Protein–RNA interactions for Protein: E9PVD3

Dchs1, Protocadherin-16, mousemouse

Predictions only

Length 3,291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dchs1E9PVD3 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
Dchs1E9PVD3 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Dchs1E9PVD3 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Dchs1E9PVD3 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
Dchs1E9PVD3 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
Dchs1E9PVD3 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Dchs1E9PVD3 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Dchs1E9PVD3 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Dchs1E9PVD3 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
Dchs1E9PVD3 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Dchs1E9PVD3 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC29.51■■■□□ 2.32
Dchs1E9PVD3 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Dchs1E9PVD3 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Dchs1E9PVD3 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Dchs1E9PVD3 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Dchs1E9PVD3 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Dchs1E9PVD3 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Dchs1E9PVD3 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Dchs1E9PVD3 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Dchs1E9PVD3 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Dchs1E9PVD3 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Dchs1E9PVD3 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Dchs1E9PVD3 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Dchs1E9PVD3 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Dchs1E9PVD3 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Dchs1E9PVD3 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Dchs1E9PVD3 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Dchs1E9PVD3 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Dchs1E9PVD3 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Dchs1E9PVD3 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Dchs1E9PVD3 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Dchs1E9PVD3 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Dchs1E9PVD3 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Dchs1E9PVD3 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Dchs1E9PVD3 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Dchs1E9PVD3 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Dchs1E9PVD3 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Dchs1E9PVD3 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Dchs1E9PVD3 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Dchs1E9PVD3 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Dchs1E9PVD3 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Dchs1E9PVD3 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Dchs1E9PVD3 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Dchs1E9PVD3 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Dchs1E9PVD3 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Dchs1E9PVD3 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Dchs1E9PVD3 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Dchs1E9PVD3 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Dchs1E9PVD3 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Dchs1E9PVD3 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Dchs1E9PVD3 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Dchs1E9PVD3 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Dchs1E9PVD3 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Dchs1E9PVD3 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Dchs1E9PVD3 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Dchs1E9PVD3 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Dchs1E9PVD3 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Dchs1E9PVD3 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Dchs1E9PVD3 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Dchs1E9PVD3 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Dchs1E9PVD3 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Dchs1E9PVD3 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Dchs1E9PVD3 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Dchs1E9PVD3 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Dchs1E9PVD3 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Dchs1E9PVD3 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Dchs1E9PVD3 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Dchs1E9PVD3 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Dchs1E9PVD3 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Dchs1E9PVD3 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Dchs1E9PVD3 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Dchs1E9PVD3 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Dchs1E9PVD3 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Dchs1E9PVD3 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Dchs1E9PVD3 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Dchs1E9PVD3 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Dchs1E9PVD3 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Dchs1E9PVD3 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Dchs1E9PVD3 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Dchs1E9PVD3 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Dchs1E9PVD3 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Dchs1E9PVD3 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Dchs1E9PVD3 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Dchs1E9PVD3 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Dchs1E9PVD3 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Dchs1E9PVD3 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Dchs1E9PVD3 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Dchs1E9PVD3 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Dchs1E9PVD3 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Dchs1E9PVD3 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Dchs1E9PVD3 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Dchs1E9PVD3 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Dchs1E9PVD3 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Dchs1E9PVD3 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Dchs1E9PVD3 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Dchs1E9PVD3 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Dchs1E9PVD3 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Dchs1E9PVD3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Dchs1E9PVD3 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Dchs1E9PVD3 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms