Protein–RNA interactions for Protein: P97503

Nkx3-2, Homeobox protein Nkx-3.2, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx3-2P97503 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC35.66■■■■□ 3.3
Nkx3-2P97503 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Nkx3-2P97503 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Nkx3-2P97503 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
Nkx3-2P97503 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
Nkx3-2P97503 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Nkx3-2P97503 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
Nkx3-2P97503 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Nkx3-2P97503 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Nkx3-2P97503 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Nkx3-2P97503 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Nkx3-2P97503 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
Nkx3-2P97503 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Nkx3-2P97503 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Nkx3-2P97503 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Nkx3-2P97503 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Nkx3-2P97503 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Nkx3-2P97503 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Nkx3-2P97503 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Nkx3-2P97503 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Nkx3-2P97503 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Nkx3-2P97503 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Nkx3-2P97503 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Nkx3-2P97503 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Nkx3-2P97503 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Nkx3-2P97503 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Nkx3-2P97503 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Nkx3-2P97503 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Nkx3-2P97503 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Nkx3-2P97503 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Nkx3-2P97503 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Nkx3-2P97503 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Nkx3-2P97503 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Nkx3-2P97503 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Nkx3-2P97503 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Nkx3-2P97503 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Nkx3-2P97503 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Nkx3-2P97503 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Nkx3-2P97503 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Nkx3-2P97503 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Nkx3-2P97503 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Nkx3-2P97503 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Nkx3-2P97503 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Nkx3-2P97503 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
Nkx3-2P97503 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Nkx3-2P97503 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Nkx3-2P97503 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Nkx3-2P97503 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Nkx3-2P97503 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Nkx3-2P97503 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Nkx3-2P97503 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Nkx3-2P97503 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Nkx3-2P97503 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Nkx3-2P97503 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Nkx3-2P97503 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Nkx3-2P97503 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Nkx3-2P97503 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Nkx3-2P97503 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Nkx3-2P97503 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Nkx3-2P97503 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Nkx3-2P97503 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Nkx3-2P97503 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Nkx3-2P97503 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Nkx3-2P97503 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Nkx3-2P97503 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Nkx3-2P97503 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Nkx3-2P97503 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Nkx3-2P97503 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Nkx3-2P97503 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Nkx3-2P97503 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Nkx3-2P97503 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Nkx3-2P97503 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Nkx3-2P97503 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Nkx3-2P97503 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Nkx3-2P97503 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Nkx3-2P97503 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Nkx3-2P97503 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Nkx3-2P97503 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Nkx3-2P97503 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Nkx3-2P97503 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Nkx3-2P97503 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Nkx3-2P97503 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Nkx3-2P97503 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Nkx3-2P97503 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Nkx3-2P97503 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Nkx3-2P97503 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Nkx3-2P97503 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Nkx3-2P97503 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Nkx3-2P97503 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Nkx3-2P97503 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Nkx3-2P97503 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Nkx3-2P97503 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Nkx3-2P97503 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Nkx3-2P97503 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Nkx3-2P97503 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Nkx3-2P97503 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Nkx3-2P97503 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Nkx3-2P97503 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Nkx3-2P97503 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Nkx3-2P97503 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms