RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489450.1

RABGGTB-211, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 586 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-211ENST00000489450 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
RABGGTB-211ENST00000489450 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGGTB-211ENST00000489450 ZNF358Q9NW07 568 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGGTB-211ENST00000489450 USTQ9Y2C2 406 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGGTB-211ENST00000489450 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
RABGGTB-211ENST00000489450 A0A1W2PRU2 124 aa6.12□□□□□ -1.43
RABGGTB-211ENST00000489450 INHAP05111 366 aa6.12□□□□□ -1.43
RABGGTB-211ENST00000489450 LCE2CQ5TA81 110 aa6.12□□□□□ -1.43
RABGGTB-211ENST00000489450 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
RABGGTB-211ENST00000489450 SERTAD1Q9UHV2 236 aa6.12□□□□□ -1.43
RABGGTB-211ENST00000489450 MEN1O00255 615 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGGTB-211ENST00000489450 WIPF1O43516 503 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGGTB-211ENST00000489450 BMP1P13497 986 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGGTB-211ENST00000489450 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
RABGGTB-211ENST00000489450 FAM69CQ0P6D2 419 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGGTB-211ENST00000489450 ESCO1Q5FWF5 840 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGGTB-211ENST00000489450 LINC00528Q8N1L1 170 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGGTB-211ENST00000489450 SLAIN2Q9P270 581 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGGTB-211ENST00000489450 WASLO00401 505 aaPredicted RBP6.1□□□□□ -1.43
RABGGTB-211ENST00000489450 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
RABGGTB-211ENST00000489450 CLN3Q13286 438 aa6.1□□□□□ -1.43
RABGGTB-211ENST00000489450 C6orf118Q5T5N4 469 aa6.1□□□□□ -1.43
RABGGTB-211ENST00000489450 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
RABGGTB-211ENST00000489450 CNKSR1Q969H4 720 aa6.1□□□□□ -1.43
RABGGTB-211ENST00000489450 XAGE2Q96GT9 111 aa6.1□□□□□ -1.43
RABGGTB-211ENST00000489450 TRIM47Q96LD4 638 aa6.1□□□□□ -1.43
RABGGTB-211ENST00000489450 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
RABGGTB-211ENST00000489450 M0R2N6 131 aa6.09□□□□□ -1.43
RABGGTB-211ENST00000489450 BMP2P12643 396 aa6.09□□□□□ -1.43
RABGGTB-211ENST00000489450 TLR1Q15399 786 aa6.09□□□□□ -1.43
RABGGTB-211ENST00000489450 SWI5Q1ZZU3 235 aa6.09□□□□□ -1.43
RABGGTB-211ENST00000489450 TRIM46Q7Z4K8 759 aa6.09□□□□□ -1.43
RABGGTB-211ENST00000489450 TNS4Q8IZW8 715 aa6.09□□□□□ -1.43
RABGGTB-211ENST00000489450 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
RABGGTB-211ENST00000489450 HINFPQ9BQA5 517 aa6.09□□□□□ -1.43
RABGGTB-211ENST00000489450 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa6.09□□□□□ -1.43
RABGGTB-211ENST00000489450 TRAIPQ9BWF2 469 aa6.09□□□□□ -1.43
RABGGTB-211ENST00000489450 SENP2Q9HC62 589 aa6.09□□□□□ -1.43
RABGGTB-211ENST00000489450 HRH3Q9Y5N1 445 aa6.09□□□□□ -1.43
RABGGTB-211ENST00000489450 TERTO14746 1132 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
RABGGTB-211ENST00000489450 BACH1O14867 736 aa6.08□□□□□ -1.44
RABGGTB-211ENST00000489450 SPINT1O43278 529 aa6.08□□□□□ -1.44
RABGGTB-211ENST00000489450 PRMT3O60678 531 aa6.08□□□□□ -1.44
RABGGTB-211ENST00000489450 UPP2O95045 317 aa6.08□□□□□ -1.44
RABGGTB-211ENST00000489450 SMTNP53814 917 aa6.08□□□□□ -1.44
RABGGTB-211ENST00000489450 EPHA4P54764 986 aa6.08□□□□□ -1.44
RABGGTB-211ENST00000489450 PDE4CQ08493 712 aa6.08□□□□□ -1.44
RABGGTB-211ENST00000489450 GAS2L2Q8NHY3 880 aa6.08□□□□□ -1.44
RABGGTB-211ENST00000489450 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
RABGGTB-211ENST00000489450 PRIMPOLQ96LW4 560 aa6.08□□□□□ -1.44
RABGGTB-211ENST00000489450 NLRP3Q96P20 1036 aa6.08□□□□□ -1.44
RABGGTB-211ENST00000489450 SLC4A9Q96Q91 983 aa6.08□□□□□ -1.44
