RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384109.1

RNU6-1029P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1029, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1029P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1029P-201ENST00000384109 USP17L12C9JPN9 530 aa6.27□□□□□ -1.41
RNU6-1029P-201ENST00000384109 USP17L11C9JVI0 530 aa6.27□□□□□ -1.41
RNU6-1029P-201ENST00000384109 USP17L21D6R901 530 aa6.27□□□□□ -1.41
RNU6-1029P-201ENST00000384109 USP17L18D6R9N7 530 aa6.27□□□□□ -1.41
RNU6-1029P-201ENST00000384109 USP17L22D6RA61 530 aa6.27□□□□□ -1.41
RNU6-1029P-201ENST00000384109 USP17L17D6RBQ6 530 aa6.27□□□□□ -1.41
RNU6-1029P-201ENST00000384109 USP17L19D6RCP7 530 aa6.27□□□□□ -1.41
RNU6-1029P-201ENST00000384109 USP17L20D6RJB6 530 aa6.27□□□□□ -1.41
RNU6-1029P-201ENST00000384109 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
RNU6-1029P-201ENST00000384109 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
RNU6-1029P-201ENST00000384109 USP17L24Q0WX57 530 aa6.27□□□□□ -1.41
RNU6-1029P-201ENST00000384109 TLR1Q15399 786 aa6.27□□□□□ -1.41
RNU6-1029P-201ENST00000384109 CCDC102BQ68D86 513 aa6.27□□□□□ -1.41
RNU6-1029P-201ENST00000384109 TPCN2Q8NHX9 752 aa6.27□□□□□ -1.41
RNU6-1029P-201ENST00000384109 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
RNU6-1029P-201ENST00000384109 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
RNU6-1029P-201ENST00000384109 GRIP2Q9C0E4 1043 aa6.27□□□□□ -1.41
RNU6-1029P-201ENST00000384109 KIAA1024Q9UPX6 916 aa6.27□□□□□ -1.41
RNU6-1029P-201ENST00000384109 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP6.26□□□□□ -1.41
RNU6-1029P-201ENST00000384109 SLC4A9Q96Q91 983 aa6.26□□□□□ -1.41
RNU6-1029P-201ENST00000384109 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
RNU6-1029P-201ENST00000384109 ZNF358Q9NW07 568 aa6.26□□□□□ -1.41
RNU6-1029P-201ENST00000384109 SERTAD1Q9UHV2 236 aa6.26□□□□□ -1.41
RNU6-1029P-201ENST00000384109 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa6.25□□□□□ -1.41
RNU6-1029P-201ENST00000384109 M0R2N6 131 aa6.25□□□□□ -1.41
RNU6-1029P-201ENST00000384109 SMTNP53814 917 aa6.25□□□□□ -1.41
RNU6-1029P-201ENST00000384109 PTK7Q13308 1070 aa6.25□□□□□ -1.41
RNU6-1029P-201ENST00000384109 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
RNU6-1029P-201ENST00000384109 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
RNU6-1029P-201ENST00000384109 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa6.25□□□□□ -1.41
RNU6-1029P-201ENST00000384109 PBXIP1Q96AQ6 731 aa6.25□□□□□ -1.41
RNU6-1029P-201ENST00000384109 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
RNU6-1029P-201ENST00000384109 A6NJY4 79 aa6.24□□□□□ -1.41
RNU6-1029P-201ENST00000384109 SEC13P55735 322 aa6.24□□□□□ -1.41
RNU6-1029P-201ENST00000384109 PTSQ03393 145 aa6.24□□□□□ -1.41
RNU6-1029P-201ENST00000384109 MTFR1Q15390 333 aa6.24□□□□□ -1.41
RNU6-1029P-201ENST00000384109 CDCA8Q53HL2 280 aa6.24□□□□□ -1.41
RNU6-1029P-201ENST00000384109 WDR44Q5JSH3 913 aa6.24□□□□□ -1.41
RNU6-1029P-201ENST00000384109 GNASQ5JWF2 1037 aa6.24□□□□□ -1.41
RNU6-1029P-201ENST00000384109 TAS1R3Q7RTX0 852 aa6.24□□□□□ -1.41
RNU6-1029P-201ENST00000384109 ANKMY2Q8IV38 441 aa6.24□□□□□ -1.41
RNU6-1029P-201ENST00000384109 NBPF15Q8N660 670 aa6.24□□□□□ -1.41
RNU6-1029P-201ENST00000384109 RHBDD1Q8TEB9 315 aa6.24□□□□□ -1.41
RNU6-1029P-201ENST00000384109 DKK1O94907 266 aa6.23□□□□□ -1.41
RNU6-1029P-201ENST00000384109 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
RNU6-1029P-201ENST00000384109 POU4F2Q12837 409 aa6.23□□□□□ -1.41
RNU6-1029P-201ENST00000384109 DPYDQ12882 1025 aa6.23□□□□□ -1.41
RNU6-1029P-201ENST00000384109 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
RNU6-1029P-201ENST00000384109 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
