RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293922.1

PTX4-201, Transcript of pentraxin 4, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTX4, Length 1,422 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX4-201ENST00000293922 TMPRSS3P57727 454 aa17.73■□□□□ 0.43
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PTX4-201ENST00000293922 CYHR1Q6ZMK1 362 aa17.73■□□□□ 0.43
PTX4-201ENST00000293922 VRK3Q8IV63 474 aa17.73■□□□□ 0.43
PTX4-201ENST00000293922 SLC22A15Q8IZD6 547 aa17.73■□□□□ 0.43
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PTX4-201ENST00000293922 ARHGAP40Q5TG30 622 aa17.71■□□□□ 0.43
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PTX4-201ENST00000293922 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP17.71■□□□□ 0.43
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PTX4-201ENST00000293922 DENND1AQ8TEH3 1009 aa17.7■□□□□ 0.42
PTX4-201ENST00000293922 ASB11Q8WXH4 323 aa17.7■□□□□ 0.42
PTX4-201ENST00000293922 TAAR9Q96RI9 348 aa17.7■□□□□ 0.42
PTX4-201ENST00000293922 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP17.7■□□□□ 0.42
PTX4-201ENST00000293922 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP17.7■□□□□ 0.42
PTX4-201ENST00000293922 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP17.7■□□□□ 0.42
PTX4-201ENST00000293922 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa17.7■□□□□ 0.42
PTX4-201ENST00000293922 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP17.69■□□□□ 0.42
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