RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000255198.2

ZBED3-201, Transcript of zinc finger BED-type containing 3, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZBED3, Length 6,172 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3-201ENST00000255198 TSG101Q99816 390 aa23.88■■□□□ 1.41
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ZBED3-201ENST00000255198 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP23.88■■□□□ 1.41
ZBED3-201ENST00000255198 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa23.88■■□□□ 1.41
ZBED3-201ENST00000255198 SYCE3A1L190 88 aa23.87■■□□□ 1.41
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ZBED3-201ENST00000255198 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa23.86■■□□□ 1.41
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ZBED3-201ENST00000255198 MYD88Q99836 296 aa23.85■■□□□ 1.41
ZBED3-201ENST00000255198 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP23.85■■□□□ 1.41
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ZBED3-201ENST00000255198 BOLA2Q9H3K6 86 aa23.84■■□□□ 1.41
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ZBED3-201ENST00000255198 ZNF287Q9HBT7 754 aa23.83■■□□□ 1.41
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ZBED3-201ENST00000255198 CPLX3Q8WVH0 158 aa23.82■■□□□ 1.4
ZBED3-201ENST00000255198 NAPBQ9H115 298 aa23.82■■□□□ 1.4
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ZBED3-201ENST00000255198 SCAPERQ9BY12 1400 aa23.81■■□□□ 1.4
ZBED3-201ENST00000255198 WDR63Q8IWG1 891 aa23.81■■□□□ 1.4
ZBED3-201ENST00000255198 MCM10Q7L590 875 aa23.81■■□□□ 1.4
ZBED3-201ENST00000255198 TMOD3Q9NYL9 352 aa23.81■■□□□ 1.4
ZBED3-201ENST00000255198 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP23.81■■□□□ 1.4
ZBED3-201ENST00000255198 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP23.8■■□□□ 1.4
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ZBED3-201ENST00000255198 CCDC150Q8NCX0 1101 aa23.8■■□□□ 1.4
ZBED3-201ENST00000255198 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP23.8■■□□□ 1.4
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ZBED3-201ENST00000255198 TMEM57Q8N5G2 664 aa23.8■■□□□ 1.4
ZBED3-201ENST00000255198 AKAP2Q9Y2D5 859 aa23.8■■□□□ 1.4
ZBED3-201ENST00000255198 ZNF652Q9Y2D9 606 aa23.8■■□□□ 1.4
ZBED3-201ENST00000255198 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP23.8■■□□□ 1.4
ZBED3-201ENST00000255198 STAMBPO95630 424 aa23.79■■□□□ 1.4
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ZBED3-201ENST00000255198 SHTN1A0MZ66 631 aa23.78■■□□□ 1.4
ZBED3-201ENST00000255198 ANKLE2Q86XL3 938 aa23.78■■□□□ 1.4
ZBED3-201ENST00000255198 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa23.77■■□□□ 1.4
ZBED3-201ENST00000255198 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP23.77■■□□□ 1.4
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ZBED3-201ENST00000255198 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP23.77■■□□□ 1.4
ZBED3-201ENST00000255198 USP8P40818 1118 aa23.77■■□□□ 1.4
ZBED3-201ENST00000255198 SLC12A7Q9Y666 1083 aa23.77■■□□□ 1.4
ZBED3-201ENST00000255198 URI1O94763 535 aaPredicted RBP23.76■■□□□ 1.39
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ZBED3-201ENST00000255198 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP23.76■■□□□ 1.39
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ZBED3-201ENST00000255198 TMEM266Q2M3C6 531 aa23.76■■□□□ 1.39
ZBED3-201ENST00000255198 DUSP27Q5VZP5 1158 aa23.76■■□□□ 1.39
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ZBED3-201ENST00000255198 C8orf76Q96K31 380 aa23.76■■□□□ 1.39
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ZBED3-201ENST00000255198 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa23.76■■□□□ 1.39
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ZBED3-201ENST00000255198 DRC1Q96MC2 740 aa23.74■■□□□ 1.39
ZBED3-201ENST00000255198 ADAMTS2O95450 1211 aa23.74■■□□□ 1.39
ZBED3-201ENST00000255198 BACH2Q9BYV9 841 aa23.74■■□□□ 1.39
ZBED3-201ENST00000255198 VAT1LQ9HCJ6 419 aa23.74■■□□□ 1.39
ZBED3-201ENST00000255198 KIF1BPQ96EK5 621 aa23.74■■□□□ 1.39
ZBED3-201ENST00000255198 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP23.74■■□□□ 1.39
ZBED3-201ENST00000255198 CA8P35219 290 aa23.74■■□□□ 1.39
ZBED3-201ENST00000255198 CCT2P78371 535 aaKnown RBP23.74■■□□□ 1.39
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