RABGGTB-211ENST00000489450 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
RABGGTB-211ENST00000489450 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
RABGGTB-211ENST00000489450 STK17AQ9UEE5 414 aa6.08□□□□□ -1.44
RABGGTB-211ENST00000489450 A6NJY4 79 aa6.07□□□□□ -1.44
RABGGTB-211ENST00000489450 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
RABGGTB-211ENST00000489450 CENPCQ03188 943 aa6.07□□□□□ -1.44
RABGGTB-211ENST00000489450 TBCELQ5QJ74 424 aa6.07□□□□□ -1.44
RABGGTB-211ENST00000489450 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
RABGGTB-211ENST00000489450 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
RABGGTB-211ENST00000489450 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
RABGGTB-211ENST00000489450 USP3Q9Y6I4 520 aa6.07□□□□□ -1.44
RABGGTB-211ENST00000489450 SCARF1Q14162 830 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGGTB-211ENST00000489450 MTFR1Q15390 333 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGGTB-211ENST00000489450 SLC9A9Q8IVB4 645 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGGTB-211ENST00000489450 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
RABGGTB-211ENST00000489450 ATP2B4P23634 1241 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGGTB-211ENST00000489450 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
RABGGTB-211ENST00000489450 FOXK2Q01167 660 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGGTB-211ENST00000489450 OCLNQ16625 522 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGGTB-211ENST00000489450 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
RABGGTB-211ENST00000489450 KIFC2Q96AC6 838 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGGTB-211ENST00000489450 ZFP42Q96MM3 310 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGGTB-211ENST00000489450 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
RABGGTB-211ENST00000489450 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
RABGGTB-211ENST00000489450 C21orf2O43822 256 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGGTB-211ENST00000489450 SSFA2P28290 1259 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGGTB-211ENST00000489450 WEE1P30291 646 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGGTB-211ENST00000489450 GPC1P35052 558 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGGTB-211ENST00000489450 SCNN1AP37088 669 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGGTB-211ENST00000489450 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
RABGGTB-211ENST00000489450 SLC27A3Q5K4L6 730 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGGTB-211ENST00000489450 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGGTB-211ENST00000489450 AEBP1Q8IUX7 1158 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGGTB-211ENST00000489450 RNF217Q8TC41 542 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGGTB-211ENST00000489450 GRIP2Q9C0E4 1043 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGGTB-211ENST00000489450 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
RABGGTB-211ENST00000489450 TTLL8A6PVC2 850 aa6.03□□□□□ -1.44
RABGGTB-211ENST00000489450 CDK2AP1O14519 115 aa6.03□□□□□ -1.44
RABGGTB-211ENST00000489450 IGFBP4P22692 258 aa6.03□□□□□ -1.44
RABGGTB-211ENST00000489450 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
RABGGTB-211ENST00000489450 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
RABGGTB-211ENST00000489450 ATAD2Q6PL18 1390 aa6.03□□□□□ -1.44
RABGGTB-211ENST00000489450 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
RABGGTB-211ENST00000489450 FIGNL2A6NMB9 653 aa6.02□□□□□ -1.45
RABGGTB-211ENST00000489450 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
RABGGTB-211ENST00000489450 BRD1O95696 1058 aa6.02□□□□□ -1.45
RABGGTB-211ENST00000489450 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
RABGGTB-211ENST00000489450 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa6.02□□□□□ -1.45
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