Protein–RNA interactions for Protein: Q99LF1

Akirin1, Akirin-1, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Akirin1Q99LF1 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC42.81■■■■■ 4.44
Akirin1Q99LF1 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
Akirin1Q99LF1 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
Akirin1Q99LF1 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC37.25■■■■□ 3.55
Akirin1Q99LF1 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC37.11■■■■□ 3.53
Akirin1Q99LF1 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
Akirin1Q99LF1 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Akirin1Q99LF1 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
Akirin1Q99LF1 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Akirin1Q99LF1 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC35.65■■■■□ 3.3
Akirin1Q99LF1 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Akirin1Q99LF1 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Akirin1Q99LF1 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Akirin1Q99LF1 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
Akirin1Q99LF1 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Akirin1Q99LF1 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC34.55■■■■□ 3.12
Akirin1Q99LF1 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
Akirin1Q99LF1 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Akirin1Q99LF1 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC34.34■■■■□ 3.09
Akirin1Q99LF1 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
Akirin1Q99LF1 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Akirin1Q99LF1 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Akirin1Q99LF1 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Akirin1Q99LF1 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
Akirin1Q99LF1 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Akirin1Q99LF1 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC33.82■■■■□ 3
Akirin1Q99LF1 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Akirin1Q99LF1 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
Akirin1Q99LF1 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Akirin1Q99LF1 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Akirin1Q99LF1 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Akirin1Q99LF1 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
Akirin1Q99LF1 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
Akirin1Q99LF1 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Akirin1Q99LF1 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Akirin1Q99LF1 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Akirin1Q99LF1 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Akirin1Q99LF1 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC32.84■■■□□ 2.85
Akirin1Q99LF1 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
Akirin1Q99LF1 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Akirin1Q99LF1 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC32.72■■■□□ 2.83
Akirin1Q99LF1 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Akirin1Q99LF1 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
Akirin1Q99LF1 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
Akirin1Q99LF1 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
Akirin1Q99LF1 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Akirin1Q99LF1 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
Akirin1Q99LF1 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Akirin1Q99LF1 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Akirin1Q99LF1 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Akirin1Q99LF1 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
Akirin1Q99LF1 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
Akirin1Q99LF1 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
Akirin1Q99LF1 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Akirin1Q99LF1 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Akirin1Q99LF1 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
Akirin1Q99LF1 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
Akirin1Q99LF1 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Akirin1Q99LF1 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
Akirin1Q99LF1 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
Akirin1Q99LF1 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC31.76■■■□□ 2.67
Akirin1Q99LF1 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC31.73■■■□□ 2.67
Akirin1Q99LF1 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Akirin1Q99LF1 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
Akirin1Q99LF1 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Akirin1Q99LF1 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Akirin1Q99LF1 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
Akirin1Q99LF1 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Akirin1Q99LF1 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Akirin1Q99LF1 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Akirin1Q99LF1 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.57■■■□□ 2.64
Akirin1Q99LF1 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Akirin1Q99LF1 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Akirin1Q99LF1 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
Akirin1Q99LF1 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Akirin1Q99LF1 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Akirin1Q99LF1 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Akirin1Q99LF1 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
Akirin1Q99LF1 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Akirin1Q99LF1 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Akirin1Q99LF1 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Akirin1Q99LF1 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Akirin1Q99LF1 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Akirin1Q99LF1 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31.13■■■□□ 2.57
Akirin1Q99LF1 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Akirin1Q99LF1 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
Akirin1Q99LF1 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Akirin1Q99LF1 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Akirin1Q99LF1 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
Akirin1Q99LF1 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Akirin1Q99LF1 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Akirin1Q99LF1 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Akirin1Q99LF1 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Akirin1Q99LF1 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Akirin1Q99LF1 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Akirin1Q99LF1 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Akirin1Q99LF1 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Akirin1Q99LF1 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Akirin1Q99LF1 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Akirin1Q99LF1 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms