Protein–RNA interactions for Protein: Q9D262

9230110F15Rik, MCG126068, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9230110F15RikQ9D262 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
9230110F15RikQ9D262 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
9230110F15RikQ9D262 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
9230110F15RikQ9D262 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
9230110F15RikQ9D262 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
9230110F15RikQ9D262 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
9230110F15RikQ9D262 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
9230110F15RikQ9D262 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
9230110F15RikQ9D262 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
9230110F15RikQ9D262 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
9230110F15RikQ9D262 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
9230110F15RikQ9D262 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
9230110F15RikQ9D262 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
9230110F15RikQ9D262 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
9230110F15RikQ9D262 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
9230110F15RikQ9D262 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
9230110F15RikQ9D262 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
9230110F15RikQ9D262 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
9230110F15RikQ9D262 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
9230110F15RikQ9D262 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27.51■■■□□ 2
9230110F15RikQ9D262 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
9230110F15RikQ9D262 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
9230110F15RikQ9D262 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
9230110F15RikQ9D262 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
9230110F15RikQ9D262 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27■■□□□ 1.91
9230110F15RikQ9D262 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
9230110F15RikQ9D262 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
9230110F15RikQ9D262 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
9230110F15RikQ9D262 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
9230110F15RikQ9D262 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
9230110F15RikQ9D262 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
9230110F15RikQ9D262 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
9230110F15RikQ9D262 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
9230110F15RikQ9D262 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
9230110F15RikQ9D262 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
9230110F15RikQ9D262 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
9230110F15RikQ9D262 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
9230110F15RikQ9D262 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
9230110F15RikQ9D262 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
9230110F15RikQ9D262 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
9230110F15RikQ9D262 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
9230110F15RikQ9D262 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
9230110F15RikQ9D262 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
9230110F15RikQ9D262 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
9230110F15RikQ9D262 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
9230110F15RikQ9D262 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
9230110F15RikQ9D262 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
9230110F15RikQ9D262 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
9230110F15RikQ9D262 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
9230110F15RikQ9D262 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
9230110F15RikQ9D262 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
9230110F15RikQ9D262 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
9230110F15RikQ9D262 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
9230110F15RikQ9D262 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
9230110F15RikQ9D262 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
9230110F15RikQ9D262 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
9230110F15RikQ9D262 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
9230110F15RikQ9D262 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
9230110F15RikQ9D262 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
9230110F15RikQ9D262 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
9230110F15RikQ9D262 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
9230110F15RikQ9D262 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
9230110F15RikQ9D262 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
9230110F15RikQ9D262 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
9230110F15RikQ9D262 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
9230110F15RikQ9D262 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
9230110F15RikQ9D262 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
9230110F15RikQ9D262 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
9230110F15RikQ9D262 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
9230110F15RikQ9D262 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
9230110F15RikQ9D262 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
9230110F15RikQ9D262 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
9230110F15RikQ9D262 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
9230110F15RikQ9D262 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
9230110F15RikQ9D262 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
9230110F15RikQ9D262 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
9230110F15RikQ9D262 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
9230110F15RikQ9D262 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
9230110F15RikQ9D262 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
9230110F15RikQ9D262 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
9230110F15RikQ9D262 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
9230110F15RikQ9D262 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
9230110F15RikQ9D262 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
9230110F15RikQ9D262 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
9230110F15RikQ9D262 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
9230110F15RikQ9D262 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
9230110F15RikQ9D262 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
9230110F15RikQ9D262 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
9230110F15RikQ9D262 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
9230110F15RikQ9D262 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
9230110F15RikQ9D262 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
9230110F15RikQ9D262 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
9230110F15RikQ9D262 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
9230110F15RikQ9D262 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
9230110F15RikQ9D262 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
9230110F15RikQ9D262 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
9230110F15RikQ9D262 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
9230110F15RikQ9D262 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
9230110F15RikQ9D262 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
9230110F15RikQ9D262 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms