Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q6R5

CRIP3, Cysteine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP3Q6Q6R5 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRIP3Q6Q6R5 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRIP3Q6Q6R5 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRIP3Q6Q6R5 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRIP3Q6Q6R5 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRIP3Q6Q6R5 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRIP3Q6Q6R5 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRIP3Q6Q6R5 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRIP3Q6Q6R5 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRIP3Q6Q6R5 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRIP3Q6Q6R5 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRIP3Q6Q6R5 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRIP3Q6Q6R5 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRIP3Q6Q6R5 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CRIP3Q6Q6R5 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRIP3Q6Q6R5 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRIP3Q6Q6R5 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRIP3Q6Q6R5 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CRIP3Q6Q6R5 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRIP3Q6Q6R5 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRIP3Q6Q6R5 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRIP3Q6Q6R5 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRIP3Q6Q6R5 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRIP3Q6Q6R5 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRIP3Q6Q6R5 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRIP3Q6Q6R5 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRIP3Q6Q6R5 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRIP3Q6Q6R5 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRIP3Q6Q6R5 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRIP3Q6Q6R5 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRIP3Q6Q6R5 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRIP3Q6Q6R5 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRIP3Q6Q6R5 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRIP3Q6Q6R5 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRIP3Q6Q6R5 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRIP3Q6Q6R5 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CRIP3Q6Q6R5 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRIP3Q6Q6R5 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRIP3Q6Q6R5 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRIP3Q6Q6R5 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CRIP3Q6Q6R5 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRIP3Q6Q6R5 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRIP3Q6Q6R5 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CRIP3Q6Q6R5 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CRIP3Q6Q6R5 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRIP3Q6Q6R5 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRIP3Q6Q6R5 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRIP3Q6Q6R5 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRIP3Q6Q6R5 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRIP3Q6Q6R5 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRIP3Q6Q6R5 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRIP3Q6Q6R5 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRIP3Q6Q6R5 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRIP3Q6Q6R5 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CRIP3Q6Q6R5 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRIP3Q6Q6R5 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRIP3Q6Q6R5 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRIP3Q6Q6R5 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRIP3Q6Q6R5 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRIP3Q6Q6R5 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRIP3Q6Q6R5 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRIP3Q6Q6R5 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRIP3Q6Q6R5 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRIP3Q6Q6R5 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CRIP3Q6Q6R5 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRIP3Q6Q6R5 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRIP3Q6Q6R5 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRIP3Q6Q6R5 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRIP3Q6Q6R5 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRIP3Q6Q6R5 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CRIP3Q6Q6R5 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CRIP3Q6Q6R5 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRIP3Q6Q6R5 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRIP3Q6Q6R5 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRIP3Q6Q6R5 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CRIP3Q6Q6R5 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRIP3Q6Q6R5 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRIP3Q6Q6R5 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRIP3Q6Q6R5 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CRIP3Q6Q6R5 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRIP3Q6Q6R5 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRIP3Q6Q6R5 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRIP3Q6Q6R5 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRIP3Q6Q6R5 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRIP3Q6Q6R5 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRIP3Q6Q6R5 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRIP3Q6Q6R5 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRIP3Q6Q6R5 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRIP3Q6Q6R5 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRIP3Q6Q6R5 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRIP3Q6Q6R5 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRIP3Q6Q6R5 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRIP3Q6Q6R5 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CRIP3Q6Q6R5 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRIP3Q6Q6R5 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRIP3Q6Q6R5 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRIP3Q6Q6R5 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CRIP3Q6Q6R5 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CRIP3Q6Q6R5 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRIP3Q6Q6R5 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms