RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485349.5

SKIV2L-211, Transcript of Ski2 like RNA helicase, humanhuman

TSL 2

Gene SKIV2L, Length 734 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2L-211ENST00000485349 MORC1Q86VD1 984 aa23.2■■□□□ 1.3
SKIV2L-211ENST00000485349 SSFA2P28290 1259 aa23.19■■□□□ 1.3
SKIV2L-211ENST00000485349 ATP6V1AP38606 617 aa23.18■■□□□ 1.3
SKIV2L-211ENST00000485349 AEBP1Q8IUX7 1158 aa23.18■■□□□ 1.3
SKIV2L-211ENST00000485349 GNPATO15228 680 aa23.17■■□□□ 1.3
SKIV2L-211ENST00000485349 CD2APQ9Y5K6 639 aa23.17■■□□□ 1.3
SKIV2L-211ENST00000485349 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
SKIV2L-211ENST00000485349 ERVV-2B6SEH9 535 aa23.15■■□□□ 1.3
SKIV2L-211ENST00000485349 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
SKIV2L-211ENST00000485349 DCAF5Q96JK2 942 aa23.15■■□□□ 1.3
SKIV2L-211ENST00000485349 KNSTRNQ9Y448 316 aa23.15■■□□□ 1.3
SKIV2L-211ENST00000485349 GRIN3BO60391 1043 aa23.14■■□□□ 1.29
SKIV2L-211ENST00000485349 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
SKIV2L-211ENST00000485349 SLC4A9Q96Q91 983 aa23.14■■□□□ 1.29
SKIV2L-211ENST00000485349 KIF7Q2M1P5 1343 aa23.13■■□□□ 1.29
SKIV2L-211ENST00000485349 SCN11AQ9UI33 1791 aa23.12■■□□□ 1.29
SKIV2L-211ENST00000485349 C4AP0C0L4 1744 aa23.12■■□□□ 1.29
SKIV2L-211ENST00000485349 AMOTQ4VCS5 1084 aa23.12■■□□□ 1.29
SKIV2L-211ENST00000485349 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
SKIV2L-211ENST00000485349 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
SKIV2L-211ENST00000485349 SULT6B1Q6IMI4 303 aa23.11■■□□□ 1.29
SKIV2L-211ENST00000485349 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
SKIV2L-211ENST00000485349 KIF13BQ9NQT8 1826 aa23.1■■□□□ 1.29
SKIV2L-211ENST00000485349 IL13P35225 146 aa23.1■■□□□ 1.29
SKIV2L-211ENST00000485349 TJP1Q07157 1748 aa23.1■■□□□ 1.29
SKIV2L-211ENST00000485349 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
SKIV2L-211ENST00000485349 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa23.09■■□□□ 1.29
SKIV2L-211ENST00000485349 CABP4P57796 275 aa23.09■■□□□ 1.29
SKIV2L-211ENST00000485349 C1orf141Q5JVX7 400 aa23.09■■□□□ 1.29
SKIV2L-211ENST00000485349 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
SKIV2L-211ENST00000485349 MTHFSP49914 203 aa23.08■■□□□ 1.29
SKIV2L-211ENST00000485349 WWC3Q9ULE0 1092 aa23.08■■□□□ 1.29
SKIV2L-211ENST00000485349 C1QTNF8P60827 252 aa23.07■■□□□ 1.28
SKIV2L-211ENST00000485349 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
SKIV2L-211ENST00000485349 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa23.07■■□□□ 1.28
SKIV2L-211ENST00000485349 MMP10P09238 476 aa23.06■■□□□ 1.28
SKIV2L-211ENST00000485349 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
SKIV2L-211ENST00000485349 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
SKIV2L-211ENST00000485349 TRAPPC3LQ5T215 181 aa23.04■■□□□ 1.28
SKIV2L-211ENST00000485349 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
SKIV2L-211ENST00000485349 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa23.04■■□□□ 1.28
SKIV2L-211ENST00000485349 ATP10DQ9P241 1426 aa23.04■■□□□ 1.28
SKIV2L-211ENST00000485349 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
SKIV2L-211ENST00000485349 PXDNLA1KZ92 1463 aa23.03■■□□□ 1.28
SKIV2L-211ENST00000485349 ADRA2BP18089 450 aa23.02■■□□□ 1.28
SKIV2L-211ENST00000485349 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
SKIV2L-211ENST00000485349 MRC1P22897 1456 aa23.02■■□□□ 1.28
SKIV2L-211ENST00000485349 ADCY9O60503 1353 aa23.01■■□□□ 1.27
SKIV2L-211ENST00000485349 C10orf71Q711Q0 1435 aa23.01■■□□□ 1.27
SKIV2L-211ENST00000485349 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa23.01■■□□□ 1.27
