RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa35.35■■■■□ 3.25
CAPNS1-211ENST00000590874 KDRP35968 1356 aa35.34■■■■□ 3.25
CAPNS1-211ENST00000590874 PCGF6Q9BYE7 350 aa35.32■■■■□ 3.24
CAPNS1-211ENST00000590874 ADCY9O60503 1353 aa35.32■■■■□ 3.24
CAPNS1-211ENST00000590874 PANK3Q9H999 370 aa35.3■■■■□ 3.24
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC4A9Q96Q91 983 aa35.29■■■■□ 3.24
CAPNS1-211ENST00000590874 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP35.28■■■■□ 3.24
CAPNS1-211ENST00000590874 ERVV-2B6SEH9 535 aa35.26■■■■□ 3.24
CAPNS1-211ENST00000590874 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP35.26■■■■□ 3.24
CAPNS1-211ENST00000590874 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP35.25■■■■□ 3.23
CAPNS1-211ENST00000590874 MMP10P09238 476 aa35.25■■■■□ 3.23
CAPNS1-211ENST00000590874 DCAF5Q96JK2 942 aa35.25■■■■□ 3.23
CAPNS1-211ENST00000590874 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP35.24■■■■□ 3.23
CAPNS1-211ENST00000590874 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP35.24■■■■□ 3.23
CAPNS1-211ENST00000590874 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP35.22■■■■□ 3.23
CAPNS1-211ENST00000590874 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP35.22■■■■□ 3.23
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP35.22■■■■□ 3.23
CAPNS1-211ENST00000590874 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP35.22■■■■□ 3.23
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF831Q5JPB2 1677 aa35.21■■■■□ 3.23
CAPNS1-211ENST00000590874 TRAPPC3LQ5T215 181 aa35.21■■■■□ 3.23
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP35.21■■■■□ 3.23
CAPNS1-211ENST00000590874 AEBP1Q8IUX7 1158 aa35.2■■■■□ 3.23
CAPNS1-211ENST00000590874 PXDNLA1KZ92 1463 aa35.2■■■■□ 3.23
CAPNS1-211ENST00000590874 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP35.19■■■■□ 3.22
CAPNS1-211ENST00000590874 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa35.18■■■■□ 3.22
CAPNS1-211ENST00000590874 AMOTQ4VCS5 1084 aa35.18■■■■□ 3.22
CAPNS1-211ENST00000590874 CABP4P57796 275 aa35.17■■■■□ 3.22
CAPNS1-211ENST00000590874 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP35.17■■■■□ 3.22
CAPNS1-211ENST00000590874 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP35.17■■■■□ 3.22
CAPNS1-211ENST00000590874 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP35.16■■■■□ 3.22
CAPNS1-211ENST00000590874 MORC1Q86VD1 984 aa35.16■■■■□ 3.22
CAPNS1-211ENST00000590874 NLGN1Q8N2Q7 840 aa35.15■■■■□ 3.22
CAPNS1-211ENST00000590874 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa35.15■■■■□ 3.22
CAPNS1-211ENST00000590874 ADRA2BP18089 450 aa35.14■■■■□ 3.22
CAPNS1-211ENST00000590874 C10orf71Q711Q0 1435 aa35.14■■■■□ 3.22
CAPNS1-211ENST00000590874 KIF13BQ9NQT8 1826 aa35.13■■■■□ 3.21
CAPNS1-211ENST00000590874 RPS6KA4O75676 772 aa35.12■■■■□ 3.21
CAPNS1-211ENST00000590874 GYS1P13807 737 aa35.12■■■■□ 3.21
CAPNS1-211ENST00000590874 MTHFSP49914 203 aa35.12■■■■□ 3.21
CAPNS1-211ENST00000590874 TGFB2P61812 414 aa35.1■■■■□ 3.21
CAPNS1-211ENST00000590874 C1orf141Q5JVX7 400 aa35.1■■■■□ 3.21
CAPNS1-211ENST00000590874 SULT6B1Q6IMI4 303 aa35.1■■■■□ 3.21
CAPNS1-211ENST00000590874 A0A0G2JLW4 131 aa35.09■■■■□ 3.21
CAPNS1-211ENST00000590874 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP35.09■■■■□ 3.21
CAPNS1-211ENST00000590874 RFC4P35249 363 aa35.09■■■■□ 3.21
CAPNS1-211ENST00000590874 C4AP0C0L4 1744 aa35.08■■■■□ 3.21
CAPNS1-211ENST00000590874 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa35.07■■■■□ 3.2
CAPNS1-211ENST00000590874 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP35.07■■■■□ 3.2
CAPNS1-211ENST00000590874 IL13P35225 146 aa35.06■■■■□ 3.2
CAPNS1-211ENST00000590874 CCDC87Q9NVE4 849 aa35.06■■■■□ 3.2
