Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2A5

Ate1, Arginyl-tRNA--protein transferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ate1Q9Z2A5 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC39.45■■■■□ 3.91
Ate1Q9Z2A5 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Ate1Q9Z2A5 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Ate1Q9Z2A5 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
Ate1Q9Z2A5 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
Ate1Q9Z2A5 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
Ate1Q9Z2A5 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Ate1Q9Z2A5 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Ate1Q9Z2A5 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Ate1Q9Z2A5 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
Ate1Q9Z2A5 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Ate1Q9Z2A5 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Ate1Q9Z2A5 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Ate1Q9Z2A5 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Ate1Q9Z2A5 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC32■■■□□ 2.71
Ate1Q9Z2A5 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
Ate1Q9Z2A5 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC31.76■■■□□ 2.67
Ate1Q9Z2A5 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC31.71■■■□□ 2.67
Ate1Q9Z2A5 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
Ate1Q9Z2A5 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Ate1Q9Z2A5 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
Ate1Q9Z2A5 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Ate1Q9Z2A5 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
Ate1Q9Z2A5 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Ate1Q9Z2A5 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Ate1Q9Z2A5 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Ate1Q9Z2A5 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
Ate1Q9Z2A5 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
Ate1Q9Z2A5 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
Ate1Q9Z2A5 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Ate1Q9Z2A5 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Ate1Q9Z2A5 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Ate1Q9Z2A5 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
Ate1Q9Z2A5 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Ate1Q9Z2A5 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Ate1Q9Z2A5 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Ate1Q9Z2A5 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Ate1Q9Z2A5 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Ate1Q9Z2A5 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Ate1Q9Z2A5 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Ate1Q9Z2A5 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Ate1Q9Z2A5 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
Ate1Q9Z2A5 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
Ate1Q9Z2A5 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Ate1Q9Z2A5 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
Ate1Q9Z2A5 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Ate1Q9Z2A5 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
Ate1Q9Z2A5 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Ate1Q9Z2A5 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Ate1Q9Z2A5 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Ate1Q9Z2A5 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
Ate1Q9Z2A5 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Ate1Q9Z2A5 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ate1Q9Z2A5 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Ate1Q9Z2A5 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Ate1Q9Z2A5 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
Ate1Q9Z2A5 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Ate1Q9Z2A5 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ate1Q9Z2A5 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ate1Q9Z2A5 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ate1Q9Z2A5 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ate1Q9Z2A5 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ate1Q9Z2A5 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Ate1Q9Z2A5 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ate1Q9Z2A5 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ate1Q9Z2A5 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ate1Q9Z2A5 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ate1Q9Z2A5 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Ate1Q9Z2A5 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ate1Q9Z2A5 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ate1Q9Z2A5 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ate1Q9Z2A5 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ate1Q9Z2A5 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Ate1Q9Z2A5 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ate1Q9Z2A5 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ate1Q9Z2A5 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ate1Q9Z2A5 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ate1Q9Z2A5 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ate1Q9Z2A5 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ate1Q9Z2A5 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ate1Q9Z2A5 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ate1Q9Z2A5 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ate1Q9Z2A5 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ate1Q9Z2A5 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ate1Q9Z2A5 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ate1Q9Z2A5 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ate1Q9Z2A5 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ate1Q9Z2A5 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ate1Q9Z2A5 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ate1Q9Z2A5 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ate1Q9Z2A5 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ate1Q9Z2A5 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ate1Q9Z2A5 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ate1Q9Z2A5 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Ate1Q9Z2A5 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ate1Q9Z2A5 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ate1Q9Z2A5 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ate1Q9Z2A5 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ate1Q9Z2A5 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Ate1Q9Z2A5 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113.3 ms