RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557021.5

UBE2V1-222, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 V1, human

TSL 5 BASIC

Gene UBE2V1, Length 2,258 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBE2V1-222	ENST00000557021	RAD51AP1	Q96B01	352 aa		13.13	□□□□□ -0.31
UBE2V1-222	ENST00000557021	HIST1H2AH	Q96KK5	128 aa		13.13	□□□□□ -0.31
UBE2V1-222	ENST00000557021	HIST1H2AJ	Q99878	128 aa		13.13	□□□□□ -0.31
UBE2V1-222	ENST00000557021	H2AFJ	Q9BTM1	129 aa		13.13	□□□□□ -0.31
UBE2V1-222	ENST00000557021	MVB12B	Q9H7P6	319 aa		13.13	□□□□□ -0.31
UBE2V1-222	ENST00000557021	KCNK9	Q9NPC2	374 aa		13.13	□□□□□ -0.31
UBE2V1-222	ENST00000557021	KLHL42	Q9P2K6	505 aa		13.13	□□□□□ -0.31
UBE2V1-222	ENST00000557021	EMCN	Q9ULC0	261 aa		13.13	□□□□□ -0.31
UBE2V1-222	ENST00000557021	HEBP2	Q9Y5Z4	205 aa		13.13	□□□□□ -0.31
UBE2V1-222	ENST00000557021	ISM1	B1AKI9	464 aa		13.12	□□□□□ -0.31
UBE2V1-222	ENST00000557021	CAPN5	O15484	640 aa	Predicted RBP	13.12	□□□□□ -0.31
UBE2V1-222	ENST00000557021	PROS1	P07225	676 aa		13.12	□□□□□ -0.31
UBE2V1-222	ENST00000557021	TSPAN8	P19075	237 aa		13.12	□□□□□ -0.31
UBE2V1-222	ENST00000557021	CYP2A7	P20853	494 aa		13.12	□□□□□ -0.31
UBE2V1-222	ENST00000557021	PEBP1	P30086	187 aa	Known RBP	13.12	□□□□□ -0.31
UBE2V1-222	ENST00000557021	RPA3	P35244	121 aa	Predicted RBP	13.12	□□□□□ -0.31
UBE2V1-222	ENST00000557021	SEPHS1	P49903	392 aa		13.12	□□□□□ -0.31
UBE2V1-222	ENST00000557021	NAE1	Q13564	534 aa		13.12	□□□□□ -0.31
UBE2V1-222	ENST00000557021	TTMP	Q5BVD1	217 aa		13.12	□□□□□ -0.31
UBE2V1-222	ENST00000557021	THEMIS2	Q5TEJ8	643 aa		13.12	□□□□□ -0.31
UBE2V1-222	ENST00000557021	KIAA1191	Q96A73	305 aa		13.12	□□□□□ -0.31
UBE2V1-222	ENST00000557021	SH3KBP1	Q96B97	665 aa		13.12	□□□□□ -0.31
UBE2V1-222	ENST00000557021	TMEM109	Q9BVC6	243 aa		13.12	□□□□□ -0.31
UBE2V1-222	ENST00000557021	NMRAL1	Q9HBL8	299 aa		13.12	□□□□□ -0.31
UBE2V1-222	ENST00000557021	STOX2	Q9P2F5	926 aa	Predicted RBP	13.12	□□□□□ -0.31
UBE2V1-222	ENST00000557021	GOLGA6L10	A6NI86	522 aa		13.11	□□□□□ -0.31
UBE2V1-222	ENST00000557021	FOXD2	O60548	495 aa	Predicted RBP	13.11	□□□□□ -0.31
UBE2V1-222	ENST00000557021	RASSF9	O75901	435 aa		13.11	□□□□□ -0.31
UBE2V1-222	ENST00000557021	C8G	P07360	202 aa		13.11	□□□□□ -0.31
UBE2V1-222	ENST00000557021	FTH1P19	P0C7X4	201 aa		13.11	□□□□□ -0.31
UBE2V1-222	ENST00000557021	MTHFD2	P13995	350 aa		13.11	□□□□□ -0.31