CAPNS1-211ENST00000590874 BCS1LQ9Y276 419 aa35.06■■■■□ 3.2
CAPNS1-211ENST00000590874 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP35.04■■■■□ 3.2
CAPNS1-211ENST00000590874 CRKLP46109 303 aaKnown RBP35.04■■■■□ 3.2
CAPNS1-211ENST00000590874 KNSTRNQ9Y448 316 aa35.04■■■■□ 3.2
CAPNS1-211ENST00000590874 CEP350Q5VT06 3117 aa35.04■■■■□ 3.2
CAPNS1-211ENST00000590874 DPEP1P16444 411 aa35.03■■■■□ 3.2
CAPNS1-211ENST00000590874 PARP3Q9Y6F1 533 aa35.03■■■■□ 3.2
CAPNS1-211ENST00000590874 KIF3CO14782 793 aa35.02■■■■□ 3.2
CAPNS1-211ENST00000590874 HSPA6P17066 643 aa35.02■■■■□ 3.2
CAPNS1-211ENST00000590874 TJP1Q07157 1748 aa35.01■■■■□ 3.2
CAPNS1-211ENST00000590874 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP35.01■■■■□ 3.2
CAPNS1-211ENST00000590874 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP34.98■■■■□ 3.19
CAPNS1-211ENST00000590874 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP34.97■■■■□ 3.19
CAPNS1-211ENST00000590874 FCHSD2O94868 740 aa34.96■■■■□ 3.19
CAPNS1-211ENST00000590874 FKBP8Q14318 412 aa34.96■■■■□ 3.19
CAPNS1-211ENST00000590874 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa34.96■■■■□ 3.19
CAPNS1-211ENST00000590874 KCNA3P22001 575 aa34.95■■■■□ 3.19
CAPNS1-211ENST00000590874 AKAP4Q5JQC9 854 aa34.95■■■■□ 3.19
CAPNS1-211ENST00000590874 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP34.95■■■■□ 3.19
CAPNS1-211ENST00000590874 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP34.95■■■■□ 3.19
CAPNS1-211ENST00000590874 SCN11AQ9UI33 1791 aa34.95■■■■□ 3.18
CAPNS1-211ENST00000590874 DDR1Q08345 913 aa34.94■■■■□ 3.18
CAPNS1-211ENST00000590874 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP34.92■■■■□ 3.18
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC52A2Q9HAB3 445 aa34.92■■■■□ 3.18
CAPNS1-211ENST00000590874 LGR6Q9HBX8 967 aa34.92■■■■□ 3.18
CAPNS1-211ENST00000590874 KIF7Q2M1P5 1343 aa34.9■■■■□ 3.18
CAPNS1-211ENST00000590874 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa34.9■■■■□ 3.18
CAPNS1-211ENST00000590874 DNAJC10Q8IXB1 793 aa34.9■■■■□ 3.18
CAPNS1-211ENST00000590874 MRC1P22897 1456 aa34.9■■■■□ 3.18
CAPNS1-211ENST00000590874 HMOX1P09601 288 aa34.89■■■■□ 3.18
CAPNS1-211ENST00000590874 PIM2Q9P1W9 311 aa34.87■■■■□ 3.17
CAPNS1-211ENST00000590874 RNMTO43148 476 aaKnown RBP34.86■■■■□ 3.17
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC39A6Q13433 755 aa34.86■■■■□ 3.17
CAPNS1-211ENST00000590874 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP34.85■■■■□ 3.17
CAPNS1-211ENST00000590874 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP34.85■■■■□ 3.17
CAPNS1-211ENST00000590874 TM4SF1P30408 202 aa34.84■■■■□ 3.17
CAPNS1-211ENST00000590874 KCPQ6ZWJ8 1503 aa34.84■■■■□ 3.17
CAPNS1-211ENST00000590874 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP34.83■■■■□ 3.17
CAPNS1-211ENST00000590874 CHRNA5P30532 468 aa34.83■■■■□ 3.17
CAPNS1-211ENST00000590874 C9orf131Q5VYM1 1079 aa34.83■■■■□ 3.17
CAPNS1-211ENST00000590874 USPL1Q5W0Q7 1092 aa34.83■■■■□ 3.17
CAPNS1-211ENST00000590874 NMRK2Q9NPI5 230 aa34.83■■■■□ 3.17
CAPNS1-211ENST00000590874 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP34.82■■■■□ 3.16
CAPNS1-211ENST00000590874 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP34.82■■■■□ 3.16
CAPNS1-211ENST00000590874 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa34.81■■■■□ 3.16
CAPNS1-211ENST00000590874 IFFO2Q5TF58 517 aa34.81■■■■□ 3.16
CAPNS1-211ENST00000590874 ZPR1O75312 459 aa34.8■■■■□ 3.16
CAPNS1-211ENST00000590874 TOMM70O94826 608 aa34.8■■■■□ 3.16
CAPNS1-211ENST00000590874 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP34.79■■■■□ 3.16
CAPNS1-211ENST00000590874 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP34.78■■■■□ 3.16
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