Protein–RNA interactions for Protein: Q99PN3

Trim26, Tripartite motif-containing protein 26, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim26Q99PN3 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC35.83■■■■□ 3.33
Trim26Q99PN3 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Trim26Q99PN3 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Trim26Q99PN3 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
Trim26Q99PN3 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Trim26Q99PN3 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Trim26Q99PN3 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Trim26Q99PN3 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Trim26Q99PN3 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
Trim26Q99PN3 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Trim26Q99PN3 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Trim26Q99PN3 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Trim26Q99PN3 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Trim26Q99PN3 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Trim26Q99PN3 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
Trim26Q99PN3 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC35.52■■■■□ 3.28
Trim26Q99PN3 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Trim26Q99PN3 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Trim26Q99PN3 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
Trim26Q99PN3 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Trim26Q99PN3 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Trim26Q99PN3 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Trim26Q99PN3 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Trim26Q99PN3 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
Trim26Q99PN3 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Trim26Q99PN3 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Trim26Q99PN3 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Trim26Q99PN3 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Trim26Q99PN3 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Trim26Q99PN3 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Trim26Q99PN3 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Trim26Q99PN3 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
Trim26Q99PN3 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
Trim26Q99PN3 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Trim26Q99PN3 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Trim26Q99PN3 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Trim26Q99PN3 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
Trim26Q99PN3 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC35.02■■■■□ 3.2
Trim26Q99PN3 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC35■■■■□ 3.19
Trim26Q99PN3 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
Trim26Q99PN3 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Trim26Q99PN3 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Trim26Q99PN3 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Trim26Q99PN3 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC34.82■■■■□ 3.16
Trim26Q99PN3 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Trim26Q99PN3 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC34.8■■■■□ 3.16
Trim26Q99PN3 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Trim26Q99PN3 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Trim26Q99PN3 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Trim26Q99PN3 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Trim26Q99PN3 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC34.72■■■■□ 3.15
Trim26Q99PN3 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Trim26Q99PN3 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
Trim26Q99PN3 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Trim26Q99PN3 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
Trim26Q99PN3 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Trim26Q99PN3 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
Trim26Q99PN3 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Trim26Q99PN3 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Trim26Q99PN3 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Trim26Q99PN3 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
Trim26Q99PN3 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Trim26Q99PN3 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC34.6■■■■□ 3.13
Trim26Q99PN3 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Trim26Q99PN3 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
Trim26Q99PN3 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Trim26Q99PN3 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Trim26Q99PN3 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.48■■■■□ 3.11
Trim26Q99PN3 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Trim26Q99PN3 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
Trim26Q99PN3 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Trim26Q99PN3 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Trim26Q99PN3 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
Trim26Q99PN3 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC34.32■■■■□ 3.09
Trim26Q99PN3 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Trim26Q99PN3 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Trim26Q99PN3 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC34.24■■■■□ 3.07
Trim26Q99PN3 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Trim26Q99PN3 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC34.23■■■■□ 3.07
Trim26Q99PN3 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC34.2■■■■□ 3.06
Trim26Q99PN3 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Trim26Q99PN3 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
Trim26Q99PN3 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Trim26Q99PN3 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Trim26Q99PN3 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Trim26Q99PN3 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Trim26Q99PN3 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Trim26Q99PN3 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Trim26Q99PN3 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Trim26Q99PN3 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Trim26Q99PN3 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Trim26Q99PN3 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Trim26Q99PN3 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Trim26Q99PN3 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Trim26Q99PN3 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Trim26Q99PN3 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Trim26Q99PN3 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Trim26Q99PN3 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Trim26Q99PN3 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Trim26Q99PN3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms