RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000220325.8

EHD4-201, Transcript of EH domain containing 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene EHD4, Length 6,416 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD4-201ENST00000220325 NAPBQ9H115 298 aa16.69■□□□□ 0.26
EHD4-201ENST00000220325 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP16.69■□□□□ 0.26
EHD4-201ENST00000220325 MBD3O95983 291 aa16.69■□□□□ 0.26
EHD4-201ENST00000220325 CCDC181Q5TID7 509 aa16.69■□□□□ 0.26
EHD4-201ENST00000220325 A0A087WZG4 1122 aa16.68■□□□□ 0.26
EHD4-201ENST00000220325 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa16.68■□□□□ 0.26
EHD4-201ENST00000220325 ACBD3Q9H3P7 528 aa16.68■□□□□ 0.26
EHD4-201ENST00000220325 CTNNA3Q9UI47 895 aa16.68■□□□□ 0.26
EHD4-201ENST00000220325 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa16.68■□□□□ 0.26
EHD4-201ENST00000220325 FAM83GA6ND36 823 aa16.68■□□□□ 0.26
EHD4-201ENST00000220325 DNAJC5BQ9UF47 199 aa16.68■□□□□ 0.26
EHD4-201ENST00000220325 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
EHD4-201ENST00000220325 NEBLO76041 1014 aa16.68■□□□□ 0.26
EHD4-201ENST00000220325 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
EHD4-201ENST00000220325 H0YHG0 523 aa16.67■□□□□ 0.26
EHD4-201ENST00000220325 CCDC192P0DO97 292 aa16.67■□□□□ 0.26
EHD4-201ENST00000220325 CCT2P78371 535 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
EHD4-201ENST00000220325 MAP7D2Q96T17 732 aa16.67■□□□□ 0.26
EHD4-201ENST00000220325 TAF3Q5VWG9 929 aa16.67■□□□□ 0.26
EHD4-201ENST00000220325 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
EHD4-201ENST00000220325 C20orf194Q5TEA3 1177 aa16.67■□□□□ 0.26
EHD4-201ENST00000220325 KRT28Q7Z3Y7 464 aa16.67■□□□□ 0.26
EHD4-201ENST00000220325 F8W031 263 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
EHD4-201ENST00000220325 AAMPQ13685 434 aa16.67■□□□□ 0.26
EHD4-201ENST00000220325 SSH1Q8WYL5 1049 aa16.66■□□□□ 0.26
EHD4-201ENST00000220325 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP16.66■□□□□ 0.26
EHD4-201ENST00000220325 HAND2P61296 217 aa16.66■□□□□ 0.26
EHD4-201ENST00000220325 CEP57L1Q8IYX8 460 aa16.66■□□□□ 0.26
EHD4-201ENST00000220325 PLCD4Q9BRC7 762 aa16.66■□□□□ 0.26
EHD4-201ENST00000220325 KAT6BQ8WYB5 2073 aa16.66■□□□□ 0.26
EHD4-201ENST00000220325 EIF5P55010 431 aaKnown RBP16.66■□□□□ 0.26
EHD4-201ENST00000220325 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP16.66■□□□□ 0.26
EHD4-201ENST00000220325 POGZQ7Z3K3 1410 aa16.65■□□□□ 0.26
EHD4-201ENST00000220325 TSPYL1Q9H0U9 437 aa16.65■□□□□ 0.26
EHD4-201ENST00000220325 AEBP1Q8IUX7 1158 aa16.65■□□□□ 0.26
EHD4-201ENST00000220325 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP16.65■□□□□ 0.26
EHD4-201ENST00000220325 CDKL5O76039 1030 aa16.65■□□□□ 0.26
EHD4-201ENST00000220325 PANK2Q9BZ23 570 aa16.65■□□□□ 0.26
EHD4-201ENST00000220325 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP16.64■□□□□ 0.25
EHD4-201ENST00000220325 MX1P20591 662 aa16.64■□□□□ 0.25
EHD4-201ENST00000220325 ATAD2Q6PL18 1390 aa16.64■□□□□ 0.25
EHD4-201ENST00000220325 TTC16Q8NEE8 873 aa16.64■□□□□ 0.25
EHD4-201ENST00000220325 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP16.64■□□□□ 0.25
EHD4-201ENST00000220325 FEZ1Q99689 392 aa16.64■□□□□ 0.25
EHD4-201ENST00000220325 TMX1Q9H3N1 280 aa16.64■□□□□ 0.25
EHD4-201ENST00000220325 HFM1A2PYH4 1435 aa16.64■□□□□ 0.25
EHD4-201ENST00000220325 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP16.64■□□□□ 0.25
EHD4-201ENST00000220325 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa16.63■□□□□ 0.25
EHD4-201ENST00000220325 TNNT1P13805 278 aa16.63■□□□□ 0.25
EHD4-201ENST00000220325 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa16.63■□□□□ 0.25
EHD4-201ENST00000220325 IDI1Q13907 227 aa16.63■□□□□ 0.25
EHD4-201ENST00000220325 KIF1BPQ96EK5 621 aa16.63■□□□□ 0.25
EHD4-201ENST00000220325 SPDYE4A6NLX3 237 aa16.63■□□□□ 0.25
EHD4-201ENST00000220325 MYO6Q9UM54 1294 aa16.63■□□□□ 0.25
EHD4-201ENST00000220325 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
EHD4-201ENST00000220325 GOLIM4O00461 696 aa16.62■□□□□ 0.25
EHD4-201ENST00000220325 CABLES1Q8TDN4 633 aa16.62■□□□□ 0.25
EHD4-201ENST00000220325 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa16.62■□□□□ 0.25
EHD4-201ENST00000220325 AKAP2Q9Y2D5 859 aa16.62■□□□□ 0.25
EHD4-201ENST00000220325 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP16.62■□□□□ 0.25
EHD4-201ENST00000220325 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa16.62■□□□□ 0.25
EHD4-201ENST00000220325 C8orf37Q96NL8 207 aa16.62■□□□□ 0.25
EHD4-201ENST00000220325 NUP62CLQ9H1M0 184 aa16.61■□□□□ 0.25
EHD4-201ENST00000220325 ARHGEF11O15085 1522 aa16.61■□□□□ 0.25
EHD4-201ENST00000220325 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa16.61■□□□□ 0.25
EHD4-201ENST00000220325 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa16.61■□□□□ 0.25
EHD4-201ENST00000220325 RFC4P35249 363 aa16.61■□□□□ 0.25
EHD4-201ENST00000220325 MAP3K12Q12852 859 aa16.61■□□□□ 0.25
EHD4-201ENST00000220325 CFAP100Q494V2 611 aa16.61■□□□□ 0.25
EHD4-201ENST00000220325 DNAAF4Q8WXU2 420 aa16.61■□□□□ 0.25
EHD4-201ENST00000220325 UBAP1LF5GYI3 381 aa16.6■□□□□ 0.25
EHD4-201ENST00000220325 SLC5A1P13866 664 aa16.6■□□□□ 0.25
EHD4-201ENST00000220325 SLC39A6Q13433 755 aa16.6■□□□□ 0.25
EHD4-201ENST00000220325 ISM2Q6H9L7 571 aa16.6■□□□□ 0.25
EHD4-201ENST00000220325 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP16.6■□□□□ 0.25
EHD4-201ENST00000220325 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP16.6■□□□□ 0.25
EHD4-201ENST00000220325 MACROD2A1Z1Q3 448 aa16.6■□□□□ 0.25
EHD4-201ENST00000220325 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
EHD4-201ENST00000220325 DACH1Q9UI36 760 aa16.6■□□□□ 0.25
EHD4-201ENST00000220325 SYCE3A1L190 88 aa16.59■□□□□ 0.25
EHD4-201ENST00000220325 SLFN5Q08AF3 891 aa16.59■□□□□ 0.25
EHD4-201ENST00000220325 KIAA1328Q86T90 577 aa16.59■□□□□ 0.25
EHD4-201ENST00000220325 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP16.59■□□□□ 0.25
EHD4-201ENST00000220325 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP16.59■□□□□ 0.25
EHD4-201ENST00000220325 ZNF213O14771 459 aa16.59■□□□□ 0.25
EHD4-201ENST00000220325 CPLX3Q8WVH0 158 aa16.59■□□□□ 0.25
EHD4-201ENST00000220325 TMEM87AQ8NBN3 555 aa16.59■□□□□ 0.25
EHD4-201ENST00000220325 PSMD1Q99460 953 aa16.59■□□□□ 0.25
EHD4-201ENST00000220325 CFAP45Q9UL16 551 aa16.59■□□□□ 0.25
EHD4-201ENST00000220325 GDPD2Q9HCC8 539 aa16.58■□□□□ 0.25
EHD4-201ENST00000220325 CD109Q6YHK3 1445 aa16.58■□□□□ 0.25
EHD4-201ENST00000220325 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.24
EHD4-201ENST00000220325 CA8P35219 290 aa16.58■□□□□ 0.24
EHD4-201ENST00000220325 SLC12A7Q9Y666 1083 aa16.58■□□□□ 0.24
EHD4-201ENST00000220325 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.24
EHD4-201ENST00000220325 PPP6R1Q9UPN7 881 aa16.58■□□□□ 0.24
EHD4-201ENST00000220325 WASLO00401 505 aaPredicted RBP16.58■□□□□ 0.24
EHD4-201ENST00000220325 RAB11FIP3O75154 756 aa16.58■□□□□ 0.24
EHD4-201ENST00000220325 KRT32Q14532 448 aa16.58■□□□□ 0.24
EHD4-201ENST00000220325 WDR70Q9NW82 654 aa16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.5 ms