Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 Y_RNA.320-201ENST00000365144 102 ntBASIC-2.88□□□□□ -2.87
SCN9AQ15858 Y_RNA.43-201ENST00000362670 111 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
SCN9AQ15858 Y_RNA.382-201ENST00000365672 114 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
SCN9AQ15858 MT-TR-201ENST00000387439 65 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
SCN9AQ15858 Y_RNA.81-201ENST00000362997 102 ntBASIC-2.91□□□□□ -2.87
SCN9AQ15858 Y_RNA.369-201ENST00000365568 117 ntBASIC-2.91□□□□□ -2.87
SCN9AQ15858 RNU6-1044P-201ENST00000384755 107 ntBASIC-2.91□□□□□ -2.87
SCN9AQ15858 RNU6-471P-201ENST00000383944 106 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
SCN9AQ15858 MIR5582-201ENST00000579697 68 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
SCN9AQ15858 RNA5SP224-201ENST00000365069 126 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
SCN9AQ15858 SNORD114-13-201ENST00000364377 74 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
SCN9AQ15858 Y_RNA.566-201ENST00000384735 101 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
SCN9AQ15858 Y_RNA.722-201ENST00000517279 114 ntBASIC-2.95□□□□□ -2.88
SCN9AQ15858 RNU6-153P-201ENST00000364422 104 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
SCN9AQ15858 RNU6-857P-201ENST00000515893 110 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
SCN9AQ15858 MIR548AL-201ENST00000578416 97 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
SCN9AQ15858 Y_RNA.657-201ENST00000515983 102 ntBASIC-2.97□□□□□ -2.88
SCN9AQ15858 U6.111-201ENST00000636093 83 ntBASIC-2.97□□□□□ -2.88
SCN9AQ15858 MIR509-1-201ENST00000385265 94 ntBASIC-3□□□□□ -2.89
SCN9AQ15858 MIR509-2-201ENST00000390724 91 ntBASIC-3□□□□□ -2.89
SCN9AQ15858 Y_RNA.63-201ENST00000362841 102 ntBASIC-3□□□□□ -2.89
SCN9AQ15858 RNA5SP106-201ENST00000517274 100 ntBASIC-3□□□□□ -2.89
SCN9AQ15858 MIR548H4-201ENST00000408689 111 ntBASIC-3.01□□□□□ -2.89
SCN9AQ15858 RNY4P10-201ENST00000365571 96 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
SCN9AQ15858 RNU4-33P-201ENST00000364316 85 ntBASIC-3.03□□□□□ -2.89
SCN9AQ15858 RNU6-1255P-201ENST00000363434 112 ntBASIC-3.05□□□□□ -2.9
SCN9AQ15858 SNORD45C-201ENST00000383893 79 ntBASIC-3.06□□□□□ -2.9
SCN9AQ15858 AL359920.1-201ENST00000618332 176 ntBASIC-3.07□□□□□ -2.9
SCN9AQ15858 RNU6-776P-201ENST00000364403 104 ntBASIC-3.07□□□□□ -2.9
SCN9AQ15858 RNU6-1022P-201ENST00000365049 104 ntBASIC-3.07□□□□□ -2.9
