RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000007264.6

RPUSD1-201, Transcript of RNA pseudouridylate synthase domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene RPUSD1, Length 2,050 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD1-201ENST00000007264 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP30.13■■■□□ 2.41
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RPUSD1-201ENST00000007264 CHMP4AQ9BY43 222 aa30.11■■■□□ 2.41
RPUSD1-201ENST00000007264 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa30.1■■■□□ 2.41
RPUSD1-201ENST00000007264 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP30.1■■■□□ 2.41
RPUSD1-201ENST00000007264 SLC4A10Q6U841 1118 aa30.1■■■□□ 2.41
RPUSD1-201ENST00000007264 CCT4P50991 539 aaKnown RBP30.09■■■□□ 2.41
RPUSD1-201ENST00000007264 FLIIQ13045 1269 aa30.09■■■□□ 2.41
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RPUSD1-201ENST00000007264 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP30.08■■■□□ 2.41
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RPUSD1-201ENST00000007264 F6X3S4 739 aa30.07■■■□□ 2.4
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RPUSD1-201ENST00000007264 SIRT2Q8IXJ6 389 aa30.05■■■□□ 2.4
RPUSD1-201ENST00000007264 CHD1LQ86WJ1 897 aa30.04■■■□□ 2.4
RPUSD1-201ENST00000007264 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP30.04■■■□□ 2.4
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RPUSD1-201ENST00000007264 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP30.02■■■□□ 2.4
RPUSD1-201ENST00000007264 ANKRD45Q5TZF3 282 aa30.02■■■□□ 2.4
RPUSD1-201ENST00000007264 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP30.02■■■□□ 2.4
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RPUSD1-201ENST00000007264 LNPKQ9C0E8 428 aa30.02■■■□□ 2.4
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RPUSD1-201ENST00000007264 ATP10DQ9P241 1426 aa29.98■■■□□ 2.39
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RPUSD1-201ENST00000007264 PXDNLA1KZ92 1463 aa29.96■■■□□ 2.39
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RPUSD1-201ENST00000007264 PKD1L3Q7Z443 1732 aa29.95■■■□□ 2.38
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RPUSD1-201ENST00000007264 SLC52A2Q9HAB3 445 aa29.93■■■□□ 2.38
RPUSD1-201ENST00000007264 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP29.93■■■□□ 2.38
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RPUSD1-201ENST00000007264 HMMRO75330 724 aa29.92■■■□□ 2.38
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RPUSD1-201ENST00000007264 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP29.91■■■□□ 2.38
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RPUSD1-201ENST00000007264 PROSER3Q2NL68 480 aa29.76■■■□□ 2.36
RPUSD1-201ENST00000007264 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP29.76■■■□□ 2.36
RPUSD1-201ENST00000007264 ADCY9O60503 1353 aa29.76■■■□□ 2.35
RPUSD1-201ENST00000007264 BEND3Q5T5X7 828 aa29.76■■■□□ 2.35
RPUSD1-201ENST00000007264 ATP8B2P98198 1209 aa29.75■■■□□ 2.35
RPUSD1-201ENST00000007264 DDX58O95786 925 aaKnown RBP29.75■■■□□ 2.35
RPUSD1-201ENST00000007264 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP29.75■■■□□ 2.35
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