RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000607561.1

RNU6-87P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 87, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-87P, Length 108 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-87P-201ENST00000607561 SFI1A8K8P3 1242 aa6.92□□□□□ -1.3
RNU6-87P-201ENST00000607561 POTECB2RU33 542 aa6.92□□□□□ -1.3
RNU6-87P-201ENST00000607561 WASLO00401 505 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
RNU6-87P-201ENST00000607561 CENPCQ03188 943 aa6.92□□□□□ -1.3
RNU6-87P-201ENST00000607561 DPYDQ12882 1025 aa6.92□□□□□ -1.3
RNU6-87P-201ENST00000607561 ESCO1Q5FWF5 840 aa6.92□□□□□ -1.3
RNU6-87P-201ENST00000607561 ZNF358Q9NW07 568 aa6.92□□□□□ -1.3
RNU6-87P-201ENST00000607561 SERTAD1Q9UHV2 236 aa6.92□□□□□ -1.3
RNU6-87P-201ENST00000607561 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
RNU6-87P-201ENST00000607561 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
RNU6-87P-201ENST00000607561 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
RNU6-87P-201ENST00000607561 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
RNU6-87P-201ENST00000607561 NLRP3Q96P20 1036 aa6.91□□□□□ -1.3
RNU6-87P-201ENST00000607561 SLC4A9Q96Q91 983 aa6.91□□□□□ -1.3
RNU6-87P-201ENST00000607561 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
RNU6-87P-201ENST00000607561 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa6.91□□□□□ -1.3
RNU6-87P-201ENST00000607561 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
RNU6-87P-201ENST00000607561 FIGNL2A6NMB9 653 aa6.9□□□□□ -1.3
RNU6-87P-201ENST00000607561 TTLL8A6PVC2 850 aa6.9□□□□□ -1.3
RNU6-87P-201ENST00000607561 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
RNU6-87P-201ENST00000607561 GRIP2Q9C0E4 1043 aa6.9□□□□□ -1.3
RNU6-87P-201ENST00000607561 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
RNU6-87P-201ENST00000607561 GPC1P35052 558 aa6.89□□□□□ -1.31
RNU6-87P-201ENST00000607561 SMTNP53814 917 aa6.89□□□□□ -1.31
RNU6-87P-201ENST00000607561 SEC13P55735 322 aa6.89□□□□□ -1.31
RNU6-87P-201ENST00000607561 TNS4Q8IZW8 715 aa6.89□□□□□ -1.31
RNU6-87P-201ENST00000607561 FAM200AQ8TCP9 573 aa6.89□□□□□ -1.31
RNU6-87P-201ENST00000607561 STK32AQ8WU08 396 aa6.89□□□□□ -1.31
RNU6-87P-201ENST00000607561 TRIM47Q96LD4 638 aa6.89□□□□□ -1.31
RNU6-87P-201ENST00000607561 SOBPA7XYQ1 873 aa6.88□□□□□ -1.31
RNU6-87P-201ENST00000607561 M0R2N6 131 aa6.88□□□□□ -1.31
RNU6-87P-201ENST00000607561 BACH1O14867 736 aa6.88□□□□□ -1.31
RNU6-87P-201ENST00000607561 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
RNU6-87P-201ENST00000607561 MTFR1Q15390 333 aa6.88□□□□□ -1.31
RNU6-87P-201ENST00000607561 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
RNU6-87P-201ENST00000607561 RNF217Q8TC41 542 aa6.88□□□□□ -1.31
RNU6-87P-201ENST00000607561 SENP2Q9HC62 589 aa6.88□□□□□ -1.31
RNU6-87P-201ENST00000607561 DNMT3LQ9UJW3 386 aa6.88□□□□□ -1.31
RNU6-87P-201ENST00000607561 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
RNU6-87P-201ENST00000607561 A6NJY4 79 aa6.87□□□□□ -1.31
RNU6-87P-201ENST00000607561 LGR5O75473 907 aa6.87□□□□□ -1.31
RNU6-87P-201ENST00000607561 EPHA4P54764 986 aa6.87□□□□□ -1.31
RNU6-87P-201ENST00000607561 FAM69CQ0P6D2 419 aa6.87□□□□□ -1.31
RNU6-87P-201ENST00000607561 TLR1Q15399 786 aa6.87□□□□□ -1.31
RNU6-87P-201ENST00000607561 TMEM164Q5U3C3 297 aa6.87□□□□□ -1.31
RNU6-87P-201ENST00000607561 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
RNU6-87P-201ENST00000607561 USP3Q9Y6I4 520 aa6.87□□□□□ -1.31
RNU6-87P-201ENST00000607561 CDK2AP1O14519 115 aa6.86□□□□□ -1.31
RNU6-87P-201ENST00000607561 FOXK2Q01167 660 aa6.86□□□□□ -1.31
RNU6-87P-201ENST00000607561 POU4F2Q12837 409 aa6.86□□□□□ -1.31