SCN9AQ15858 MIR656-201ENST00000385224 78 ntBASIC-3.07□□□□□ -2.9
SCN9AQ15858 Y_RNA.260-201ENST00000364628 101 ntBASIC-3.09□□□□□ -2.9
SCN9AQ15858 RNU6-808P-201ENST00000391233 108 ntBASIC-3.09□□□□□ -2.9
SCN9AQ15858 RNU6-1340P-201ENST00000384438 107 ntBASIC-3.1□□□□□ -2.91
SCN9AQ15858 SNORA26.2-201ENST00000390922 122 ntBASIC-3.1□□□□□ -2.91
SCN9AQ15858 RNU6-1312P-201ENST00000362425 108 ntBASIC-3.11□□□□□ -2.91
SCN9AQ15858 AC139453.2-201ENST00000487255 133 ntBASIC-3.12□□□□□ -2.91
SCN9AQ15858 AC114801.3-201ENST00000510231 177 ntBASIC-3.12□□□□□ -2.91
SCN9AQ15858 RNU6-406P-201ENST00000516470 107 ntBASIC-3.12□□□□□ -2.91
SCN9AQ15858 MIR4662A-201ENST00000637499 67 ntBASIC-3.12□□□□□ -2.91
SCN9AQ15858 SNORD115.2-201ENST00000391126 59 ntBASIC-3.17□□□□□ -2.92
SCN9AQ15858 Y_RNA.388-201ENST00000383919 113 ntBASIC-3.18□□□□□ -2.92
SCN9AQ15858 AL603908.1-201ENST00000406098 201 ntBASIC-3.18□□□□□ -2.92
SCN9AQ15858 RNU6-836P-201ENST00000362920 107 ntBASIC-3.19□□□□□ -2.92
SCN9AQ15858 RNU6-573P-201ENST00000383938 106 ntBASIC-3.19□□□□□ -2.92
SCN9AQ15858 Y_RNA.565-201ENST00000384719 101 ntBASIC-3.19□□□□□ -2.92
SCN9AQ15858 RNY4P29-201ENST00000410801 97 ntBASIC-3.19□□□□□ -2.92
SCN9AQ15858 Y_RNA.663-201ENST00000516043 101 ntBASIC-3.2□□□□□ -2.92
SCN9AQ15858 SNORD78.1-201ENST00000390866 65 ntBASIC-3.21□□□□□ -2.92
SCN9AQ15858 SNORD115-45-201ENST00000391078 81 ntBASIC-3.21□□□□□ -2.92
SCN9AQ15858 SNORD73B-201ENST00000364394 72 ntBASIC-3.21□□□□□ -2.92
SCN9AQ15858 RNU6-737P-201ENST00000365370 107 ntBASIC-3.21□□□□□ -2.92
SCN9AQ15858 Y_RNA.386-201ENST00000383913 105 ntBASIC-3.21□□□□□ -2.92
SCN9AQ15858 Y_RNA.137-201ENST00000363455 112 ntBASIC-3.22□□□□□ -2.93
SCN9AQ15858 RNU6-446P-201ENST00000362827 106 ntBASIC-3.23□□□□□ -2.93
SCN9AQ15858 Y_RNA.335-201ENST00000365299 96 ntBASIC-3.23□□□□□ -2.93
SCN9AQ15858 RNU6-1204P-201ENST00000363948 107 ntBASIC-3.24□□□□□ -2.93
SCN9AQ15858 Y_RNA.345-201ENST00000365384 92 ntBASIC-3.25□□□□□ -2.93
SCN9AQ15858 RNU6-1008P-201ENST00000384160 104 ntBASIC-3.25□□□□□ -2.93
SCN9AQ15858 MIR124-1-201ENST00000385275 85 ntBASIC-3.26□□□□□ -2.93
SCN9AQ15858 RNU6-1298P-201ENST00000362456 101 ntBASIC-3.28□□□□□ -2.93
SCN9AQ15858 RNA5SP225-201ENST00000410874 135 ntBASIC-3.29□□□□□ -2.94
SCN9AQ15858 Y_RNA.379-201ENST00000365653 102 ntBASIC-3.3□□□□□ -2.94
SCN9AQ15858 RNU6-1326P-201ENST00000391262 107 ntBASIC-3.3□□□□□ -2.94
SCN9AQ15858 MIR1302-4-201ENST00000408701 150 ntBASIC-3.3□□□□□ -2.94