RNU6-1029P-201ENST00000384109 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
RNU6-1029P-201ENST00000384109 SLC35F4A4IF30 521 aa6.22□□□□□ -1.41
RNU6-1029P-201ENST00000384109 SFI1A8K8P3 1242 aa6.22□□□□□ -1.41
RNU6-1029P-201ENST00000384109 CDK2AP1O14519 115 aa6.22□□□□□ -1.41
RNU6-1029P-201ENST00000384109 ATG7O95352 703 aa6.22□□□□□ -1.41
RNU6-1029P-201ENST00000384109 RHOQP17081 205 aa6.22□□□□□ -1.41
RNU6-1029P-201ENST00000384109 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
RNU6-1029P-201ENST00000384109 NPAS3Q8IXF0 933 aa6.22□□□□□ -1.41
RNU6-1029P-201ENST00000384109 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
RNU6-1029P-201ENST00000384109 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
RNU6-1029P-201ENST00000384109 EPHA4P54764 986 aa6.21□□□□□ -1.42
RNU6-1029P-201ENST00000384109 C4orf17Q53FE4 359 aa6.21□□□□□ -1.42
RNU6-1029P-201ENST00000384109 CCDC155Q8N6L0 562 aa6.21□□□□□ -1.42
RNU6-1029P-201ENST00000384109 FAM200AQ8TCP9 573 aa6.21□□□□□ -1.42
RNU6-1029P-201ENST00000384109 ARXQ96QS3 562 aa6.21□□□□□ -1.42
RNU6-1029P-201ENST00000384109 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
RNU6-1029P-201ENST00000384109 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
RNU6-1029P-201ENST00000384109 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa6.2□□□□□ -1.42
RNU6-1029P-201ENST00000384109 TERTO14746 1132 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
RNU6-1029P-201ENST00000384109 PPFIA3O75145 1194 aa6.2□□□□□ -1.42
RNU6-1029P-201ENST00000384109 FOXK2Q01167 660 aa6.2□□□□□ -1.42
RNU6-1029P-201ENST00000384109 TNS4Q8IZW8 715 aa6.2□□□□□ -1.42
RNU6-1029P-201ENST00000384109 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
RNU6-1029P-201ENST00000384109 ARID3AQ99856 593 aa6.2□□□□□ -1.42
RNU6-1029P-201ENST00000384109 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa6.2□□□□□ -1.42
RNU6-1029P-201ENST00000384109 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
RNU6-1029P-201ENST00000384109 DYRK1BQ9Y463 629 aa6.2□□□□□ -1.42
RNU6-1029P-201ENST00000384109 A0A1B0GTH6 734 aa6.19□□□□□ -1.42
RNU6-1029P-201ENST00000384109 PHKA2P46019 1235 aa6.19□□□□□ -1.42
RNU6-1029P-201ENST00000384109 PLA2G4AP47712 749 aa6.19□□□□□ -1.42
RNU6-1029P-201ENST00000384109 SLC9A9Q8IVB4 645 aa6.19□□□□□ -1.42
RNU6-1029P-201ENST00000384109 SLC16A10Q8TF71 515 aa6.19□□□□□ -1.42
RNU6-1029P-201ENST00000384109 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
RNU6-1029P-201ENST00000384109 HINFPQ9BQA5 517 aa6.19□□□□□ -1.42
RNU6-1029P-201ENST00000384109 CABP1Q9NZU7 370 aa6.19□□□□□ -1.42
RNU6-1029P-201ENST00000384109 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa6.19□□□□□ -1.42
RNU6-1029P-201ENST00000384109 CHMP3Q9Y3E7 222 aa6.19□□□□□ -1.42
RNU6-1029P-201ENST00000384109 H3BM21 787 aa6.18□□□□□ -1.42
RNU6-1029P-201ENST00000384109 ITGA6P23229 1130 aa6.18□□□□□ -1.42
RNU6-1029P-201ENST00000384109 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
RNU6-1029P-201ENST00000384109 USP3Q9Y6I4 520 aa6.18□□□□□ -1.42
RNU6-1029P-201ENST00000384109 VEGFBP49765 207 aa6.17□□□□□ -1.42
RNU6-1029P-201ENST00000384109 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
RNU6-1029P-201ENST00000384109 TEAD4Q15561 434 aa6.17□□□□□ -1.42
RNU6-1029P-201ENST00000384109 SWI5Q1ZZU3 235 aa6.17□□□□□ -1.42
RNU6-1029P-201ENST00000384109 NBPF1Q3BBV0 1214 aa6.17□□□□□ -1.42
RNU6-1029P-201ENST00000384109 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa6.17□□□□□ -1.42
RNU6-1029P-201ENST00000384109 GAS2L2Q8NHY3 880 aa6.17□□□□□ -1.42
RNU6-1029P-201ENST00000384109 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP6.17□□□□□ -1.42
RNU6-1029P-201ENST00000384109 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
RNU6-1029P-201ENST00000384109 H7C1W4 665 aa6.16□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.7 ms