RNU6-87P-201ENST00000607561 SLC27A3Q5K4L6 730 aa6.86□□□□□ -1.31
RNU6-87P-201ENST00000607561 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa6.86□□□□□ -1.31
RNU6-87P-201ENST00000607561 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
RNU6-87P-201ENST00000607561 KIFC2Q96AC6 838 aa6.86□□□□□ -1.31
RNU6-87P-201ENST00000607561 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
RNU6-87P-201ENST00000607561 CARNS1A5YM72 827 aa6.85□□□□□ -1.31
RNU6-87P-201ENST00000607561 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
RNU6-87P-201ENST00000607561 MAN1A2O60476 641 aa6.85□□□□□ -1.31
RNU6-87P-201ENST00000607561 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa6.85□□□□□ -1.31
RNU6-87P-201ENST00000607561 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa6.85□□□□□ -1.31
RNU6-87P-201ENST00000607561 HINFPQ9BQA5 517 aa6.85□□□□□ -1.31
RNU6-87P-201ENST00000607561 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
RNU6-87P-201ENST00000607561 SLAIN2Q9P270 581 aa6.85□□□□□ -1.31
RNU6-87P-201ENST00000607561 TMEM88BA6NKF7 163 aa6.84□□□□□ -1.31
RNU6-87P-201ENST00000607561 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa6.84□□□□□ -1.31
RNU6-87P-201ENST00000607561 RHOQP17081 205 aa6.84□□□□□ -1.31
RNU6-87P-201ENST00000607561 TBCELQ5QJ74 424 aa6.84□□□□□ -1.31
RNU6-87P-201ENST00000607561 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
RNU6-87P-201ENST00000607561 GAS2L2Q8NHY3 880 aa6.84□□□□□ -1.31
RNU6-87P-201ENST00000607561 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
RNU6-87P-201ENST00000607561 C21orf2O43822 256 aa6.83□□□□□ -1.32
RNU6-87P-201ENST00000607561 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP6.83□□□□□ -1.32
RNU6-87P-201ENST00000607561 ZNF787Q6DD87 383 aa6.83□□□□□ -1.32
RNU6-87P-201ENST00000607561 SLC9A9Q8IVB4 645 aa6.83□□□□□ -1.32
RNU6-87P-201ENST00000607561 RETREG2Q8NC44 543 aa6.83□□□□□ -1.32
RNU6-87P-201ENST00000607561 ATAD2Q6PL18 1390 aa6.82□□□□□ -1.32
RNU6-87P-201ENST00000607561 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa6.82□□□□□ -1.32
RNU6-87P-201ENST00000607561 PHKA2P46019 1235 aa6.82□□□□□ -1.32
RNU6-87P-201ENST00000607561 SWI5Q1ZZU3 235 aa6.82□□□□□ -1.32
RNU6-87P-201ENST00000607561 C4orf17Q53FE4 359 aa6.82□□□□□ -1.32
RNU6-87P-201ENST00000607561 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
RNU6-87P-201ENST00000607561 NBPF15Q8N660 670 aa6.82□□□□□ -1.32
RNU6-87P-201ENST00000607561 RHBDD1Q8TEB9 315 aa6.82□□□□□ -1.32
RNU6-87P-201ENST00000607561 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa6.81□□□□□ -1.32
RNU6-87P-201ENST00000607561 WEE1P30291 646 aa6.81□□□□□ -1.32
RNU6-87P-201ENST00000607561 WDR44Q5JSH3 913 aa6.81□□□□□ -1.32
RNU6-87P-201ENST00000607561 GNASQ5JWF2 1037 aa6.81□□□□□ -1.32
RNU6-87P-201ENST00000607561 TAS1R3Q7RTX0 852 aa6.81□□□□□ -1.32
RNU6-87P-201ENST00000607561 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa6.81□□□□□ -1.32
RNU6-87P-201ENST00000607561 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
RNU6-87P-201ENST00000607561 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
RNU6-87P-201ENST00000607561 PRIMPOLQ96LW4 560 aa6.81□□□□□ -1.32
RNU6-87P-201ENST00000607561 PARP3Q9Y6F1 533 aa6.81□□□□□ -1.32
RNU6-87P-201ENST00000607561 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
RNU6-87P-201ENST00000607561 PTSQ03393 145 aa6.8□□□□□ -1.32
RNU6-87P-201ENST00000607561 TEAD4Q15561 434 aa6.8□□□□□ -1.32
RNU6-87P-201ENST00000607561 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
RNU6-87P-201ENST00000607561 CABP1Q9NZU7 370 aa6.8□□□□□ -1.32
RNU6-87P-201ENST00000607561 SLC35F4A4IF30 521 aa6.79□□□□□ -1.32
RNU6-87P-201ENST00000607561 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10 ms