UBE2V1-222	ENST00000557021	ATP5D	P30049	168 aa		13.11	□□□□□ -0.31
UBE2V1-222	ENST00000557021	HPD	P32754	393 aa	Predicted RBP	13.11	□□□□□ -0.31
UBE2V1-222	ENST00000557021	GRIA3	P42263	894 aa		13.11	□□□□□ -0.31
UBE2V1-222	ENST00000557021	HSPA7	P48741	367 aa		13.11	□□□□□ -0.31
UBE2V1-222	ENST00000557021	MPP2	Q14168	576 aa		13.11	□□□□□ -0.31
UBE2V1-222	ENST00000557021	ZNF574	Q6ZN55	896 aa	Predicted RBP	13.11	□□□□□ -0.31
UBE2V1-222	ENST00000557021	NEK10	Q6ZWH5	1172 aa		13.11	□□□□□ -0.31
UBE2V1-222	ENST00000557021	ADGRF3	Q8IZF5	1079 aa		13.11	□□□□□ -0.31
UBE2V1-222	ENST00000557021	TMEM151A	Q8N4L1	468 aa		13.11	□□□□□ -0.31
UBE2V1-222	ENST00000557021	DCBLD1	Q8N8Z6	715 aa		13.11	□□□□□ -0.31
UBE2V1-222	ENST00000557021	MGARP	Q8TDB4	240 aa		13.11	□□□□□ -0.31
UBE2V1-222	ENST00000557021	PDLIM5	Q96HC4	596 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
UBE2V1-222	ENST00000557021	TSNARE1	Q96NA8	513 aa		13.11	□□□□□ -0.31
UBE2V1-222	ENST00000557021	FAM111A	Q96PZ2	611 aa		13.11	□□□□□ -0.31
UBE2V1-222	ENST00000557021	SMC6	Q96SB8	1091 aa		13.11	□□□□□ -0.31
UBE2V1-222	ENST00000557021	ATOH8	Q96SQ7	321 aa		13.11	□□□□□ -0.31
UBE2V1-222	ENST00000557021	MIPEP	Q99797	713 aa		13.11	□□□□□ -0.31
UBE2V1-222	ENST00000557021	MECR	Q9BV79	373 aa		13.11	□□□□□ -0.31
UBE2V1-222	ENST00000557021	SEMA6C	Q9H3T2	930 aa		13.11	□□□□□ -0.31
UBE2V1-222	ENST00000557021	SLC32A1	Q9H598	525 aa		13.11	□□□□□ -0.31
UBE2V1-222	ENST00000557021	TMBIM4	Q9HC24	238 aa		13.11	□□□□□ -0.31
UBE2V1-222	ENST00000557021	INTS7	Q9NVH2	962 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
UBE2V1-222	ENST00000557021	SH2B3	Q9UQQ2	575 aa		13.11	□□□□□ -0.31
UBE2V1-222	ENST00000557021	KNTC1	P50748	2209 aa		13.11	□□□□□ -0.31
UBE2V1-222	ENST00000557021	DMXL2	Q8TDJ6	3036 aa		13.11	□□□□□ -0.31
UBE2V1-222	ENST00000557021	WDR91	A4D1P6	747 aa		13.11	□□□□□ -0.31
UBE2V1-222	ENST00000557021	PABPN1L	A6NDY0	278 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
UBE2V1-222	ENST00000557021	MAP2K7	O14733	419 aa		13.11	□□□□□ -0.31
UBE2V1-222	ENST00000557021	SLC30A4	O14863	429 aa		13.11	□□□□□ -0.31
UBE2V1-222	ENST00000557021	RPN2	P04844	631 aa		13.11	□□□□□ -0.31
UBE2V1-222	ENST00000557021	GFAP	P14136	432 aa		13.11	□□□□□ -0.31
UBE2V1-222	ENST00000557021	ACP1	P24666	158 aa		13.11	□□□□□ -0.31
UBE2V1-222	ENST00000557021	LSS	P48449	732 aa		13.11	□□□□□ -0.31
UBE2V1-222	ENST00000557021	RAB28	P51157	221 aa		13.11	□□□□□ -0.31
