Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1F9

Tchh, Trichohyalin, mousemouse

Predictions only

Length 1,599 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TchhA0A0B4J1F9 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.32■■■■■ 4.85
TchhA0A0B4J1F9 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.31■■■■■ 4.84
TchhA0A0B4J1F9 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.27■■■■■ 4.84
TchhA0A0B4J1F9 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.22■■■■■ 4.83
TchhA0A0B4J1F9 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.2■■■■■ 4.83
TchhA0A0B4J1F9 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.16■■■■■ 4.82
TchhA0A0B4J1F9 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.04■■■■■ 4.8
TchhA0A0B4J1F9 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.02■■■■■ 4.8
TchhA0A0B4J1F9 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.01■■■■■ 4.8
TchhA0A0B4J1F9 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.99■■■■■ 4.79
TchhA0A0B4J1F9 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC44.98■■■■■ 4.79
TchhA0A0B4J1F9 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.98■■■■■ 4.79
TchhA0A0B4J1F9 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC44.9■■■■■ 4.78
TchhA0A0B4J1F9 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC44.82■■■■■ 4.77
TchhA0A0B4J1F9 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.78■■■■■ 4.76
TchhA0A0B4J1F9 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44.77■■■■■ 4.76
TchhA0A0B4J1F9 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.67■■■■■ 4.74
TchhA0A0B4J1F9 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.66■■■■■ 4.74
TchhA0A0B4J1F9 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC44.64■■■■■ 4.74
TchhA0A0B4J1F9 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.61■■■■■ 4.73
TchhA0A0B4J1F9 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.6■■■■■ 4.73
TchhA0A0B4J1F9 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.58■■■■■ 4.73
TchhA0A0B4J1F9 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC44.56■■■■■ 4.72
TchhA0A0B4J1F9 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC44.53■■■■■ 4.72
TchhA0A0B4J1F9 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.48■■■■■ 4.71
TchhA0A0B4J1F9 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.48■■■■■ 4.71
TchhA0A0B4J1F9 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC44.45■■■■■ 4.71
TchhA0A0B4J1F9 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC44.44■■■■■ 4.7
TchhA0A0B4J1F9 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC44.4■■■■■ 4.7
TchhA0A0B4J1F9 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC44.39■■■■■ 4.7
TchhA0A0B4J1F9 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC44.35■■■■■ 4.69
TchhA0A0B4J1F9 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC44.35■■■■■ 4.69
TchhA0A0B4J1F9 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC44.33■■■■■ 4.69
TchhA0A0B4J1F9 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC44.3■■■■■ 4.68
TchhA0A0B4J1F9 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC44.3■■■■■ 4.68
TchhA0A0B4J1F9 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.28■■■■■ 4.68
TchhA0A0B4J1F9 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.28■■■■■ 4.68
TchhA0A0B4J1F9 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.2■■■■■ 4.67
TchhA0A0B4J1F9 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC44.17■■■■■ 4.66
TchhA0A0B4J1F9 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.16■■■■■ 4.66
TchhA0A0B4J1F9 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.14■■■■■ 4.66
TchhA0A0B4J1F9 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC44.11■■■■■ 4.65
TchhA0A0B4J1F9 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.11■■■■■ 4.65
TchhA0A0B4J1F9 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC44.09■■■■■ 4.65
TchhA0A0B4J1F9 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC44.08■■■■■ 4.65
TchhA0A0B4J1F9 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.08■■■■■ 4.65
TchhA0A0B4J1F9 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC44.08■■■■■ 4.65
TchhA0A0B4J1F9 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC44.02■■■■■ 4.64
TchhA0A0B4J1F9 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC43.97■■■■■ 4.63
TchhA0A0B4J1F9 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.95■■■■■ 4.63
TchhA0A0B4J1F9 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.94■■■■■ 4.63
TchhA0A0B4J1F9 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC43.94■■■■■ 4.62
TchhA0A0B4J1F9 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.93■■■■■ 4.62
TchhA0A0B4J1F9 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.93■■■■■ 4.62
TchhA0A0B4J1F9 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC43.92■■■■■ 4.62
TchhA0A0B4J1F9 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC43.91■■■■■ 4.62
TchhA0A0B4J1F9 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC43.86■■■■■ 4.61
TchhA0A0B4J1F9 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.84■■■■■ 4.61
TchhA0A0B4J1F9 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC43.82■■■■■ 4.61
TchhA0A0B4J1F9 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC43.82■■■■■ 4.6
TchhA0A0B4J1F9 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.77■■■■■ 4.6
TchhA0A0B4J1F9 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.76■■■■■ 4.6
TchhA0A0B4J1F9 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.7■■■■■ 4.59
TchhA0A0B4J1F9 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.7■■■■■ 4.59
TchhA0A0B4J1F9 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC43.66■■■■■ 4.58
TchhA0A0B4J1F9 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC43.56■■■■■ 4.56
TchhA0A0B4J1F9 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.5■■■■■ 4.55
TchhA0A0B4J1F9 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.49■■■■■ 4.55
TchhA0A0B4J1F9 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.47■■■■■ 4.55
TchhA0A0B4J1F9 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.47■■■■■ 4.55
TchhA0A0B4J1F9 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC43.44■■■■■ 4.54
TchhA0A0B4J1F9 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.42■■■■■ 4.54
TchhA0A0B4J1F9 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC43.41■■■■■ 4.54
TchhA0A0B4J1F9 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC43.41■■■■■ 4.54
TchhA0A0B4J1F9 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC43.36■■■■■ 4.53
TchhA0A0B4J1F9 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC43.32■■■■■ 4.53
TchhA0A0B4J1F9 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.32■■■■■ 4.52
TchhA0A0B4J1F9 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC43.29■■■■■ 4.52
TchhA0A0B4J1F9 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.26■■■■■ 4.52
TchhA0A0B4J1F9 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC43.25■■■■■ 4.51
TchhA0A0B4J1F9 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.24■■■■■ 4.51
TchhA0A0B4J1F9 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.24■■■■■ 4.51
TchhA0A0B4J1F9 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC43.2■■■■■ 4.51
TchhA0A0B4J1F9 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC43.19■■■■■ 4.51
TchhA0A0B4J1F9 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC43.19■■■■■ 4.5
TchhA0A0B4J1F9 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.17■■■■■ 4.5
TchhA0A0B4J1F9 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.15■■■■■ 4.5
TchhA0A0B4J1F9 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.14■■■■■ 4.5
TchhA0A0B4J1F9 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC43.14■■■■■ 4.5
TchhA0A0B4J1F9 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC43.13■■■■■ 4.5
TchhA0A0B4J1F9 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.12■■■■■ 4.49
TchhA0A0B4J1F9 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.11■■■■■ 4.49
TchhA0A0B4J1F9 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC43.09■■■■■ 4.49
TchhA0A0B4J1F9 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC43.07■■■■■ 4.48
TchhA0A0B4J1F9 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC43.07■■■■■ 4.48
TchhA0A0B4J1F9 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.06■■■■■ 4.48
TchhA0A0B4J1F9 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.05■■■■■ 4.48
TchhA0A0B4J1F9 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC42.98■■■■■ 4.47
TchhA0A0B4J1F9 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.97■■■■■ 4.47
TchhA0A0B4J1F9 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC42.96■■■■■ 4.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms