RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489475.5

HOXB3-210, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXB3, Length 1,845 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-210ENST00000489475 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP34.28■■■■□ 3.08
HOXB3-210ENST00000489475 CLUAP1Q96AJ1 413 aa34.28■■■■□ 3.08
HOXB3-210ENST00000489475 TRIM27P14373 513 aa34.27■■■■□ 3.08
HOXB3-210ENST00000489475 SLC52A2Q9HAB3 445 aa34.27■■■■□ 3.08
HOXB3-210ENST00000489475 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa34.27■■■■□ 3.08
HOXB3-210ENST00000489475 KDM3BQ7LBC6 1761 aa34.27■■■■□ 3.08
HOXB3-210ENST00000489475 TNNQ9UQP3 1299 aa34.27■■■■□ 3.08
HOXB3-210ENST00000489475 COG6Q9Y2V7 657 aa34.26■■■■□ 3.08
HOXB3-210ENST00000489475 NRAPQ86VF7 1730 aa34.26■■■■□ 3.07
HOXB3-210ENST00000489475 RLBP1P12271 317 aa34.25■■■■□ 3.07
HOXB3-210ENST00000489475 NWD2Q9ULI1 1742 aa34.25■■■■□ 3.07
HOXB3-210ENST00000489475 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP34.25■■■■□ 3.07
HOXB3-210ENST00000489475 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP34.25■■■■□ 3.07
HOXB3-210ENST00000489475 ARHGAP45Q92619 1136 aa34.25■■■■□ 3.07
HOXB3-210ENST00000489475 SLIT2O94813 1529 aa34.25■■■■□ 3.07
HOXB3-210ENST00000489475 HSPA1LP34931 641 aa34.23■■■■□ 3.07
HOXB3-210ENST00000489475 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP34.23■■■■□ 3.07
HOXB3-210ENST00000489475 DISP2A7MBM2 1401 aa34.22■■■■□ 3.07
HOXB3-210ENST00000489475 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa34.22■■■■□ 3.07
HOXB3-210ENST00000489475 KCNQ3O43525 872 aa34.21■■■■□ 3.07
HOXB3-210ENST00000489475 MRC1P22897 1456 aa34.2■■■■□ 3.07
HOXB3-210ENST00000489475 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP34.2■■■■□ 3.07
HOXB3-210ENST00000489475 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa34.2■■■■□ 3.07
HOXB3-210ENST00000489475 CCDC30Q5VVM6 783 aa34.2■■■■□ 3.07
HOXB3-210ENST00000489475 NGLY1Q96IV0 654 aa34.2■■■■□ 3.07
HOXB3-210ENST00000489475 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP34.2■■■■□ 3.07
HOXB3-210ENST00000489475 HOXB7P09629 217 aa34.19■■■■□ 3.06
HOXB3-210ENST00000489475 CABP4P57796 275 aa34.19■■■■□ 3.06
HOXB3-210ENST00000489475 C8orf37Q96NL8 207 aa34.19■■■■□ 3.06
HOXB3-210ENST00000489475 SHANK3Q9BYB0 1731 aa34.19■■■■□ 3.06
HOXB3-210ENST00000489475 STK31Q9BXU1 1019 aa34.18■■■■□ 3.06
HOXB3-210ENST00000489475 CHMP4AQ9BY43 222 aa34.18■■■■□ 3.06
HOXB3-210ENST00000489475 MVPQ14764 893 aaKnown RBP34.18■■■■□ 3.06
HOXB3-210ENST00000489475 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP34.18■■■■□ 3.06
HOXB3-210ENST00000489475 SLC4A2P04920 1241 aa34.17■■■■□ 3.06
HOXB3-210ENST00000489475 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP34.16■■■■□ 3.06
HOXB3-210ENST00000489475 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP34.16■■■■□ 3.06
HOXB3-210ENST00000489475 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa34.16■■■■□ 3.06
HOXB3-210ENST00000489475 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa34.16■■■■□ 3.06
HOXB3-210ENST00000489475 ERVV-2B6SEH9 535 aa34.16■■■■□ 3.06
HOXB3-210ENST00000489475 AAMPQ13685 434 aa34.16■■■■□ 3.06
HOXB3-210ENST00000489475 UNC5CLQ8IV45 518 aa34.16■■■■□ 3.06
HOXB3-210ENST00000489475 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP34.16■■■■□ 3.06
HOXB3-210ENST00000489475 ZNF790Q6PG37 636 aa34.15■■■■□ 3.06
HOXB3-210ENST00000489475 EXOC5O00471 708 aa34.14■■■■□ 3.06
HOXB3-210ENST00000489475 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa34.14■■■■□ 3.06
HOXB3-210ENST00000489475 PTPRCP08575 1304 aa34.12■■■■□ 3.05
HOXB3-210ENST00000489475 WNK3Q9BYP7 1800 aa34.12■■■■□ 3.05
HOXB3-210ENST00000489475 ITPRIPQ8IWB1 547 aa34.12■■■■□ 3.05
HOXB3-210ENST00000489475 LRP6O75581 1613 aa34.12■■■■□ 3.05
HOXB3-210ENST00000489475 TMEM57Q8N5G2 664 aa34.11■■■■□ 3.05
HOXB3-210ENST00000489475 NECTIN2Q92692 538 aa34.11■■■■□ 3.05
HOXB3-210ENST00000489475 HEG1Q9ULI3 1381 aa34.11■■■■□ 3.05
HOXB3-210ENST00000489475 SLC39A6Q13433 755 aa34.11■■■■□ 3.05
HOXB3-210ENST00000489475 DDX19BQ9UMR2 479 aa34.11■■■■□ 3.05
HOXB3-210ENST00000489475 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP34.1■■■■□ 3.05
HOXB3-210ENST00000489475 TTC5Q8N0Z6 440 aa34.09■■■■□ 3.05
HOXB3-210ENST00000489475 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP34.09■■■■□ 3.05
HOXB3-210ENST00000489475 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP34.08■■■■□ 3.05
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HOXB3-210ENST00000489475 ABCC4O15439 1325 aa34.08■■■■□ 3.05
HOXB3-210ENST00000489475 TNS2Q63HR2 1409 aa34.07■■■■□ 3.05
HOXB3-210ENST00000489475 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP34.07■■■■□ 3.04
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HOXB3-210ENST00000489475 CACNA1FO60840 1977 aa34.05■■■■□ 3.04
HOXB3-210ENST00000489475 DDB1Q16531 1140 aa34.04■■■■□ 3.04
HOXB3-210ENST00000489475 G2E3Q7L622 706 aa34.04■■■■□ 3.04
HOXB3-210ENST00000489475 USP21Q9UK80 565 aa34.02■■■■□ 3.04
HOXB3-210ENST00000489475 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP34.02■■■■□ 3.04
HOXB3-210ENST00000489475 FMNL2Q96PY5 1086 aa34.02■■■■□ 3.04
HOXB3-210ENST00000489475 FLIIQ13045 1269 aa34.01■■■■□ 3.03
HOXB3-210ENST00000489475 RGS12O14924 1447 aa34■■■■□ 3.03
HOXB3-210ENST00000489475 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP34■■■■□ 3.03
HOXB3-210ENST00000489475 TMOD3Q9NYL9 352 aa34■■■■□ 3.03
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HOXB3-210ENST00000489475 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa33.98■■■■□ 3.03
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HOXB3-210ENST00000489475 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP33.92■■■■□ 3.02
HOXB3-210ENST00000489475 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP33.92■■■■□ 3.02
HOXB3-210ENST00000489475 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa33.92■■■■□ 3.02
HOXB3-210ENST00000489475 PAPPAQ13219 1627 aa33.91■■■■□ 3.02
HOXB3-210ENST00000489475 C5P01031 1676 aa33.91■■■■□ 3.02
HOXB3-210ENST00000489475 PIGBQ92521 554 aa33.9■■■■□ 3.02
HOXB3-210ENST00000489475 AFF2P51816 1311 aa33.9■■■■□ 3.02
HOXB3-210ENST00000489475 F6X3S4 739 aa33.9■■■■□ 3.02
HOXB3-210ENST00000489475 CCT4P50991 539 aaKnown RBP33.89■■■■□ 3.02
HOXB3-210ENST00000489475 SLC4A10Q6U841 1118 aa33.89■■■■□ 3.02
HOXB3-210ENST00000489475 HYPKQ9NX55 129 aa33.89■■■■□ 3.02
HOXB3-210ENST00000489475 UBR2Q8IWV8 1755 aa33.88■■■■□ 3.01
HOXB3-210ENST00000489475 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP33.88■■■■□ 3.01
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