UBE2V1-222	ENST00000557021	ACAP2	Q15057	778 aa		13.11	□□□□□ -0.31
UBE2V1-222	ENST00000557021	TECRL	Q5HYJ1	363 aa		13.11	□□□□□ -0.31
UBE2V1-222	ENST00000557021	KLC3	Q6P597	504 aa		13.11	□□□□□ -0.31
UBE2V1-222	ENST00000557021	AGTRAP	Q6RW13	159 aa		13.11	□□□□□ -0.31
UBE2V1-222	ENST00000557021	RIBC1	Q8N443	379 aa	Predicted RBP	13.11	□□□□□ -0.31
UBE2V1-222	ENST00000557021	ANKRD42	Q8N9B4	389 aa		13.11	□□□□□ -0.31
UBE2V1-222	ENST00000557021	ARMC2	Q8NEN0	867 aa		13.11	□□□□□ -0.31
UBE2V1-222	ENST00000557021	STAG3L4	Q8TBR4	150 aa		13.11	□□□□□ -0.31
UBE2V1-222	ENST00000557021	TCP10L	Q8TDR4	215 aa		13.11	□□□□□ -0.31
UBE2V1-222	ENST00000557021	PRR11	Q96HE9	360 aa	Predicted RBP	13.11	□□□□□ -0.31
UBE2V1-222	ENST00000557021		E7ENX8	843 aa		13.1	□□□□□ -0.31
UBE2V1-222	ENST00000557021	TAPBP	O15533	448 aa		13.1	□□□□□ -0.31
UBE2V1-222	ENST00000557021	KCNK5	O95279	499 aa		13.1	□□□□□ -0.31
UBE2V1-222	ENST00000557021	CHRM5	P08912	532 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
UBE2V1-222	ENST00000557021	LIMK1	P53667	647 aa		13.1	□□□□□ -0.31
UBE2V1-222	ENST00000557021	PNLIPRP1	P54315	467 aa		13.1	□□□□□ -0.31
UBE2V1-222	ENST00000557021	ATP6V0D1	P61421	351 aa		13.1	□□□□□ -0.31
UBE2V1-222	ENST00000557021	TAP2	Q03519	686 aa		13.1	□□□□□ -0.31
UBE2V1-222	ENST00000557021	ADAMTSL2	Q86TH1	951 aa		13.1	□□□□□ -0.31
UBE2V1-222	ENST00000557021	BANP	Q8N9N5	519 aa		13.1	□□□□□ -0.31
UBE2V1-222	ENST00000557021	NAT6	Q93015	286 aa		13.1	□□□□□ -0.31
UBE2V1-222	ENST00000557021	CDC6	Q99741	560 aa		13.1	□□□□□ -0.31
UBE2V1-222	ENST00000557021	MAP3K3	Q99759	626 aa		13.1	□□□□□ -0.31
UBE2V1-222	ENST00000557021	LRRN3	Q9H3W5	708 aa		13.1	□□□□□ -0.31
UBE2V1-222	ENST00000557021	PPCS	Q9HAB8	311 aa		13.1	□□□□□ -0.31
UBE2V1-222	ENST00000557021	TAC3	Q9UHF0	121 aa		13.1	□□□□□ -0.31
UBE2V1-222	ENST00000557021	POLG2	Q9UHN1	485 aa		13.1	□□□□□ -0.31
UBE2V1-222	ENST00000557021	LNPEP	Q9UIQ6	1025 aa		13.1	□□□□□ -0.31
UBE2V1-222	ENST00000557021	SLC22A14	Q9Y267	594 aa		13.1	□□□□□ -0.31
UBE2V1-222	ENST00000557021	OARD1	Q9Y530	152 aa		13.1	□□□□□ -0.31
UBE2V1-222	ENST00000557021	PIPSL	A2A3N6	862 aa		13.1	□□□□□ -0.31
UBE2V1-222	ENST00000557021	PMS2P1	A4D2B8	440 aa		13.1	□□□□□ -0.31
UBE2V1-222	ENST00000557021	MYO1C	O00159	1063 aa		13.1	□□□□□ -0.31
UBE2V1-222	ENST00000557021	SPINK2	P20155	84 aa		13.1	□□□□□ -0.31
UBE2V1-222	ENST00000557021	NDUFS1	P28331	727 aa		13.1	□□□□□ -0.31

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 136.1 ms