
DDB1-222	ENST00000543627	CDC20	Q12834	499 aa		10.59	□□□□□ -0.71
DDB1-222	ENST00000543627	SP140	Q13342	867 aa		10.59	□□□□□ -0.71
DDB1-222	ENST00000543627	BMPR2	Q13873	1038 aa		10.59	□□□□□ -0.71

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