Protein–RNA interactions for Protein: Q3V2W7

4930518I15Rik, RIKEN cDNA 4930518I15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930518I15RikQ3V2W7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4930518I15RikQ3V2W7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4930518I15RikQ3V2W7 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
4930518I15RikQ3V2W7 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
4930518I15RikQ3V2W7 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4930518I15RikQ3V2W7 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930518I15RikQ3V2W7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930518I15RikQ3V2W7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930518I15RikQ3V2W7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930518I15RikQ3V2W7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930518I15RikQ3V2W7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930518I15RikQ3V2W7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930518I15RikQ3V2W7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930518I15RikQ3V2W7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930518I15RikQ3V2W7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930518I15RikQ3V2W7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930518I15RikQ3V2W7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930518I15RikQ3V2W7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930518I15RikQ3V2W7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4930518I15RikQ3V2W7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930518I15RikQ3V2W7 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
4930518I15RikQ3V2W7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930518I15RikQ3V2W7 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930518I15RikQ3V2W7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930518I15RikQ3V2W7 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930518I15RikQ3V2W7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930518I15RikQ3V2W7 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930518I15RikQ3V2W7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930518I15RikQ3V2W7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930518I15RikQ3V2W7 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930518I15RikQ3V2W7 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930518I15RikQ3V2W7 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930518I15RikQ3V2W7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930518I15RikQ3V2W7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930518I15RikQ3V2W7 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4930518I15RikQ3V2W7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
4930518I15RikQ3V2W7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930518I15RikQ3V2W7 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930518I15RikQ3V2W7 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930518I15RikQ3V2W7 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930518I15RikQ3V2W7 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930518I15RikQ3V2W7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930518I15RikQ3V2W7 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930518I15RikQ3V2W7 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930518I15RikQ3V2W7 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930518I15RikQ3V2W7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930518I15RikQ3V2W7 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930518I15RikQ3V2W7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930518I15RikQ3V2W7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930518I15RikQ3V2W7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930518I15RikQ3V2W7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930518I15RikQ3V2W7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
4930518I15RikQ3V2W7 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930518I15RikQ3V2W7 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930518I15RikQ3V2W7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930518I15RikQ3V2W7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930518I15RikQ3V2W7 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
4930518I15RikQ3V2W7 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
4930518I15RikQ3V2W7 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930518I15RikQ3V2W7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930518I15RikQ3V2W7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4930518I15RikQ3V2W7 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
4930518I15RikQ3V2W7 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930518I15RikQ3V2W7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930518I15RikQ3V2W7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930518I15RikQ3V2W7 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930518I15RikQ3V2W7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930518I15RikQ3V2W7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930518I15RikQ3V2W7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930518I15RikQ3V2W7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930518I15RikQ3V2W7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930518I15RikQ3V2W7 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
4930518I15RikQ3V2W7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
4930518I15RikQ3V2W7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930518I15RikQ3V2W7 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
4930518I15RikQ3V2W7 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930518I15RikQ3V2W7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930518I15RikQ3V2W7 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930518I15RikQ3V2W7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930518I15RikQ3V2W7 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930518I15RikQ3V2W7 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930518I15RikQ3V2W7 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930518I15RikQ3V2W7 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
4930518I15RikQ3V2W7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930518I15RikQ3V2W7 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
4930518I15RikQ3V2W7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930518I15RikQ3V2W7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930518I15RikQ3V2W7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930518I15RikQ3V2W7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930518I15RikQ3V2W7 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930518I15RikQ3V2W7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930518I15RikQ3V2W7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930518I15RikQ3V2W7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930518I15RikQ3V2W7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930518I15RikQ3V2W7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930518I15RikQ3V2W7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930518I15RikQ3V2W7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930518I15RikQ3V2W7 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
4930518I15RikQ3V2W7 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930518I15RikQ3V2W7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms