RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000216840.10

RABGGTA-201, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTA, Length 2,088 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-201ENST00000216840 NHSL1Q5SYE7 1610 aa21.71■■□□□ 1.07
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RABGGTA-201ENST00000216840 LNPKQ9C0E8 428 aa21.62■■□□□ 1.05
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RABGGTA-201ENST00000216840 DCTPP1Q9H773 170 aa21.6■■□□□ 1.05
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RABGGTA-201ENST00000216840 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa21.48■■□□□ 1.03
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RABGGTA-201ENST00000216840 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
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RABGGTA-201ENST00000216840 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP21.46■■□□□ 1.03
RABGGTA-201ENST00000216840 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
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RABGGTA-201ENST00000216840 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa21.46■■□□□ 1.03
RABGGTA-201ENST00000216840 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
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