RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531461.5

ACER3-211, Transcript of alkaline ceramidase 3, human

TSL 2

Gene ACER3, Length 1,292 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ACER3-211	ENST00000531461	ITPK1	Q13572	414 aa		32.87	■■■□□ 2.85
ACER3-211	ENST00000531461	AMOT	Q4VCS5	1084 aa		32.87	■■■□□ 2.85
ACER3-211	ENST00000531461	PLEKHO1	Q53GL0	409 aa	Predicted RBP	32.87	■■■□□ 2.85
ACER3-211	ENST00000531461	KDR	P35968	1356 aa		32.86	■■■□□ 2.85
ACER3-211	ENST00000531461	YBX3	P16989	372 aa	Known RBP eCLIP	32.86	■■■□□ 2.85
ACER3-211	ENST00000531461	ATP6V1A	P38606	617 aa		32.86	■■■□□ 2.85
ACER3-211	ENST00000531461	PHF14	O94880	888 aa		32.85	■■■□□ 2.85
ACER3-211	ENST00000531461	KNSTRN	Q9Y448	316 aa		32.85	■■■□□ 2.85
ACER3-211	ENST00000531461	KDM6A	O15550	1401 aa	Predicted RBP	32.81	■■■□□ 2.84
ACER3-211	ENST00000531461	GNPAT	O15228	680 aa		32.8	■■■□□ 2.84
ACER3-211	ENST00000531461	ZNF530	Q6P9A1	599 aa	Predicted RBP	32.8	■■■□□ 2.84
ACER3-211	ENST00000531461	COL5A3	P25940	1745 aa	Predicted RBP	32.8	■■■□□ 2.84
ACER3-211	ENST00000531461	AMER1	Q5JTC6	1135 aa	Predicted RBP	32.79	■■■□□ 2.84
ACER3-211	ENST00000531461	SMIM5	Q71RC9	77 aa		32.79	■■■□□ 2.84
ACER3-211	ENST00000531461	AEBP1	Q8IUX7	1158 aa		32.77	■■■□□ 2.84
ACER3-211	ENST00000531461	SLC4A9	Q96Q91	983 aa		32.77	■■■□□ 2.84
ACER3-211	ENST00000531461	IL13	P35225	146 aa		32.76	■■■□□ 2.83
ACER3-211	ENST00000531461	RC3H1	Q5TC82	1133 aa	Known RBP	32.76	■■■□□ 2.83
ACER3-211	ENST00000531461	KIF7	Q2M1P5	1343 aa		32.75	■■■□□ 2.83
ACER3-211	ENST00000531461	CABP4	P57796	275 aa		32.74	■■■□□ 2.83
ACER3-211	ENST00000531461	MTHFS	P49914	203 aa		32.73	■■■□□ 2.83
ACER3-211	ENST00000531461	C1QTNF8	P60827	252 aa		32.73	■■■□□ 2.83
ACER3-211	ENST00000531461	C1orf141	Q5JVX7	400 aa		32.73	■■■□□ 2.83
ACER3-211	ENST00000531461	SULT6B1	Q6IMI4	303 aa		32.73	■■■□□ 2.83
ACER3-211	ENST00000531461	RTCB	Q9Y3I0	505 aa	Known RBP	32.73	■■■□□ 2.83
ACER3-211	ENST00000531461	CNTNAP4	Q9C0A0	1308 aa		32.73	■■■□□ 2.83
ACER3-211	ENST00000531461	ADRA2B	P18089	450 aa		32.72	■■■□□ 2.83
ACER3-211	ENST00000531461	RBM42	Q9BTD8	480 aa	Known RBP	32.72	■■■□□ 2.83
ACER3-211	ENST00000531461	SCN11A	Q9UI33	1791 aa		32.72	■■■□□ 2.83
ACER3-211	ENST00000531461	KIF13B	Q9NQT8	1826 aa		32.71	■■■□□ 2.83
ACER3-211	ENST00000531461	MYH14	Q7Z406	1995 aa	Known RBP	32.7	■■■□□ 2.83
ACER3-211	ENST00000531461	CIC	Q96RK0	1608 aa	Predicted RBP	32.7	■■■□□ 2.83