SKIV2L-211ENST00000485349 CEP350Q5VT06 3117 aa23.01■■□□□ 1.27
SKIV2L-211ENST00000485349 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa23■■□□□ 1.27
SKIV2L-211ENST00000485349 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
SKIV2L-211ENST00000485349 RPS6KA4O75676 772 aa23■■□□□ 1.27
SKIV2L-211ENST00000485349 GYS1P13807 737 aa23■■□□□ 1.27
SKIV2L-211ENST00000485349 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
SKIV2L-211ENST00000485349 HMOX1P09601 288 aa22.99■■□□□ 1.27
SKIV2L-211ENST00000485349 AKAP4Q5JQC9 854 aa22.99■■□□□ 1.27
SKIV2L-211ENST00000485349 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
SKIV2L-211ENST00000485349 RFC4P35249 363 aa22.98■■□□□ 1.27
SKIV2L-211ENST00000485349 CRKLP46109 303 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
SKIV2L-211ENST00000485349 NLGN1Q8N2Q7 840 aa22.98■■□□□ 1.27
SKIV2L-211ENST00000485349 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
SKIV2L-211ENST00000485349 KCPQ6ZWJ8 1503 aa22.95■■□□□ 1.26
SKIV2L-211ENST00000485349 SLC52A2Q9HAB3 445 aa22.95■■□□□ 1.26
SKIV2L-211ENST00000485349 LGR6Q9HBX8 967 aa22.95■■□□□ 1.26
SKIV2L-211ENST00000485349 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
SKIV2L-211ENST00000485349 UBR2Q8IWV8 1755 aa22.94■■□□□ 1.26
SKIV2L-211ENST00000485349 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
SKIV2L-211ENST00000485349 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
SKIV2L-211ENST00000485349 A0A0G2JLW4 131 aa22.92■■□□□ 1.26
SKIV2L-211ENST00000485349 RNMTO43148 476 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
SKIV2L-211ENST00000485349 TGFB2P61812 414 aa22.92■■□□□ 1.26
SKIV2L-211ENST00000485349 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
SKIV2L-211ENST00000485349 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
SKIV2L-211ENST00000485349 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
SKIV2L-211ENST00000485349 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
SKIV2L-211ENST00000485349 CCDC87Q9NVE4 849 aa22.92■■□□□ 1.26
SKIV2L-211ENST00000485349 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa22.91■■□□□ 1.26
SKIV2L-211ENST00000485349 SLC39A6Q13433 755 aa22.91■■□□□ 1.26
SKIV2L-211ENST00000485349 DNAJC10Q8IXB1 793 aa22.91■■□□□ 1.26
SKIV2L-211ENST00000485349 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
SKIV2L-211ENST00000485349 PARP3Q9Y6F1 533 aa22.91■■□□□ 1.26
SKIV2L-211ENST00000485349 FKBP8Q14318 412 aa22.9■■□□□ 1.26
SKIV2L-211ENST00000485349 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa22.89■■□□□ 1.26
SKIV2L-211ENST00000485349 DPEP1P16444 411 aa22.89■■□□□ 1.25
SKIV2L-211ENST00000485349 BCS1LQ9Y276 419 aa22.89■■□□□ 1.25
SKIV2L-211ENST00000485349 DDR1Q08345 913 aa22.88■■□□□ 1.25
SKIV2L-211ENST00000485349 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
SKIV2L-211ENST00000485349 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
SKIV2L-211ENST00000485349 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
SKIV2L-211ENST00000485349 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
SKIV2L-211ENST00000485349 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
SKIV2L-211ENST00000485349 COL15A1P39059 1388 aa22.84■■□□□ 1.25
SKIV2L-211ENST00000485349 FCHSD2O94868 740 aa22.83■■□□□ 1.25
SKIV2L-211ENST00000485349 KCNA3P22001 575 aa22.83■■□□□ 1.25
SKIV2L-211ENST00000485349 USPL1Q5W0Q7 1092 aa22.83■■□□□ 1.25
SKIV2L-211ENST00000485349 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa22.83■■□□□ 1.25
SKIV2L-211ENST00000485349 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
SKIV2L-211ENST00000485349 NRXN2Q9P2S2 1712 aa22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69.3 ms