Protein–RNA interactions for Protein: Q99PN3

Trim26, Tripartite motif-containing protein 26, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim26Q99PN3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Trim26Q99PN3 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Trim26Q99PN3 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Trim26Q99PN3 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Trim26Q99PN3 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Trim26Q99PN3 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Trim26Q99PN3 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Trim26Q99PN3 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Trim26Q99PN3 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Trim26Q99PN3 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
Trim26Q99PN3 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC33.76■■■■□ 3
Trim26Q99PN3 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Trim26Q99PN3 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Trim26Q99PN3 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Trim26Q99PN3 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
Trim26Q99PN3 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Trim26Q99PN3 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Trim26Q99PN3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Trim26Q99PN3 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Trim26Q99PN3 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Trim26Q99PN3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Trim26Q99PN3 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Trim26Q99PN3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Trim26Q99PN3 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
Trim26Q99PN3 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
Trim26Q99PN3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Trim26Q99PN3 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Trim26Q99PN3 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Trim26Q99PN3 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Trim26Q99PN3 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Trim26Q99PN3 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Trim26Q99PN3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Trim26Q99PN3 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Trim26Q99PN3 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Trim26Q99PN3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
Trim26Q99PN3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Trim26Q99PN3 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Trim26Q99PN3 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Trim26Q99PN3 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Trim26Q99PN3 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Trim26Q99PN3 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Trim26Q99PN3 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Trim26Q99PN3 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Trim26Q99PN3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Trim26Q99PN3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Trim26Q99PN3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
Trim26Q99PN3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC33.32■■■□□ 2.92
Trim26Q99PN3 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Trim26Q99PN3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Trim26Q99PN3 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Trim26Q99PN3 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Trim26Q99PN3 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Trim26Q99PN3 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Trim26Q99PN3 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Trim26Q99PN3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
Trim26Q99PN3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Trim26Q99PN3 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Trim26Q99PN3 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Trim26Q99PN3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Trim26Q99PN3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Trim26Q99PN3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Trim26Q99PN3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Trim26Q99PN3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Trim26Q99PN3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Trim26Q99PN3 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Trim26Q99PN3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Trim26Q99PN3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Trim26Q99PN3 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
Trim26Q99PN3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Trim26Q99PN3 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
Trim26Q99PN3 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
Trim26Q99PN3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Trim26Q99PN3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Trim26Q99PN3 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Trim26Q99PN3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Trim26Q99PN3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Trim26Q99PN3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
Trim26Q99PN3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Trim26Q99PN3 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Trim26Q99PN3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Trim26Q99PN3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Trim26Q99PN3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Trim26Q99PN3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Trim26Q99PN3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Trim26Q99PN3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Trim26Q99PN3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Trim26Q99PN3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Trim26Q99PN3 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Trim26Q99PN3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Trim26Q99PN3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Trim26Q99PN3 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Trim26Q99PN3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Trim26Q99PN3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Trim26Q99PN3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Trim26Q99PN3 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
Trim26Q99PN3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Trim26Q99PN3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Trim26Q99PN3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.84■■■□□ 2.85
Trim26Q99PN3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Trim26Q99PN3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms