Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 RNU6-279P-201ENST00000391297 101 ntBASIC-2.88□□□□□ -2.87
RDH8Q9NYR8 MIR1255A-201ENST00000408338 113 ntBASIC-2.88□□□□□ -2.87
RDH8Q9NYR8 RNU6-539P-201ENST00000516665 103 ntBASIC-2.88□□□□□ -2.87
RDH8Q9NYR8 RNU6-1169P-201ENST00000363537 103 ntBASIC-2.91□□□□□ -2.88
RDH8Q9NYR8 RNA5SP170-201ENST00000517150 101 ntBASIC-2.91□□□□□ -2.88
RDH8Q9NYR8 RNU6-822P-201ENST00000362707 106 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
RDH8Q9NYR8 RNU6-1044P-201ENST00000384755 107 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
RDH8Q9NYR8 TRGJP-201ENST00000390338 61 ntAPPRIS P1 BASIC-2.92□□□□□ -2.88
RDH8Q9NYR8 RNU6-1298P-201ENST00000362456 101 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
RDH8Q9NYR8 RNU6-987P-201ENST00000384759 104 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
RDH8Q9NYR8 Y_RNA.652-201ENST00000458902 102 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
RDH8Q9NYR8 MIR3938-201ENST00000582157 103 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
RDH8Q9NYR8 RNU6-742P-201ENST00000365289 107 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
RDH8Q9NYR8 RNY4P29-201ENST00000410801 97 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
RDH8Q9NYR8 Y_RNA.663-201ENST00000516043 101 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
RDH8Q9NYR8 Y_RNA.43-201ENST00000362670 111 ntBASIC-2.95□□□□□ -2.88
RDH8Q9NYR8 SNORA26.2-201ENST00000390922 122 ntBASIC-2.95□□□□□ -2.88
RDH8Q9NYR8 RNU6-419P-201ENST00000517030 63 ntBASIC-2.95□□□□□ -2.88
RDH8Q9NYR8 Y_RNA.388-201ENST00000383919 113 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
RDH8Q9NYR8 MIR509-1-201ENST00000385265 94 ntBASIC-2.97□□□□□ -2.88
RDH8Q9NYR8 MIR509-2-201ENST00000390724 91 ntBASIC-2.97□□□□□ -2.88
RDH8Q9NYR8 hsa-mir-4536-1.1-201ENST00000636519 88 ntBASIC-2.97□□□□□ -2.88
RDH8Q9NYR8 MIR4679-1-201ENST00000637619 75 ntBASIC-2.97□□□□□ -2.88
RDH8Q9NYR8 MIR656-201ENST00000385224 78 ntBASIC-3.01□□□□□ -2.89
RDH8Q9NYR8 RNU6-737P-201ENST00000365370 107 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
RDH8Q9NYR8 Y_RNA.382-201ENST00000365672 114 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
RDH8Q9NYR8 AC139453.2-201ENST00000487255 133 ntBASIC-3.03□□□□□ -2.89
RDH8Q9NYR8 RNA5SP106-201ENST00000517274 100 ntBASIC-3.03□□□□□ -2.89
RDH8Q9NYR8 RNA5SP225-201ENST00000410874 135 ntBASIC-3.04□□□□□ -2.9
RDH8Q9NYR8 Y_RNA.511-201ENST00000384514 103 ntBASIC-3.05□□□□□ -2.9
RDH8Q9NYR8 SNORD78.1-201ENST00000390866 65 ntBASIC-3.05□□□□□ -2.9
RDH8Q9NYR8 AC110620.1-201ENST00000416042 228 ntBASIC-3.05□□□□□ -2.9
RDH8Q9NYR8 RNA5SP224-201ENST00000365069 126 ntBASIC-3.06□□□□□ -2.9
RDH8Q9NYR8 Y_RNA.565-201ENST00000384719 101 ntBASIC-3.06□□□□□ -2.9
RDH8Q9NYR8 RNU6-854P-201ENST00000364036 107 ntBASIC-3.07□□□□□ -2.9
RDH8Q9NYR8 Y_RNA.657-201ENST00000515983 102 ntBASIC-3.07□□□□□ -2.9
RDH8Q9NYR8 Y_RNA.137-201ENST00000363455 112 ntBASIC-3.08□□□□□ -2.9
RDH8Q9NYR8 RNU6-1161P-201ENST00000516176 102 ntBASIC-3.09□□□□□ -2.9
RDH8Q9NYR8 RNU6-1255P-201ENST00000363434 112 ntBASIC-3.11□□□□□ -2.91
RDH8Q9NYR8 Y_RNA.260-201ENST00000364628 101 ntBASIC-3.11□□□□□ -2.91
RDH8Q9NYR8 RNY4P10-201ENST00000365571 96 ntBASIC-3.11□□□□□ -2.91
RDH8Q9NYR8 RNU6-1340P-201ENST00000384438 107 ntBASIC-3.11□□□□□ -2.91
RDH8Q9NYR8 Y_RNA.722-201ENST00000517279 114 ntBASIC-3.11□□□□□ -2.91
RDH8Q9NYR8 Y_RNA.206-201ENST00000364136 102 ntBASIC-3.12□□□□□ -2.91
RDH8Q9NYR8 SNORD45C-201ENST00000383893 79 ntBASIC-3.13□□□□□ -2.91
RDH8Q9NYR8 RNU6-776P-201ENST00000364403 104 ntBASIC-3.16□□□□□ -2.92
RDH8Q9NYR8 RNU6-1022P-201ENST00000365049 104 ntBASIC-3.16□□□□□ -2.92
RDH8Q9NYR8 SNORD115-45-201ENST00000391078 81 ntBASIC-3.16□□□□□ -2.92
RDH8Q9NYR8 MIR4317-201ENST00000637586 65 ntBASIC-3.16□□□□□ -2.92
RDH8Q9NYR8 RNU6-836P-201ENST00000362920 107 ntBASIC-3.17□□□□□ -2.92
RDH8Q9NYR8 MIR4662A-201ENST00000637499 67 ntBASIC-3.17□□□□□ -2.92
RDH8Q9NYR8 Y_RNA.386-201ENST00000383913 105 ntBASIC-3.19□□□□□ -2.92
RDH8Q9NYR8 MIR124-1-201ENST00000385275 85 ntBASIC-3.19□□□□□ -2.92
RDH8Q9NYR8 Y_RNA.335-201ENST00000365299 96 ntBASIC-3.2□□□□□ -2.92
RDH8Q9NYR8 MIR548X-201ENST00000580069 75 ntBASIC-3.2□□□□□ -2.92
RDH8Q9NYR8 RNU6-471P-201ENST00000383944 106 ntBASIC-3.23□□□□□ -2.93
RDH8Q9NYR8 MIR1302-4-201ENST00000408701 150 ntBASIC-3.23□□□□□ -2.93
RDH8Q9NYR8 MIR548AH-201ENST00000637109 76 ntBASIC-3.26□□□□□ -2.93
RDH8Q9NYR8 MIR548H4-201ENST00000408689 111 ntBASIC-3.27□□□□□ -2.93
RDH8Q9NYR8 SNORD115.2-201ENST00000391126 59 ntBASIC-3.28□□□□□ -2.93
RDH8Q9NYR8 RNU6-665P-201ENST00000384639 107 ntBASIC-3.3□□□□□ -2.94
RDH8Q9NYR8 RNU6-1312P-201ENST00000362425 108 ntBASIC-3.31□□□□□ -2.94
RDH8Q9NYR8 RNU6-446P-201ENST00000362827 106 ntBASIC-3.31□□□□□ -2.94
RDH8Q9NYR8 RNU6-788P-201ENST00000390967 104 ntBASIC-3.32□□□□□ -2.94
RDH8Q9NYR8 AC114801.3-201ENST00000510231 177 ntBASIC-3.32□□□□□ -2.94
