RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470201.5

RABGGTB-207, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 848 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-207ENST00000470201 SEPT3Q9UH03 358 aa7.75□□□□□ -1.17
RABGGTB-207ENST00000470201 SIAH2O43255 324 aa7.74□□□□□ -1.17
RABGGTB-207ENST00000470201 INHAP05111 366 aa7.74□□□□□ -1.17
RABGGTB-207ENST00000470201 SLC19A1P41440 591 aa7.74□□□□□ -1.17
RABGGTB-207ENST00000470201 EPHA4P54764 986 aa7.74□□□□□ -1.17
RABGGTB-207ENST00000470201 NR5A1Q13285 461 aa7.74□□□□□ -1.17
RABGGTB-207ENST00000470201 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP7.74□□□□□ -1.17
RABGGTB-207ENST00000470201 GAS2L2Q8NHY3 880 aa7.74□□□□□ -1.17
RABGGTB-207ENST00000470201 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP7.74□□□□□ -1.17
RABGGTB-207ENST00000470201 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa7.74□□□□□ -1.17
RABGGTB-207ENST00000470201 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP7.74□□□□□ -1.17
RABGGTB-207ENST00000470201 LILRA1O75019 489 aa7.73□□□□□ -1.17
RABGGTB-207ENST00000470201 GNRH1P01148 92 aa7.73□□□□□ -1.17
RABGGTB-207ENST00000470201 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP7.73□□□□□ -1.17
RABGGTB-207ENST00000470201 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP7.73□□□□□ -1.17
RABGGTB-207ENST00000470201 ESCO1Q5FWF5 840 aa7.73□□□□□ -1.17
RABGGTB-207ENST00000470201 LIAT1Q6ZQX7 453 aa7.73□□□□□ -1.17
RABGGTB-207ENST00000470201 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP7.73□□□□□ -1.17
RABGGTB-207ENST00000470201 ETNK1Q9HBU6 452 aa7.73□□□□□ -1.17
RABGGTB-207ENST00000470201 ANO2Q9NQ90 1003 aa7.73□□□□□ -1.17
RABGGTB-207ENST00000470201 WNT7AO00755 349 aa7.72□□□□□ -1.17
RABGGTB-207ENST00000470201 LCE2BO14633 110 aa7.72□□□□□ -1.17
RABGGTB-207ENST00000470201 STAU1O95793 577 aaKnown RBP7.72□□□□□ -1.17
RABGGTB-207ENST00000470201 TNS4Q8IZW8 715 aa7.72□□□□□ -1.17
RABGGTB-207ENST00000470201 HELQQ8TDG4 1101 aa7.72□□□□□ -1.17
RABGGTB-207ENST00000470201 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP7.72□□□□□ -1.17
RABGGTB-207ENST00000470201 SLC4A9Q96Q91 983 aa7.72□□□□□ -1.17
RABGGTB-207ENST00000470201 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa7.72□□□□□ -1.17
RABGGTB-207ENST00000470201 CAPN12Q6ZSI9 719 aa7.71□□□□□ -1.18
RABGGTB-207ENST00000470201 NPAS4Q8IUM7 802 aa7.71□□□□□ -1.18
RABGGTB-207ENST00000470201 VTI1AQ96AJ9 217 aa7.71□□□□□ -1.18
RABGGTB-207ENST00000470201 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP7.71□□□□□ -1.18
RABGGTB-207ENST00000470201 SERTAD1Q9UHV2 236 aa7.71□□□□□ -1.18
RABGGTB-207ENST00000470201 DCTN4Q9UJW0 460 aa7.71□□□□□ -1.18
RABGGTB-207ENST00000470201 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa7.71□□□□□ -1.18
RABGGTB-207ENST00000470201 ATAD2Q6PL18 1390 aa7.71□□□□□ -1.18
RABGGTB-207ENST00000470201 ANKRD33BA6NCL7 494 aa7.7□□□□□ -1.18
RABGGTB-207ENST00000470201 UNCXA6NJT0 531 aa7.7□□□□□ -1.18
RABGGTB-207ENST00000470201 NR3C2P08235 984 aa7.7□□□□□ -1.18
RABGGTB-207ENST00000470201 MAPK1P28482 360 aa7.7□□□□□ -1.18
RABGGTB-207ENST00000470201 ARHGAP4P98171 946 aa7.7□□□□□ -1.18
RABGGTB-207ENST00000470201 FOXK2Q01167 660 aa7.7□□□□□ -1.18
RABGGTB-207ENST00000470201 ECM1Q16610 540 aa7.7□□□□□ -1.18
RABGGTB-207ENST00000470201 SPRYD7Q5W111 196 aa7.7□□□□□ -1.18
RABGGTB-207ENST00000470201 MRGPRX2Q96LB1 330 aa7.7□□□□□ -1.18
RABGGTB-207ENST00000470201 BCL2L13Q9BXK5 485 aa7.7□□□□□ -1.18
RABGGTB-207ENST00000470201 NPR3P17342 541 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGGTB-207ENST00000470201 MTMR3Q13615 1198 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGGTB-207ENST00000470201 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP7.69□□□□□ -1.18
RABGGTB-207ENST00000470201 MTFR1Q15390 333 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGGTB-207ENST00000470201 STAG2Q8N3U4 1231 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGGTB-207ENST00000470201 ASB16Q96NS5 453 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGGTB-207ENST00000470201 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP7.69□□□□□ -1.186e-6■□□□□ 11
RABGGTB-207ENST00000470201 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP7.69□□□□□ -1.18
RABGGTB-207ENST00000470201 A6NJY4 79 aa7.68□□□□□ -1.18
RABGGTB-207ENST00000470201 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP7.68□□□□□ -1.18
RABGGTB-207ENST00000470201 SMTNP53814 917 aa7.68□□□□□ -1.18
RABGGTB-207ENST00000470201 TRIM67Q6ZTA4 783 aa7.68□□□□□ -1.18
RABGGTB-207ENST00000470201 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP7.68□□□□□ -1.18
RABGGTB-207ENST00000470201 SLC9A9Q8IVB4 645 aa7.68□□□□□ -1.18
RABGGTB-207ENST00000470201 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa7.68□□□□□ -1.18
RABGGTB-207ENST00000470201 FAM13AO94988 1023 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGGTB-207ENST00000470201 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP7.67□□□□□ -1.18
RABGGTB-207ENST00000470201 ADD1P35611 737 aaKnown RBP7.67□□□□□ -1.18
RABGGTB-207ENST00000470201 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP7.67□□□□□ -1.18
RABGGTB-207ENST00000470201 ZNF697Q5TEC3 545 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGGTB-207ENST00000470201 C16orf46Q6P387 395 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGGTB-207ENST00000470201 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP7.67□□□□□ -1.18
RABGGTB-207ENST00000470201 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP7.67□□□□□ -1.18
RABGGTB-207ENST00000470201 RAB6BQ9NRW1 208 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGGTB-207ENST00000470201 A0A1W2PRU2 124 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGGTB-207ENST00000470201 IL2RAP01589 272 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGGTB-207ENST00000470201 ADH1AP07327 375 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGGTB-207ENST00000470201 NBPF15Q8N660 670 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGGTB-207ENST00000470201 GIPC2Q8TF65 315 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGGTB-207ENST00000470201 XAGE2Q96GT9 111 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGGTB-207ENST00000470201 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP7.66□□□□□ -1.18
RABGGTB-207ENST00000470201 CHMP3Q9Y3E7 222 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGGTB-207ENST00000470201 NNTQ13423 1086 aa7.65□□□□□ -1.18
RABGGTB-207ENST00000470201 COL19A1Q14993 1142 aa7.65□□□□□ -1.18
RABGGTB-207ENST00000470201 TLR1Q15399 786 aa7.65□□□□□ -1.18
RABGGTB-207ENST00000470201 RGL4Q8IZJ4 473 aa7.65□□□□□ -1.18
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RABGGTB-207ENST00000470201 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa7.65□□□□□ -1.18
RABGGTB-207ENST00000470201 MPSTP25325 297 aa7.64□□□□□ -1.19
RABGGTB-207ENST00000470201 PRR20EP86478 221 aa7.64□□□□□ -1.19
RABGGTB-207ENST00000470201 PRR20CP86479 221 aa7.64□□□□□ -1.19
RABGGTB-207ENST00000470201 PRR20DP86480 221 aa7.64□□□□□ -1.19
RABGGTB-207ENST00000470201 PRR20BP86481 221 aa7.64□□□□□ -1.19
RABGGTB-207ENST00000470201 PRR20AP86496 221 aa7.64□□□□□ -1.19
RABGGTB-207ENST00000470201 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP7.64□□□□□ -1.19
RABGGTB-207ENST00000470201 TBCELQ5QJ74 424 aa7.64□□□□□ -1.19
RABGGTB-207ENST00000470201 POTEAQ6S8J7 498 aa7.64□□□□□ -1.19
RABGGTB-207ENST00000470201 CNKSR1Q969H4 720 aa7.64□□□□□ -1.19
RABGGTB-207ENST00000470201 SAP130Q9H0E3 1048 aa7.64□□□□□ -1.19
RABGGTB-207ENST00000470201 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP7.64□□□□□ -1.19
RABGGTB-207ENST00000470201 HRH3Q9Y5N1 445 aa7.64□□□□□ -1.19
RABGGTB-207ENST00000470201 WASF2Q9Y6W5 498 aa7.64□□□□□ -1.19
RABGGTB-207ENST00000470201 CDK2AP1O14519 115 aa7.63□□□□□ -1.19
RABGGTB-207ENST00000470201 NDUFB5O43674 189 aa7.63□□□□□ -1.19
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