ACER3-211	ENST00000531461	TRAPPC3L	Q5T215	181 aa		32.7	■■■□□ 2.83
ACER3-211	ENST00000531461	PER1	O15534	1290 aa	Predicted RBP	32.67	■■■□□ 2.82
ACER3-211	ENST00000531461	NLGN1	Q8N2Q7	840 aa		32.67	■■■□□ 2.82
ACER3-211	ENST00000531461	RPS6KA4	O75676	772 aa		32.66	■■■□□ 2.82
ACER3-211	ENST00000531461	MMP10	P09238	476 aa		32.66	■■■□□ 2.82
ACER3-211	ENST00000531461	NFATC2IP	Q8NCF5	419 aa		32.66	■■■□□ 2.82
ACER3-211	ENST00000531461	GIGYF1	O75420	1035 aa	Predicted RBP	32.65	■■■□□ 2.82
ACER3-211	ENST00000531461	ARHGEF1	Q92888	912 aa	Known RBP	32.65	■■■□□ 2.82
ACER3-211	ENST00000531461	C4A	P0C0L4	1744 aa		32.63	■■■□□ 2.81
ACER3-211	ENST00000531461	AKAP4	Q5JQC9	854 aa		32.63	■■■□□ 2.81
ACER3-211	ENST00000531461	KIAA1551	Q9HCM1	1747 aa		32.62	■■■□□ 2.81
ACER3-211	ENST00000531461	ADCY9	O60503	1353 aa		32.61	■■■□□ 2.81
ACER3-211	ENST00000531461	TJP1	Q07157	1748 aa		32.61	■■■□□ 2.81
ACER3-211	ENST00000531461	VIRMA	Q69YN4	1812 aa	Known RBP	32.61	■■■□□ 2.81
ACER3-211	ENST00000531461	PTCD1	O75127	700 aa	Known RBP	32.6	■■■□□ 2.81
ACER3-211	ENST00000531461	RFC4	P35249	363 aa		32.6	■■■□□ 2.81
ACER3-211	ENST00000531461	GYS1	P13807	737 aa		32.59	■■■□□ 2.81
ACER3-211	ENST00000531461	TGFB2	P61812	414 aa		32.59	■■■□□ 2.81
ACER3-211	ENST00000531461	ATP10D	Q9P241	1426 aa		32.59	■■■□□ 2.81
ACER3-211	ENST00000531461	PXDNL	A1KZ92	1463 aa		32.58	■■■□□ 2.81
ACER3-211	ENST00000531461	MRC1	P22897	1456 aa		32.58	■■■□□ 2.81
ACER3-211	ENST00000531461	C10orf71	Q711Q0	1435 aa		32.58	■■■□□ 2.81
ACER3-211	ENST00000531461	NPC1L1	Q9UHC9	1359 aa		32.58	■■■□□ 2.81
ACER3-211	ENST00000531461	ADAMTS7	Q9UKP4	1686 aa		32.56	■■■□□ 2.8
ACER3-211	ENST00000531461	CRKL	P46109	303 aa	Known RBP	32.56	■■■□□ 2.8
ACER3-211	ENST00000531461	SLC52A2	Q9HAB3	445 aa		32.56	■■■□□ 2.8
ACER3-211	ENST00000531461	SENP3-EIF4A1	A0A087X0R7	540 aa		32.55	■■■□□ 2.8
ACER3-211	ENST00000531461	N4BP2	Q86UW6	1770 aa	Predicted RBP	32.55	■■■□□ 2.8
ACER3-211	ENST00000531461	DIAPH1	O60610	1272 aa	Known RBP	32.53	■■■□□ 2.8
ACER3-211	ENST00000531461	CCDC87	Q9NVE4	849 aa		32.53	■■■□□ 2.8
ACER3-211	ENST00000531461	BRCA1	P38398	1863 aa	Known RBP	32.52	■■■□□ 2.8
ACER3-211	ENST00000531461	RNMT	O43148	476 aa	Known RBP	32.51	■■■□□ 2.79
ACER3-211	ENST00000531461	HMOX1	P09601	288 aa		32.51	■■■□□ 2.79
ACER3-211	ENST00000531461	CC2D1B	Q5T0F9	858 aa	Known RBP	32.51	■■■□□ 2.79