RDH8Q9NYR8 RNU6-1326P-201ENST00000391262 107 ntBASIC-3.38□□□□□ -2.95
RDH8Q9NYR8 Y_RNA.685-201ENST00000516532 108 ntBASIC-3.38□□□□□ -2.95
RDH8Q9NYR8 MIR548AL-201ENST00000578416 97 ntBASIC-3.38□□□□□ -2.95
RDH8Q9NYR8 RNU6-422P-201ENST00000384632 107 ntBASIC-3.4□□□□□ -2.95
RDH8Q9NYR8 MIR545-201ENST00000385085 106 ntBASIC-3.43□□□□□ -2.96
RDH8Q9NYR8 Y_RNA.345-201ENST00000365384 92 ntBASIC-3.44□□□□□ -2.96
RDH8Q9NYR8 SNORD113-4-201ENST00000364802 75 ntBASIC-3.46□□□□□ -2.96
RDH8Q9NYR8 RNU6-1043P-201ENST00000410355 99 ntBASIC-3.46□□□□□ -2.96
RDH8Q9NYR8 RNU6-1204P-201ENST00000363948 107 ntBASIC-3.47□□□□□ -2.96
RDH8Q9NYR8 RNU4-33P-201ENST00000364316 85 ntBASIC-3.49□□□□□ -2.97
RDH8Q9NYR8 Y_RNA.520-201ENST00000384556 102 ntBASIC-3.49□□□□□ -2.97
RDH8Q9NYR8 RNU6-808P-201ENST00000391233 108 ntBASIC-3.49□□□□□ -2.97
RDH8Q9NYR8 RNU6-829P-201ENST00000363700 112 ntBASIC-3.54□□□□□ -2.98
RDH8Q9NYR8 MIR633-201ENST00000384821 98 ntBASIC-3.54□□□□□ -2.98
RDH8Q9NYR8 RNU6-1275P-201ENST00000391087 107 ntBASIC-3.54□□□□□ -2.98
RDH8Q9NYR8 RNU4-85P-201ENST00000364675 123 ntBASIC-3.59□□□□□ -2.98
RDH8Q9NYR8 RNU6-1008P-201ENST00000384160 104 ntBASIC-3.59□□□□□ -2.98
RDH8Q9NYR8 SOX2OT_exon4.1-201ENST00000610449 109 ntBASIC-3.61□□□□□ -2.99
RDH8Q9NYR8 RNU6-59P-201ENST00000384787 107 ntBASIC-3.63□□□□□ -2.99
RDH8Q9NYR8 RNU6-838P-201ENST00000363399 108 ntBASIC-3.67□□□□□ -3
RDH8Q9NYR8 Y_RNA.406-201ENST00000383984 100 ntBASIC-3.67□□□□□ -3
RDH8Q9NYR8 AC079150.2-201ENST00000443733 78 ntBASIC-3.73□□□□□ -3.01
RDH8Q9NYR8 AC125388.1-201ENST00000459631 156 ntBASIC-3.73□□□□□ -3.01
RDH8Q9NYR8 Y_RNA.379-201ENST00000365653 102 ntBASIC-3.74□□□□□ -3.01
RDH8Q9NYR8 TRAJ42-201ENST00000390495 66 ntAPPRIS P1 BASIC-3.77□□□□□ -3.01
RDH8Q9NYR8 RNA5SP449-201ENST00000516871 130 ntBASIC-3.78□□□□□ -3.01
RDH8Q9NYR8 RNU6-986P-201ENST00000363133 102 ntBASIC-3.83□□□□□ -3.02
RDH8Q9NYR8 Y_RNA.165-201ENST00000363721 102 ntBASIC-3.83□□□□□ -3.02
RDH8Q9NYR8 RNY4P13-201ENST00000384284 96 ntBASIC-3.83□□□□□ -3.02
RDH8Q9NYR8 RNU6-638P-201ENST00000516582 104 ntBASIC-3.89□□□□□ -3.03
RDH8Q9NYR8 RNU6-1024P-201ENST00000384199 107 ntBASIC-3.9□□□□□ -3.03
RDH8Q9NYR8 RNU6-627P-201ENST00000364032 102 ntBASIC-3.91□□□□□ -3.04
RDH8Q9NYR8 RNU6-499P-201ENST00000365615 107 ntBASIC-3.92□□□□□ -3.04
RDH8Q9NYR8 MIR363-201ENST00000384840 75 ntBASIC-3.94□□□□□ -3.04
RDH8Q9NYR8 RNU6-1128P-201ENST00000362825 109 ntBASIC-3.96□□□□□ -3.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 217 ms