SCN9AQ15858 RNU6-665P-201ENST00000384639 107 ntBASIC-3.31□□□□□ -2.94
SCN9AQ15858 RNU6-854P-201ENST00000364036 107 ntBASIC-3.33□□□□□ -2.94
SCN9AQ15858 SNORD113-4-201ENST00000364802 75 ntBASIC-3.33□□□□□ -2.94
SCN9AQ15858 RNU6-1161P-201ENST00000516176 102 ntBASIC-3.33□□□□□ -2.94
SCN9AQ15858 RNA5SP170-201ENST00000517150 101 ntBASIC-3.34□□□□□ -2.94
SCN9AQ15858 RNU6-829P-201ENST00000363700 112 ntBASIC-3.34□□□□□ -2.94
SCN9AQ15858 U2.22-201ENST00000636441 106 ntBASIC-3.38□□□□□ -2.95
SCN9AQ15858 Y_RNA.520-201ENST00000384556 102 ntBASIC-3.4□□□□□ -2.95
SCN9AQ15858 Y_RNA.685-201ENST00000516532 108 ntBASIC-3.41□□□□□ -2.96
SCN9AQ15858 RNU6-422P-201ENST00000384632 107 ntBASIC-3.42□□□□□ -2.96
SCN9AQ15858 MIR633-201ENST00000384821 98 ntBASIC-3.42□□□□□ -2.96
SCN9AQ15858 MIR545-201ENST00000385085 106 ntBASIC-3.42□□□□□ -2.96
SCN9AQ15858 RNU6-788P-201ENST00000390967 104 ntBASIC-3.42□□□□□ -2.96
SCN9AQ15858 RNU6-838P-201ENST00000363399 108 ntBASIC-3.43□□□□□ -2.96
SCN9AQ15858 MIR548AH-201ENST00000637109 76 ntBASIC-3.43□□□□□ -2.96
SCN9AQ15858 Y_RNA.406-201ENST00000383984 100 ntBASIC-3.46□□□□□ -2.96
SCN9AQ15858 RNU6-59P-201ENST00000384787 107 ntBASIC-3.5□□□□□ -2.97
SCN9AQ15858 AC125388.1-201ENST00000459631 156 ntBASIC-3.5□□□□□ -2.97
SCN9AQ15858 RNY4P13-201ENST00000384284 96 ntBASIC-3.54□□□□□ -2.98
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SCN9AQ15858 RNU6-1275P-201ENST00000391087 107 ntBASIC-3.56□□□□□ -2.98
SCN9AQ15858 RNU6-1043P-201ENST00000410355 99 ntBASIC-3.57□□□□□ -2.98
SCN9AQ15858 RNU4-85P-201ENST00000364675 123 ntBASIC-3.58□□□□□ -2.98
SCN9AQ15858 RNU6-753P-201ENST00000363926 107 ntBASIC-3.62□□□□□ -2.99
SCN9AQ15858 MIR363-201ENST00000384840 75 ntBASIC-3.63□□□□□ -2.99
SCN9AQ15858 RNU6-986P-201ENST00000363133 102 ntBASIC-3.65□□□□□ -2.99
SCN9AQ15858 TRAJ42-201ENST00000390495 66 ntAPPRIS P1 BASIC-3.69□□□□□ -3
SCN9AQ15858 hsa-mir-4536-1.1-201ENST00000636519 88 ntBASIC-3.69□□□□□ -3
SCN9AQ15858 RNU6-614P-201ENST00000384369 107 ntBASIC-3.7□□□□□ -3
SCN9AQ15858 U6.59-201ENST00000615686 107 ntBASIC-3.7□□□□□ -3
SCN9AQ15858 RNU6-936P-201ENST00000384005 107 ntBASIC-3.71□□□□□ -3
SCN9AQ15858 AC079150.2-201ENST00000443733 78 ntBASIC-3.71□□□□□ -3
SCN9AQ15858 RNU6-1128P-201ENST00000362825 109 ntBASIC-3.72□□□□□ -3
SCN9AQ15858 RNU6-930P-201ENST00000390938 100 ntBASIC-3.75□□□□□ -3.01
SCN9AQ15858 MIR548F3-201ENST00000408509 87 ntBASIC-3.8□□□□□ -3.02
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