ACER3-211	ENST00000531461	LGR6	Q9HBX8	967 aa		32.51	■■■□□ 2.79
ACER3-211	ENST00000531461	WWC3	Q9ULE0	1092 aa		32.5	■■■□□ 2.79
ACER3-211	ENST00000531461	PARP3	Q9Y6F1	533 aa		32.5	■■■□□ 2.79
ACER3-211	ENST00000531461	USP42	Q9H9J4	1324 aa	Known RBP	32.5	■■■□□ 2.79
ACER3-211	ENST00000531461	MTHFSD	Q2M296	383 aa	Known RBP	32.48	■■■□□ 2.79
ACER3-211	ENST00000531461	INTS5	Q6P9B9	1019 aa	Known RBP	32.48	■■■□□ 2.79
ACER3-211	ENST00000531461	GPBP1L1	Q9HC44	474 aa	Predicted RBP	32.48	■■■□□ 2.79
ACER3-211	ENST00000531461	COL3A1	P02461	1466 aa	Predicted RBP	32.48	■■■□□ 2.79
ACER3-211	ENST00000531461	KCP	Q6ZWJ8	1503 aa		32.46	■■■□□ 2.79
ACER3-211	ENST00000531461		A0A0G2JLW4	131 aa		32.45	■■■□□ 2.79
ACER3-211	ENST00000531461	DNAJC10	Q8IXB1	793 aa		32.44	■■■□□ 2.78
ACER3-211	ENST00000531461	UBR2	Q8IWV8	1755 aa		32.43	■■■□□ 2.78
ACER3-211	ENST00000531461	FKBP8	Q14318	412 aa		32.43	■■■□□ 2.78
ACER3-211	ENST00000531461	VSIG10	Q8N0Z9	540 aa		32.43	■■■□□ 2.78
ACER3-211	ENST00000531461	SRP68	Q9UHB9	627 aa	Known RBP	32.43	■■■□□ 2.78
ACER3-211	ENST00000531461	ARFGEF1	Q9Y6D6	1849 aa		32.42	■■■□□ 2.78
ACER3-211	ENST00000531461	DPEP1	P16444	411 aa		32.42	■■■□□ 2.78
ACER3-211	ENST00000531461	CYP19A1	P11511	503 aa	Predicted RBP	32.41	■■■□□ 2.78
ACER3-211	ENST00000531461	SLC39A6	Q13433	755 aa		32.41	■■■□□ 2.78
ACER3-211	ENST00000531461	BCS1L	Q9Y276	419 aa		32.41	■■■□□ 2.78
ACER3-211	ENST00000531461	SOS1	Q07889	1333 aa	Predicted RBP	32.41	■■■□□ 2.78
ACER3-211	ENST00000531461	KCNA3	P22001	575 aa		32.39	■■■□□ 2.78
ACER3-211	ENST00000531461	TM4SF1	P30408	202 aa		32.38	■■■□□ 2.77
ACER3-211	ENST00000531461	DDR1	Q08345	913 aa		32.38	■■■□□ 2.77
ACER3-211	ENST00000531461	CEP350	Q5VT06	3117 aa		32.37	■■■□□ 2.77
ACER3-211	ENST00000531461	ZPR1	O75312	459 aa		32.36	■■■□□ 2.77
ACER3-211	ENST00000531461	POLRMT	O00411	1230 aa	Known RBP	32.35	■■■□□ 2.77
ACER3-211	ENST00000531461	FCHSD2	O94868	740 aa		32.34	■■■□□ 2.77
ACER3-211	ENST00000531461	GAS2L2	Q8NHY3	880 aa		32.34	■■■□□ 2.77
ACER3-211	ENST00000531461	ZNF526	Q8TF50	670 aa	Predicted RBP	32.34	■■■□□ 2.77
ACER3-211	ENST00000531461	PIM2	Q9P1W9	311 aa		32.34	■■■□□ 2.77
ACER3-211	ENST00000531461	NARF	Q9UHQ1	456 aa		32.34	■■■□□ 2.77
ACER3-211	ENST00000531461	SIPA1L3	O60292	1781 aa	Predicted RBP	32.34	■■■□□ 2.77
ACER3-211	ENST00000531461	COL15A1	P39059	1388 aa		32.33	■■■□□ 2.77

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