RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348962.6

PTPRO-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type O, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRO, Length 5,061 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRO-202ENST00000348962 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP18.21■□□□□ 0.51
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PTPRO-202ENST00000348962 NAPBQ9H115 298 aa18.21■□□□□ 0.51
PTPRO-202ENST00000348962 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP18.21■□□□□ 0.51
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PTPRO-202ENST00000348962 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa18.19■□□□□ 0.5
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PTPRO-202ENST00000348962 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP18.17■□□□□ 0.5
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PTPRO-202ENST00000348962 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP18.16■□□□□ 0.5
PTPRO-202ENST00000348962 FBXO3Q9UK99 471 aa18.16■□□□□ 0.5
PTPRO-202ENST00000348962 CCP110O43303 1012 aa18.16■□□□□ 0.5
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PTPRO-202ENST00000348962 SETQ01105 290 aaPredicted RBP18.16■□□□□ 0.5
PTPRO-202ENST00000348962 PIBF1Q8WXW3 757 aa18.16■□□□□ 0.5
PTPRO-202ENST00000348962 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP18.15■□□□□ 0.5
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PTPRO-202ENST00000348962 HSP90B2PQ58FF3 399 aa18.15■□□□□ 0.5
PTPRO-202ENST00000348962 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa18.15■□□□□ 0.5
PTPRO-202ENST00000348962 TSPY26PQ9H489 355 aa18.15■□□□□ 0.5
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PTPRO-202ENST00000348962 TNMDQ9H2S6 317 aa18.14■□□□□ 0.5
PTPRO-202ENST00000348962 TEX35Q5T0J7 233 aa18.14■□□□□ 0.49
PTPRO-202ENST00000348962 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa18.14■□□□□ 0.49
PTPRO-202ENST00000348962 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP18.14■□□□□ 0.49
PTPRO-202ENST00000348962 WDR78Q5VTH9 848 aa18.14■□□□□ 0.49
PTPRO-202ENST00000348962 PPFIBP1Q86W92 1011 aa18.14■□□□□ 0.49
PTPRO-202ENST00000348962 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP18.14■□□□□ 0.49
PTPRO-202ENST00000348962 F6X3S4 739 aa18.13■□□□□ 0.49
PTPRO-202ENST00000348962 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP18.13■□□□□ 0.49
PTPRO-202ENST00000348962 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP18.13■□□□□ 0.49
PTPRO-202ENST00000348962 PTPRCP08575 1304 aa18.13■□□□□ 0.49
PTPRO-202ENST00000348962 DEF6Q9H4E7 631 aa18.13■□□□□ 0.49
PTPRO-202ENST00000348962 ST5P78524 1137 aa18.13■□□□□ 0.49
PTPRO-202ENST00000348962 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP18.13■□□□□ 0.49
PTPRO-202ENST00000348962 SPATA32Q96LK8 384 aa18.13■□□□□ 0.49
PTPRO-202ENST00000348962 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP18.12■□□□□ 0.49
PTPRO-202ENST00000348962 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP18.12■□□□□ 0.49
PTPRO-202ENST00000348962 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP18.12■□□□□ 0.49
PTPRO-202ENST00000348962 CCDC96Q2M329 555 aa18.12■□□□□ 0.49
PTPRO-202ENST00000348962 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP18.12■□□□□ 0.49
PTPRO-202ENST00000348962 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP18.12■□□□□ 0.49
PTPRO-202ENST00000348962 DESP17661 470 aa18.12■□□□□ 0.49
PTPRO-202ENST00000348962 RARSP54136 660 aaKnown RBP18.12■□□□□ 0.49
PTPRO-202ENST00000348962 CEP57L1Q8IYX8 460 aa18.12■□□□□ 0.49
PTPRO-202ENST00000348962 NBPF6Q5VWK0 638 aa18.12■□□□□ 0.49
PTPRO-202ENST00000348962 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP18.12■□□□□ 0.49
PTPRO-202ENST00000348962 NBPF4Q96M43 638 aa18.12■□□□□ 0.49
PTPRO-202ENST00000348962 BAG3O95817 575 aa18.11■□□□□ 0.49
PTPRO-202ENST00000348962 CASTP20810 708 aaKnown RBP18.11■□□□□ 0.49
PTPRO-202ENST00000348962 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP18.11■□□□□ 0.49
PTPRO-202ENST00000348962 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP18.11■□□□□ 0.49
PTPRO-202ENST00000348962 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP18.11■□□□□ 0.49
PTPRO-202ENST00000348962 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP18.11■□□□□ 0.49
PTPRO-202ENST00000348962 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP18.11■□□□□ 0.49
PTPRO-202ENST00000348962 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP18.11■□□□□ 0.49
PTPRO-202ENST00000348962 CUL5Q93034 780 aa18.11■□□□□ 0.49
PTPRO-202ENST00000348962 PTPN23Q9H3S7 1636 aa18.1■□□□□ 0.49
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