Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUM3

Coro1b, Coronin-1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Coro1bQ9WUM3 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC38.86■■■■□ 3.81
Coro1bQ9WUM3 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Coro1bQ9WUM3 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Coro1bQ9WUM3 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
Coro1bQ9WUM3 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
Coro1bQ9WUM3 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
Coro1bQ9WUM3 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Coro1bQ9WUM3 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
Coro1bQ9WUM3 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Coro1bQ9WUM3 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Coro1bQ9WUM3 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Coro1bQ9WUM3 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
Coro1bQ9WUM3 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Coro1bQ9WUM3 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Coro1bQ9WUM3 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Coro1bQ9WUM3 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
Coro1bQ9WUM3 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Coro1bQ9WUM3 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC31.31■■■□□ 2.6
Coro1bQ9WUM3 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC31.25■■■□□ 2.59
Coro1bQ9WUM3 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Coro1bQ9WUM3 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
Coro1bQ9WUM3 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
Coro1bQ9WUM3 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Coro1bQ9WUM3 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Coro1bQ9WUM3 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Coro1bQ9WUM3 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Coro1bQ9WUM3 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Coro1bQ9WUM3 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Coro1bQ9WUM3 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Coro1bQ9WUM3 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Coro1bQ9WUM3 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
Coro1bQ9WUM3 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
Coro1bQ9WUM3 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Coro1bQ9WUM3 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
Coro1bQ9WUM3 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Coro1bQ9WUM3 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
Coro1bQ9WUM3 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Coro1bQ9WUM3 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Coro1bQ9WUM3 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Coro1bQ9WUM3 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Coro1bQ9WUM3 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Coro1bQ9WUM3 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Coro1bQ9WUM3 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Coro1bQ9WUM3 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Coro1bQ9WUM3 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
Coro1bQ9WUM3 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Coro1bQ9WUM3 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Coro1bQ9WUM3 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Coro1bQ9WUM3 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Coro1bQ9WUM3 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Coro1bQ9WUM3 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
Coro1bQ9WUM3 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Coro1bQ9WUM3 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Coro1bQ9WUM3 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Coro1bQ9WUM3 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Coro1bQ9WUM3 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Coro1bQ9WUM3 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Coro1bQ9WUM3 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Coro1bQ9WUM3 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Coro1bQ9WUM3 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Coro1bQ9WUM3 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Coro1bQ9WUM3 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Coro1bQ9WUM3 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Coro1bQ9WUM3 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Coro1bQ9WUM3 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Coro1bQ9WUM3 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Coro1bQ9WUM3 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Coro1bQ9WUM3 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Coro1bQ9WUM3 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Coro1bQ9WUM3 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Coro1bQ9WUM3 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Coro1bQ9WUM3 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Coro1bQ9WUM3 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Coro1bQ9WUM3 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Coro1bQ9WUM3 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Coro1bQ9WUM3 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Coro1bQ9WUM3 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Coro1bQ9WUM3 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Coro1bQ9WUM3 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Coro1bQ9WUM3 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Coro1bQ9WUM3 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Coro1bQ9WUM3 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Coro1bQ9WUM3 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Coro1bQ9WUM3 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Coro1bQ9WUM3 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Coro1bQ9WUM3 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Coro1bQ9WUM3 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Coro1bQ9WUM3 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Coro1bQ9WUM3 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Coro1bQ9WUM3 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Coro1bQ9WUM3 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Coro1bQ9WUM3 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Coro1bQ9WUM3 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Coro1bQ9WUM3 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Coro1bQ9WUM3 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Coro1bQ9WUM3 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Coro1bQ9WUM3 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Coro1bQ9WUM3 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Coro1bQ9WUM3 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Coro1bQ9WUM3 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms